Job Description P75895 Confidence 99.16% Date Thu Jan 5 12:15:46 GMT 2012 Rank 218 Aligned Residues 256 % Identity 14% Template d1ivya_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Serine carboxypeptidase-like Resolution 2.20

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10			.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.		.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.						.
Query SS confidence												.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.						.
Query Sequence		M	K	L	S	L	S	P	P	P	Y	.	.	A	D	A	P	V	V	V	L	I	S	G	L	G	G	S	G	S	Y	W	L	P	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	V	L	E	Q	E	Y	Q	V	V	C	Y	D	Q	R	.	G	T	G	N	N	.	P	D	T	L	A
Query Conservation												.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.						.
Alig confidence												.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.						.
Template Conservation
Template Sequence		L	H	Y	W	F	V	E	S	Q	K	D	P	E	N	S	P	V	V	L	W	L	N	G	G	P	G	C	S	S	L	D	G	L	L	T	E	H	G	P	F	L	V	Q	P	D	G	V	T	L	E	Y	N	P	Y	S	W	N	L	I	A	N	V	L	Y	L	E	S	P	A	G	V	G	F	S	Y	S	D	D	K	F
Template Known Secondary structure										S	S		G	G	G	S									T	T	T	B		T						T	T	T	S	S					T	T	S	S						T	T		G	G	G	S	S								S	T	T	S	T	T				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.								.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.					.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Query Sequence		E	D	Y	S	I	A	Q	M	A	A	E	L	H	Q	A	L	V	.	.	.	.	.	.	.	A	A	G	I	E	H	Y	A	V	V	G	H	A	L	G	A	L	V	G	M	Q	L	A	L	D	Y	.	.	.	.	P	A	S	V	T	V	L	I	S	V	N	G	W	L	R	I	N	A	H	T	R	R	C	F	Q	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	T	N	D	T	E	V	A	Q	S	N	F	E	A	L	Q	D	F	F	R	L	F	P	E	Y	K	N	N	K	L	F	L	T	G	E	S	Y	A	G	I	Y	I	P	T	L	A	V	L	V	M	Q	D	P	S	M	N	L	Q	G	L	A	V	G	N	G	L	S	S	Y	E	Q	N	D	N	S	L	V	Y	F
Template Known Secondary structure					B																			S	G	G	G	T	T	S								T	T													T	T		T	T	S									S			S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	R	L	L	Y	S	G	G	A	Q	A	W	V	E	A	Q	P	L	F	L	Y	P	A	D	W	M	A	A	R	A	P	R	L	E	A	E	D	A	L	A	L	A	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Y	Y	H	G	L	L	G	N	R	L	W	S	S	L	Q	T	H	C	C	S	Q	N	K	C	N	F	Y	D	N	K	D	L	E	C	V	T	N	L	Q	E	V	A	R	I	V	G	N	S	G	L	N	I	Y	N	L	Y	A	P	C	A	G	G	V	P	S	H	F	R	Y	E	K	D	T	V	V	V	Q	D	L
Template Known Secondary structure					T	T	S	S															T	T					S	S																			S	S	S			T	T		T	T	S			T	T			S	S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
																																								172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								190
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Q	G	K	N	N	L	L	R	R	L	N	A	L	K	R	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	I	F	T	R	L	P	L	K	R	M	W	H	Q	A	L	L	R	S	G	D	K	V	R	M	D	P	P	C	T	N	T	T	A	A	S	T	Y	L	N	N	P	Y	V	R	K	A	L	N	I	P	E	Q	L	P	Q	W	D	M	C	N	F	L	V	N	L	Q	Y	R	R	L	Y	R	S	M	N	S	Q	Y
Template Known Secondary structure		S		S	S	T	T	S							G	G	G					T								T	T											T	S							T	T			T	T	S					S	B									B				S	B	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	H	H	A	D	R	I	R	C	P	V	Q	I	I	C	A	S	D	D	L	L	V	P	T	A	C	S	S	E	L	H	A	A	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	Q	K	M	V	M	P	Y	G	G	H	A	C	N	V
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	L	L	S	S	Q	K	Y	Q	I	L	L	Y	N	G	D	V	D	M	A	C	N	F	M	G	D	E	W	F	V	D	S	L	N	Q	K	M	E	V	Q	R	R	P	W	L	V	K	Y	G	D	S	G	E	Q	I	A	G	F	V	K	E	F	S	H	I	A	F	L	T	I	K	G	A	G	H	M	V	P	T
Template Known Secondary structure								T										T	T		S	S	S												T																T	T	S												S	S							T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	P	E	T	F	N	A	L	L	L	N	G	L	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	K	P	L	A	A	F	T	M	F	S	R	F	L	N
Template Known Secondary structure																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		434	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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