Job Description P32662 Confidence 99.61% Date Thu Jan 5 11:49:55 GMT 2012 Rank 78 Aligned Residues 148 % Identity 34% Template c3kc2A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:uncharacterized protein ykr070w; PDBTitle: crystal structure of mitochondrial had-like phosphatase from2 saccharomyces cerevisiae Resolution 1.55 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	A	F	D	L	D	G	T	L	V	D	S	A	P	G	L	A	A	A	V	D	M	A	L	Y	A	L	E	L	P	V	A	G	E	E	R	V	I	T	W	I	G	N	G	A	D	V	L	M	E	R	A	L	T	W	A	R	Q	E	R	A	T	Q	R	K	T	M	G	K	P	P	V	D	D	D	I	P	A	E
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	A	F	D	I	D	G	V	L	F	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								B	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.					.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.													.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.													.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	V	R	I	L	R	K	L	F	D	R	Y	Y	G	E	V	A	E	E	G	T	F	L	F	P	H	V	A	D	T	L	G	A	L	Q	A	K	G	L	P	L	G	L	V	T	N	K	P	T	P	F	V	A	P	L	L	E	A	L	.	.	.	.	D	I	A	K	Y	F	S	V	V	I	G	G	.	.	.	.
Query Conservation																																																														.	.	.	.													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	K	P	I	A	G	A	S	D	A	L	K	L	L	N	R	N	K	I	P	Y	I	L	L	T	N	G	G	G	F	S	E	R	A	R	T	E	F	I	S	S	K	L	D	V	D	V	S	P	L	Q	I	I	Q	S	H	T	P	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T											T	T								S			S	S														T	S				G	G	G				T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																						27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	S	L	V	N	K	Y	S	R	I	L	A	V	G	T	P	S	V	R	G	V	A	E	G	Y	G	F	Q	D	V	V	H	Q	T	D	I	V	R	Y	N	R	D	I	A	P	F	S	G	L	S	D	E	Q	V	X	E	Y	S	R	D	I	P	D	L	T	T	K	K	F	D	A	V	L	V	F	N	D	P	H	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	T		S						S	S	T	T									T		S													G	G	G		T	T																T	T	T	T	T	S									S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
																																																																											161	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	V	Q	N	K	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	A	A	D	I	Q	I	I	S	D	A	I	N	S	E	N	G	X	L	N	T	L	R	N	E	K	S	G	K	P	S	I	P	I	Y	F	S	N	Q	D	L	L	W	A	N	P	Y	K	L	N	R	F	G	Q	G	A	F	R	L	L	V	R	R	L	Y	L	E	L	N	G	E	P	L	Q	D	Y	T	L	G	K
Template Known Secondary structure														T	S	B	T	T	B	T	T				S				S	S		S	S					S				S					S	S	S	S																					S	S								S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180														.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																										.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																										.
Query Sequence		P	H	P	D	P	L	L	L	V	A	E	R	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	A	P	Q	Q	M	L	F	V	G	D	S	R	.	N	D	I	Q	A	A	K	A	A	G	C	P	S	V	G	L	T	Y	G	Y	N	Y	G	E	A	.	I	D	L	S	Q	P	D	V	I	Y	Q	S	I
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																										.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.																										.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	K	L	T	Y	D	F	A	H	H	V	L	I	D	W	E	K	R	L	S	G	T	K	P	S	T	S	P	F	H	A	V	F	X	V	G	D	N	P	A	S	D	I	I	G	A	Q	N	Y	G	W	N	S	C	L	V	K	T	G	V	Y	N	E	G	D	D	L	K	E	C	K	P	T	L	I	V	N	D	V
Template Known Secondary structure		T																								T	T	T	T	T	S	S							S		T	T	T									T							S	S	S	S			T	T				T	T				S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	L	L	P	A	L	G	L	P	H	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		F	D	A	V	T	K	T	L	E	K	Y	A
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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