Job Description P23909 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:34 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 447 % Identity 45% Template c1ewrA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:dna mismatch repair protein muts; PDBTitle: crystal structure of taq muts Resolution 3.19 Å

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		130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	L	L	A	A	I	W	Q	D	S	K	G	F	G	Y	A	T	L	D	I	S	S	G	R	F	R	L	S	E	P	A	D	R	E	T	M	A	A	E	L	Q	R	T	N	P	A	E	L	L	Y	A	E	D	F	A	E	M	S	L	I	E	G	R	R	G	L	R	R	R	P	L	W	E	F	E	I	D	T	A
Query Conservation
Alig confidence														.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	N	Y	L	A	A	I	A	T	G	D	G	.	W	G	L	A	F	L	D	V	S	T	G	E	F	K	G	T	V	L	K	S	K	S	A	L	Y	D	E	L	F	R	H	R	P	A	E	V	L	L	A	P	E	L	L	E	N	G	A	F	L	D	E	F	R	K	R	S	E	A	P	F	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											S	S	S	.								T	T	T	T								S												S			S																			T	T							.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		131	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.		.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Q	Q	L	N	L	Q	F	G	T	R	D	L	V	G	F	G	V	E	N	A	P	R	G	L	C	A	A	G	C	L	L	Q	Y	A	K	D	T	Q	R	T	T	L	P	H	I	R	S	I	T	M	E	R	E	Q	D	S	I	I	M	D	A	A	T	R	R	N	L	E	I	T	Q	N	L	A	G	G	A	E	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	P	E	G	E	G	P	L	A	L	R	R	A	R	G	A	L	L	A	Y	A	Q	R	T	Q	G	G	A	L	S	.	L	Q	P	F	R	F	Y	D	P	G	A	F	X	R	L	P	E	A	T	L	R	A	L	E	V	F	E	P	L	R	G	.	.	Q	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S																T	T	T	S	S	S				.									G	G	G	S		B									T	T	S	S	S		S	S	S	.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																																.	.
Template SS confidence
																208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.		.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.			.	270
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	A	S	V	L	D	C	T	V	T	P	M	G	S	R	M	L	K	R	W	L	H	M	P	V	R	D	T	R	V	L	L	E	R	Q	Q	T	I	G	A	L	Q	D	F	T	A	G	L	Q	P	V	L	R	Q	V	G	D	L	E	R	I	L	A	R	L	A	L	R	T	A	R	P	R	D	L	A	R	M	R
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	F	S	V	L	D	E	T	R	T	A	P	G	R	R	L	L	Q	S	W	L	R	H	P	L	L	D	R	G	P	L	E	A	R	L	D	R	V	E	G	F	V	R	E	G	A	L	R	E	G	V	R	R	L	L	Y	E	L	G	R	A	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												S													S																					T															S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	A	F	Q	Q	L	P	E	L	R	A	Q	L	E	T	V	D	S	A	P	V	Q	A	L	R	E	K	M	G	E	F	A	E	L	R	D	L	L	E	R	A	I	I	D	T	P	P	V	L	V	R	D	G	G	V	I	A	S	G	Y	N	E	E	L	D	E	W	R	A	L	A	D	G	A	T	D	Y	L	E	R
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	E	V	R	E	R	E	R	T	G	L	D	T	L	K	V	G	F	N	A	V	H	G	Y	Y	I	Q	I	S	R	G	Q	S	H	L	A	P	I	N	Y	M	R	R	Q	T	L	K	N	A	E	R	Y	I	I	P	E	L	K	E	Y	E	D	K	V	L	T	S	K	G	K	A	L	A	L	E	K	Q	L	Y	E
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	F	D	L	L	L	P	H	L	E	A	L	Q	Q	S	A	S	A	L	A	E	L	D	V	L	V	N	L	A	E	R	A	Y	T	L	N	Y	T	C	P	T	F	I	D	K	P	G	I	R	I	T	E	G	R	H	P	V	V	E	Q	V	L	N	E	P	F	I	A	N	P	L	N	L	S	P	Q	R	R	M
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																								.	.														.	.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																								.	.														.	.												.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	K	D	L	G	A	L	R	E	A	A	R	I	L	A	E	L	D	V	Y	A	A	L	A	E	V	A	V	R	Y	G	Y	V	R	P	R	F	G	D	R	.	.	L	Q	I	R	A	G	R	H	P	V	V	E	R	.	.	R	T	E	F	V	P	N	D	L	E	X	.	.	A	H	E	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																													T	T		B						S	S	.	.													T	.	.	T	S										.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																								.	.														.	.												.	.
Template SS confidence
									347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.			.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.			.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.			410	.	.	.
		610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	I	T	G	P	N	M	G	G	K	S	T	Y	M	R	Q	T	A	L	I	A	L	M	A	Y	I	G	S	Y	V	P	A	Q	K	V	E	I	G	P	I	D	R	I	F	T	R	V	G	A	A	D	D	L	A	S	G	R	S	T	F	M	V	E	M	T	E	T	A	N	I	L	H	N	A	T	E	Y	S	L
Query Conservation
Alig confidence																																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	I	T	G	P	N	X	A	G	K	S	T	F	L	R	Q	T	A	L	I	A	L	L	A	Q	V	G	S	F	V	P	A	E	E	A	H	L	P	L	F	D	G	I	Y	T	R	I	G	A	.	.	.	.	.	.	G	K	S	T	F	X	V	E	X	E	E	V	A	L	I	L	K	E	A	T	E	N	S	L
Template Known Secondary structure						S		S	S	S	S																		T			B	S	S	S								S	B								.	.	.	.	.	.																	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		579	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.							.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
		690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	M	D	E	I	G	R	G	T	S	T	Y	D	G	L	S	L	A	W	A	C	A	E	N	L	A	N	K	I	K	A	L	T	L	F	A	T	H	Y	F	E	L	T	Q	L	P	E	K	M	E	G	V	A	N	V	H	L	D	A	L	E	H	G	D	T	I	A	F	M	H	S	V	Q	D	G	A	A	S	K
Query Conservation
Alig confidence																															.																		.	.
Template Conservation																															.																		.	.
Template Sequence		V	L	L	D	E	V	G	R	G	T	S	S	L	D	G	V	A	I	A	T	A	V	A	E	A	L	H	E	R	.	R	A	Y	T	L	F	A	T	H	Y	F	E	L	T	A	L	G	.	.	L	P	R	L	K	N	L	H	V	A	A	R	E	E	A	G	G	L	V	F	Y	H	Q	V	L	P	G	P	A	S	K
Template Known Secondary structure						S		S		S	S																				.	T								S						S			.	.		T	T												S	S	S										S			S	S
Template Predicted Secondary structure																															.																		.	.
Template SS confidence
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.		.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.			.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.
		770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	G	L	A	V	A	A	L	A	G	V	P	K	E	V	I	K	R	A	R	Q	K	L	R	E	L	E	S	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	G	V	E	V	A	A	X	A	G	L	P	K	E	V	V	A	R	A	R	A	L	L	Q	A	X	A	A	R
Template Known Secondary structure												T																		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		736	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.