Job Description P39377 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:00:10 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 341 % Identity 17% Template c3e0lB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:guanine deaminase; PDBTitle: computationally designed ammelide deaminase Resolution 2.37 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.						.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.								.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	F	T	L	L	Q	G	A	H	L	Y	A	P	E	D	.	.	.	.	.	R	G	I	C	D	V	L	V	A	N	.	G	K	I	I	A	V	A	S	N	I	P	S	.	.	.	.	.	.	.	D	I	V	P	N	C	T	V	V	D	L	S	G	Q	I	L	C	P	G	F	I	D	Q	H	V	H	L	I	G
Query Conservation																		.	.	.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.											.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	A	H	I	F	R	G	T	F	V	H	S	T	W	T	C	P	M	E	V	L	R	D	H	L	L	G	V	S	D	S	G	K	I	V	F	L	E	E	A	S	Q	Q	E	K	L	A	K	E	W	C	F	K	P	C	E	I	R	E	L	S	H	H	E	F	F	M	P	G	L	V	D	T	H	I	H	A	S	Q
Template Known Secondary structure				S												T	T															T	T	S	B							G	G	G								T	T			G	G	G						T	T														G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	G	E	A	G	P	T	T	R	T	P	E	V	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	L	T	E	A	G	V	T	S	V	V	G	L	L	G	T	D	S	I	S	R	H	P	E	S	L	L	A	K	T	R	A	L	N	E	E	G	I
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	F	A	G	S	S	I	D	L	P	L	L	E	W	L	T	K	Y	T	F	P	A	E	H	R	F	Q	N	I	D	F	A	E	E	V	Y	T	R	V	V	R	R	T	L	K	N	G	T	T	T	A	C	Y	F	A	T	I	H	T	D	.	.	.	.	.	S	S	L	L	L	A	D	I	T	D	K	F	G	Q
Template Known Secondary structure		G	G	G	T	T	S				S									T							G	G	G	S																	T	T	T										S				.	.	.	.	.													T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.						.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.										.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	W	M	L	T	G	A	Y	H	V	P	S	R	T	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	V	E	K	D	V	A	I	I	D	R	V	I	G	V	K	C	A	I	S	D	H	R	S	A	A	P	D	V	Y	H	L	A	N	M	A	A	E	S	R	V	G	G	L	L	G	G	K	P	G	V	T	V
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	F	V	G	K	V	C	M	D	L	N	D	T	F	P	E	Y	K	E	T	T	E	E	S	I	K	E	T	E	R	F	V	S	E	M	L	Q	K	N	Y	S	R	V	K	P	I	V	T	P	G	N	G	V	S	E	T	L	M	G	E	L	G	N	I	A	K	T	R	D	.	.	.	.	.	.	L	H	I	Q
Template Known Secondary structure											S			S	S	S	T	T	S																				T	T			S	S									S	S																T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.							.	.	.	.
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	H	M	G	D	S	K	K	A	L	Q	P	I	Y	D	L	L	E	N	C	D	V	P	I	S	K	L	L	P	T	H	V	N	R	N	V	P	L	F	E	Q	A	L	E	F	A	R	K	G	G	T	I	D	I	T	S	S	I	D	E	P	V	A	P	A	E	G	I	A	R	A	V	Q	A	G	I	P	L	A	R
Query Conservation
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	I	S	E	N	R	D	E	V	E	A	V	K	N	L	Y	P	S	Y	K	N	Y	T	S	V	Y	D	K	N	N	L	L	T	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	M	A	H	G	C	Y	L	S	A	E	E	L	N	V	F	H	E	R	G	A	S	I	A	H
Template Known Secondary structure					S		S											S	T	T	S	S	S							T	T	T			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T													T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
		280					.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.																.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure			.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	.	.	.	.	T	L	S	S	D	G	N	G	S	Q	P	F	F	D	D	E	G	N	L	T	H	I	G	V	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	T	L	L	E	T	V	Q	V	L	V	K	D	Y	D	F	S	I	S	D	A	L	R	P	L	T	S	S	V	A	G	F	L
Query Conservation			.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	P	N	S	N	L	S	L	S	S	G	F	L	N	V	L	E	V	L	K	H	E	V	K	I	G	L	G	T	D	V	A	G	G	Y	S	Y	S	M	L	D	A	I	R	R	A	V	M	V	S	N	I	L	L	I	N	K	V	N	E	K	S	L	T	L	K	E	V	F	R	L	A	T	L	G	G	S	Q	A	L
Template Known Secondary structure									T	T												T	T									T	T	T	S																						T	T	S	S	S	S												T							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
		341	.	.	.	.		.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	L	T	G	K	.	G	E	I	L	P	G	N	D	A	D	L	L	V	M	T	P	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	E	Q	V	Y	A	R	G	K	L	M	V
Query Conservation							.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	L	D	G	E	I	G	N	F	E	V	G	K	E	F	D	A	I	L	I	N	P	K	A	S	D	S	P	I	D	L	F	Y	G	D	F	F	G	D	I	S	E	A	V	I	Q	K	F	L	Y	L	G	D	D	R	N	I	E	E	V	Y	V	G	G	K	Q	V	V
Template Known Secondary structure		T		T	T	T	S	S	S			T	T	S	B								T	T		T	T		S					T	T	S	S	S	S		G	G	G	T											G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.