Job Description P51025 Confidence 99.80% Date Thu Jan 5 12:04:51 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 254 % Identity 15% Template d1hlga_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Gastric lipase Resolution 3.00

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.				.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.
Query Sequence		E	L	I	E	K	H	V	S	F	G	G	W	Q	N	M	Y	R	H	Y	S	Q	S	L	K	C	E	M	N	V	G	V	Y	L	P	P	K	A	A	N	E	K	L	P	V	L	Y	W	L	S	G	L	T	C	N	E	Q	N	F	I	T	K	S	G	.	.	.	M	Q	R	Y	A	A	E	H	N	I	I	V	V	A
Query Conservation																																																																	.	.	.
Alig confidence										.	.	.											.																																										.	.	.
Template Conservation										.	.	.											.
Template Sequence		Q	M	I	T	Y	W	G	Y	.	.	.	P	N	E	E	Y	E	V	V	T	E	.	D	G	Y	I	L	E	V	N	R	I	P	Y	G	K	K	N	S	G	Q	R	P	V	V	F	L	Q	H	G	L	L	A	S	A	T	N	W	I	S	N	L	P	N	N	S	L	A	F	I	L	A	D	A	G	Y	D	V	W	L
Template Known Secondary structure							T	T		.	.	.										T	.	T	S	B									S		S	S	T	T												T	T			G	G	G	G	G	S	S		T	T	S									T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.											.
Template SS confidence
		18	.	20	.	.	.	.	.				.	.	.	.	30	.	.	.	.	.		.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.			.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.
Query SS confidence																																																										.	.
Query Sequence		P	D	T	S	P	R	G	S	H	V	A	D	A	D	R	Y	D	L	G	Q	G	A	G	F	Y	L	N	A	T	Q	A	P	W	N	E	H	Y	K	M	Y	D	Y	I	R	N	E	L	P	D	L	V	M	H	H	F	P	.	.	A	T	A	K	K	S	I	S	G	H	S	M	G	G	L	G	A	L	V	L	A	L
Query Conservation																																																										.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	S	R	G	N	T	W	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	L	Y	Y	S	P	D	S	V	E	F	W	A	F	S	F	D	E	M	A	K	Y	D	L	P	A	T	I	D	F	I	V	K	K	T	G	Q	K	Q	L	H	Y	V	G	H	S	Q	G	T	T	I	G	F	I	A	F	S
Template Known Secondary structure					T	T	S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B	S	S	S		T	T	S	T	G	G	G										T																S								T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.													.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		157	.	.	160				.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	P	D	.	.	.	E	Y	V	S	V	S	A	F	S	P	I	V	S	P	S	Q	V	P	W	G	Q	Q	A	F	A	A	Y	L	A	E	N	K	D	A	W	L	D	Y	D	P	V	S	L	I	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation						.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	P	S	L	A	K	R	I	K	T	F	Y	A	L	A	P	V	A	T	V	K	Y	T	K	S	L	I	N	K	L	R	F	V	P	Q	S	L	F	K	F	I	F	G	D	K	I	F	Y	P	H	N	F	F	D	Q	F	L	A	T	E	V	C	S	R	E	M	L	N	L	L	C	S	N	A	L	F	I	I	C
Template Known Secondary structure								T	T								S			S			S	S			S	G	G	G	G	G	G	G												S	S	B				T	T	T	T	T	T	S										S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
																																																																			207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	Q	R	V	A	E	I	M	V	D	Q	G	L	S	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	D	S	K	N	F	N	T	S	R	L	D	V	Y	L	S	H	N	P	A	G	T	S	V	Q	N	M	F	H	W	T	Q	A	V	K	S	G	K	F	Q	A	Y	D	W	G	S	P	V	Q	N	R	M	H	Y	D	Q	S	Q	P	P	Y	Y	N	V	T	A	M	N	V	P	I	A	V	W	N	G	G	K	D
Template Known Secondary structure						T	T	S		G	G	G						T	T			S			B															S		B					S	S									S	S	S	S			B			G	G	G			S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.
Query SS confidence																																								.
Query Sequence		D	F	Y	A	E	Q	L	R	T	P	N	L	E	K	I	C	Q	E	M	N	I	K	T	L	I	R	Y	H	E	G	Y	D	H	S	Y	Y	F	V	.	S	S	F	I	G	E	H	I	A	Y	H	A	N	K	L	N
Query Conservation																																								.
Alig confidence								.						.	.	.																								.
Template Conservation								.						.	.	.
Template Sequence		L	L	A	D	P	Q	.	D	V	G	L	L	.	.	.	L	P	K	L	P	N	L	I	Y	H	K	E	I	P	F	Y	N	H	L	D	F	I	W	A	M	D	A	P	Q	E	V	Y	N	D	I	V	S	M	I	S
Template Known Secondary structure		S	S	S				.						.	.	.					T	T								T	T			T	T						T	T					T									T
Template Predicted Secondary structure								.						.	.	.
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330		.	.	.	.	.				.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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