![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | ||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | R | I | T | I | Y | T | R | . | . | . | . | . | N | D | C | V | Q | C | H | A | T | K | R | A | M | E | N | R | G | F | D | F | E | M | I | N | V | D | R | V | P | E | A | A | E | A | L | . | R | A | Q | G | F | R | Q | L | P | V | V | I | A | G | D | L | S | W | S | G | F | R | P | D | M | I | N | R | L | H | P | A |
Template Sequence |   | P | I | L | L | Y | M | K | G | S | P | K | L | P | S | C | G | F | S | A | Q | A | V | Q | A | L | A | A | C | G | E | R | F | A | Y | V | D | I | L | Q | N | P | D | I | R | A | E | L | P | K | Y | A | N | W | P | T | F | P | Q | L | W | V | D | G | E | L | V | G | G | C | . | . | D | I | V | I | E | M | Y | Q | R |
Template Known Secondary structure |   | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | S | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | S | S | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 16 | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | ||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 76 | . | . | . | 80 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | P | H | A | A | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | G | E | L | Q | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 94 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|