Job Description P51025 Confidence 99.56% Date Thu Jan 5 12:04:51 GMT 2012 Rank 147 Aligned Residues 223 % Identity 14% Template c2e3jA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:epoxide hydrolase ephb; PDBTitle: the crystal structure of epoxide hydrolase b (rv1938) from2 mycobacterium tuberculosis at 2.1 angstrom Resolution 2.10 Å

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		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	Y	S	Q	S	L	K	C	E	M	N	V	G	V	Y	L	P	P	K	A	A	N	E	K	L	P	V	L	Y	W	L	S	G	L	T	C	N	E	Q	N	F	I	T	K	S	G	M	Q	R	Y	A	A	E	H	N	I	I	V	V	A	P	D	T	S	P	R	G	S	H	V	A	D	A	D	R	Y	D	L	G	Q
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.																	.	.	.																																		.	.	.
Template Conservation																								.	.	.																	.	.	.																																		.	.	.
Template Sequence		R	I	L	N	C	R	G	T	R	I	H	A	V	A	D	S	P	P	D	Q	Q	G	.	.	.	P	L	V	V	L	L	H	G	F	P	E	S	W	Y	S	W	.	.	.	R	H	Q	I	P	A	L	A	G	A	G	Y	R	V	V	A	I	D	Q	R	G	Y	G	R	S	S	K	Y	R	V	Q	K	A	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T											T	T			S	.	.	.									T	T			G	G	G	G	.	.	.	T	T	T							T	T									T	T	S	T	T	S					S	G	G	G	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.																	.	.	.																																		.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.				.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.				.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	G	F	Y	L	N	A	T	Q	A	P	W	N	E	H	Y	K	M	Y	D	Y	I	R	N	E	L	P	D	L	V	M	H	H	F	P	A	T	A	K	K	S	I	S	G	H	S	M	G	G	L	G	A	L	V	L	A	L	R	N	P	D	E	Y	V	S	V	S	A	F	S	P	I	V	S	P	S	Q	V	P
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	R	I	K	E	L	V	G	D	V	V	G	V	L	D	S	Y	.	.	G	A	E	Q	A	F	V	V	G	H	D	W	G	A	P	V	A	W	T	F	A	W	L	H	P	D	R	C	A	G	V	V	G	I	S	V	P	F	A	G	R	G	V	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S															T	.	.	T		S								T	T													G	G	G								S	S				G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
																			77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.			.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	Q	Q	A	F	A	A	Y	L	A	E	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	P	G	S	P	F	G	E	R	R	P	S	D	Y	H	L	E	L	A	G	P	G	R	V	W	Y	Q	D	Y	F	A	V	Q	D	G	I	I	T	E	I	E	E	D	L	R	G	W	L	L	G	L	T	Y	T	V	S	G	E	G	M	M	A	A	T	K	A	A	V	S	M	D	P	I	D	V	I	R	A	G
Template Known Secondary structure				S	S		S	S			S								S	S	S		S	S												S								T	T												T	S																G	G	G	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
																																																		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	D	A	W	L	D	Y	D	P	V	S	L	I	S	Q	G	Q	R	V	A	E	I	M	V	D	Q	G	L	S	D	D	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	C	M	A	E	G	A	R	L	K	D	A	F	V	Y	P	E	T	M	P	A	W	F	T	E	A	D	L	D	F	Y	T	G	E	F	E	R	S	G	F	G	G	P	L	S	F	Y	H	N	I	D	N	D	W	H	D	L	A	D	Q	Q	G	K	P	L	T	P	P	A	L	F	I	G	G	Q	Y	D	V	G
Template Known Secondary structure		T	T				T	T	S		G	G	G	G					S	S			T	T	S																	S									T								T	G	G	G	T	T	S				S								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		224	.		.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		Y	A	.	E	Q	L	R	T	P	N	L	E	K	I	C	Q	E	M	N	I	K	T	L	I	R	Y	H	E	G	Y	D	H	S	Y	Y	F	V	S	S	F	I	G	E	H	I	A	Y	H	A	N	K	L
Query Conservation				.
Alig confidence				.									.	.	.																			.	.
Template Conservation													.	.	.																			.	.
Template Sequence		T	I	W	G	A	Q	A	I	E	R	A	.	.	.	H	E	V	M	P	N	Y	R	G	T	H	M	I	A	D	V	G	H	.	.	W	I	Q	Q	E	A	P	E	E	T	N	R	L	L	L	D	F	L
Template Known Secondary structure					T						T		.	.	.					T	T								S	S			S	.	.						S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.																			.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.				.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.			.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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