Job Description P0AEN1 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:23:45 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 224 % Identity 17% Template c3qftA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:nadph--cytochrome p450 reductase; PDBTitle: crystal structure of nadph-cytochrome p450 reductase (fad/nadph domain2 and r457h mutant) Resolution 1.40 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.					.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.		.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	C	K	V	T	S	V	E	A	I	T	D	.	.	.	.	T	V	Y	R	V	R	I	V	P	D	A	.	A	F	S	F	R	A	G	Q	Y	L	M	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation															.	.	.	.												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.												.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	L	A	A	V	T	T	N	R	K	L	N	Q	G	T	E	R	H	L	M	H	L	E	L	D	I	S	D	S	K	I	R	Y	E	S	G	D	H	V	A	V	Y	P	A	N	D	S	A	L	V	N	Q	L	G	K	I	L	G	A	D	L	D	V	V	M	S	L	N	N	L	D	E	E	S	N	K	K	H	P	F
Template Known Secondary structure														S	S	S	S	S										T	T	S						T	T																						T			T	T								S	S	T	T		S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	C	P	T	S	Y	R	T	A	L	T	Y	Y	L	D	I	T	N	P	P	R	T	N	V	L	Y	E	L	A	Q	Y	A	S	E	P	S	E	Q	E	L	L	R	K	M	A	S	S	S	G	E	G	K	E	L	Y	L	S	W	V	V	E	A	R	R	H	I	L	A	I	L	Q	D	C	P	S	L	R	P	P	I
Template Known Secondary structure		S	S	S										T	B			S	S											G	G	G	B		S												S		S											T	T	T	T	T										S	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
							40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.		.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.									.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.					.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																	.												.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																	.												.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	V	M	D	E	R	D	K	R	P	F	S	M	A	S	T	P	.	D	E	K	G	F	I	E	L	H	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	E	I	N	L	Y	A	K	A	V	M	D	R	I	L	K	D	H	.	.	.	.	Q	I	V	V	D	I	P	H	G	E	A	W	L	R	D	D
Query Conservation		.	.	.	.	.																	.												.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																	.												.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	L	C	E	L	L	P	R	L	Q	A	H	Y	Y	S	I	A	S	S	S	K	V	H	P	N	S	V	H	I	C	A	V	V	V	E	Y	E	T	K	A	G	R	I	N	K	G	V	A	T	N	W	L	R	A	K	E	P	V	N	G	G	R	A	L	V	P	M	F	V	R	K	S	Q	F	R	L	P	F	K
Template Known Secondary structure								S		B										S		T	T	T		T	T														T	T	S													T																			S					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
		102	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.					.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.		.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.																		.
Query SS confidence																												.	.	.	.																		.
Query Sequence		E	E	R	P	M	I	L	I	A	G	G	T	G	F	S	Y	A	R	S	I	L	L	T	A	L	A	.	.	.	.	R	N	P	N	R	D	I	T	I	Y	W	G	G	R	E	E	Q	.	H	L	Y	D	L	C	E	L	E	A	L	S	L	K	H	P	G	L	Q	V	V	P	V	V	E	Q	P	E	A	G	W	R
Query Conservation																												.	.	.	.																		.
Alig confidence																												.	.	.	.																		.																														.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		A	T	T	P	V	I	M	V	G	P	G	T	G	V	A	P	F	I	G	F	I	Q	E	R	A	W	L	R	Q	Q	G	K	E	V	G	E	T	L	L	Y	Y	G	C	R	R	S	D	E	D	Y	L	Y	R	E	E	L	A	Q	F	H	R	D	G	A	L	T	Q	L	N	V	A	F	S	R	E	Q	S	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	S								G	G	G	G																	T													S		T	T	T			T	T										T	T	S	S	S							T	T	S	S	S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.						.	.	.	.	.	.	200	.	.	.		.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	R	T	G	T	V	L	T	A	V	L	Q	D	H	G	T	L	.	.	.	.	.	A	E	H	D	I	Y	I	A	G	R	.	F	E	M	A	K	I	A	R	D	L	F	C	S	E	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	E	D	R	L	F	G	D	A	F	A
Query Conservation																			.	.	.	.	.											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																	.	.	.	.	.											.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	H	K	V	Y	V	Q	H	L	L	K	Q	D	R	E	H	L	W	K	L	I	E	G	G	A	H	I	Y	V	C	G	D	A	R	N	M	A	R	D	V	Q	N	T	F	Y	D	I	V	A	E	L	G	A	M	E	H	A	Q	A	V	D	Y	I	K	K	L	M	T	K	G	R	Y	S	L	D	V	W	S
Template Known Secondary structure		.	S											T										T	T									T	T	T																	T	T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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