Job Description Q46806 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:34:31 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 354 % Identity 19% Template c3ooqC_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: C: PDB Molecule:amidohydrolase; PDBTitle: crystal structure of amidohydrolase from thermotoga maritima msb8 Resolution 2.06 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
Predicted Secondary structure																.																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	L	I	K	N	G	T	V	V	N	A	D	G	.	Q	A	K	Q	D	L	L	I	E	S	G	I	V	R	Q	L	G	N	N	I	S	P	Q	L	P	Y	E	E	I	D	A	T	G	C	Y	V	F	P	G	G	V	D	V	H	T	H	F	N	I	D	V	G	I	A	R	S	C	D	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.																						.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.
Template Sequence		K	I	L	F	K	N	A	T	V	F	P	I	T	S	R	P	F	K	G	D	V	L	V	S	N	G	K	V	E	K	V	G	E	N	I	E	.	D	P	D	A	E	I	V	D	L	T	G	K	F	L	F	P	G	F	V	D	A	H	S	H	I	G	L	F	E	E	G	V	G	Y	Y	Y	S	D	G	N	E	A	T
Template Known Secondary structure													S	S	S											T	T							S				.		S	S	S						T	T														T	T	T	S		T	T	S		G	G	G			S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																						.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
																74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	F	T	G	T	R	A	A	A	C	G	G	T	T	T	I	I	D	H	M	G	F	G	P	N	G	C	R	L	R	H	Q	L	E	V	Y	R	G	Y	A	A	H	K	A	V	I	D	Y	S	F	H	G	V	I	Q	H	I	N	H	A	I	L	D	E	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		D	P	V	T	P	H	V	K	A	L	D	G	F	N	P	Q	D	P	A	I	E	R	A	L	A	G	G	V	T	S	V	X	I	V	P	G	S	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	G	G	Q	G	S	V	I	K	F	R	S	I	I	V	E	E	C	I	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	B		T	T		B	G	G	G	G			T	T										T	T										S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S										S			S	S						.	.
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	M	I	V	E	E	G	L	S	S	F	K	L	Y	L	T	Y	Q	Y	K	L	N	D	D	E	V	L	Q	A	L	R	R	L	H	E	S	G	A	L	T	T	V	H	P	E	N	D	A	A	I	A	S	K	R	A	E	F	I	A	A	G	L	T	A	P	R	Y	H	A	L	S	R	P	L	E	C	E	A	E	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	D	P	A	G	L	K	X	A	F	G	E	N	P	K	R	V	Y	G	E	R	K	Q	T	P	S	T	R	X	G	T	A	G	V	I	R	D	Y	F	T	K	V	K	N	Y	X	K	K	K	E	L	A	Q	K	E	G	K	E	F	T	E	T	D	L	K	X	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S										T	T		S		S	S																												T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	R	M	I	N	L	A	Q	I	A	G	N	A	P	L	Y	I	V	H	L	S	N	G	L	G	L	D	Y	L	R	L	A	R	A	N	H	Q	P	V	W	V	E	T	C	P	Q	Y	L	L	L	D	E	R	S	Y	D	T	E	D	G	M	K	F	I	L	S	P	P	L	R	N	V	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.																																										.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.																																										.	.
Template Sequence		G	.	.	.	.	.	E	X	V	L	R	K	K	I	P	A	R	X	H	A	H	R	A	D	D	I	L	T	A	I	R	I	A	E	E	F	G	F	N	L	V	I	E	H	G	T	E	.	.	A	Y	K	I	S	K	V	L	A	E	K	K	I	P	V	V	V	G	P	L	L	T	F	R	T	K	L	E	L	K	D
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.					T	T	S	S								S															T									T	T	.	.	G	G	G	G							T	T									S	S				S	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.																																										.	.
Template SS confidence
		213						.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.			.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	Q	D	K	L	W	C	G	I	S	D	G	A	I	D	V	V	A	T	D	H	C	T	F	S	M	A	Q	R	L	Q	I	S	K	G	D	F	S	R	C	P	N	G	L	P	G	V	E	N	R	M	Q	L	L	F	S	S	G	V	M	T	G	R	I	T	P	E	R	F	V	E	L	T	S	A	M	P	A	R
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	T	X	E	T	I	A	K	L	L	K	D	G	V	L	I	A	L	X	C	D	H	P	V	I	P	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	A	T	V	Q	A	A	T	A	X	R	Y	G	A	K	E	E	D	L	L	K	I	L	T	V	N	P	A	K
Template Known Secondary structure				T	T								T	T								T	T	T	T	S		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G								G	G	G	G	T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	F	G	L	W	P	Q	K	G	L	L	A	P	G	S	D	G	D	V	V	I	I	D	P	R	Q	S	Q	Q	I	Q	H	R	H	L	H	D	N	A	D	Y	S	P	W	E	G	F	T	C	Q	G	A	I	V	R	T	L	S	R	G	E	T	I	F	C	D
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	L	G	L	E	D	R	I	G	S	I	E	P	G	K	D	A	D	L	V	V	W	S	G	H	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	X	K	S	V	V	E	R	V	Y	I	D	G	V	E	V	F	R	R
Template Known Secondary structure			T	T		T	T	T	S	S	S			T	T	S	B							S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.