Job Description P45552 Confidence 56.68% Date Thu Jan 5 12:03:11 GMT 2012
Rank 301 Aligned Residues 111
% Identity 10% Template c3pplB_
PDB info
PDB header: transferaseChain: B: PDB Molecule: aspartate aminotransferase;
PDBTitle: crystal structure of an aspartate transaminase (ncgl0237, cgl0240)2 from corynebacterium glutamicum atcc 13032 kitasato at 1.25 a3 resolution
Resolution 1.25 Å
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167 . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . .
200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . .
Query SS confidence  
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Query Sequence  
V G E H Q L I C R K G E S A N V K R V G L D N R S A D Q K I M T D .
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V F F G G S D V E R V D L S Y H E S L Q R I V K G D V D A V I W N
Query Conservation  
                                              . . . . . . . . . . . . . .                                                  
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                  . . . . . . . . . . .                                                                              
Template Sequence  
V P V E Q V L A G D A S S L N I X .
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.
.
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.
.
.
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F D V I S W S Y I F G N N D S V Q P W S K E E T V K W I C P V P G Y D R H F S I T E R F G F E X I S V P
Template Known Secondary structure  
S G G G S S . . . . . . . . . . . T T S S G G G S S S T T
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
92 . . . . . . . 100 . . . . . . . .
. 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160
 
   
233 . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
V V A E N E L T M L G L E A T P L T D D P R F L Q A T E A V V L T R V D D Y P M Q Q L L R A V V D K H A L L A H Q Q R V V S G E Q E P
Query Conservation  
                                                                                                           
Alig confidence  
. . . . . . . . . . .
Template Conservation  
    . . . . . .               .                                     . . . .                                
Template Sequence  
X N .
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.
.
.
E D G P D X D A V .
E E L V K N P Q V K G X W V V P V F S N P T G F .
.
.
.
T V T E D V A K R L S A X E T A A P D F R
Template Known Secondary structure  
. . . . . . T T . T T S T T S S T T T . . . . S S T T
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
161 .
. . . . . . . 170 .
. . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . .
. . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]