Job Description P30015 Confidence 99.94% Date Wed Jan 25 15:20:48 GMT 2012 Rank 81 Aligned Residues 346 % Identity 17% Template c1z63A_ PDB info PDB header:hydrolase/dna complex Chain: A: PDB Molecule:helicase of the snf2/rad54 hamily; PDBTitle: sulfolobus solfataricus swi2/snf2 atpase core in complex2 with dsdna Resolution 3.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.					.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.
Query Sequence		K	Q	P	T	A	V	Q	P	Q	T	W	.	.	.	.	H	V	A	A	R	S	E	H	A	L	V	I	A	P	T	G	S	G	K	T	L	A	A	F	L	Y	A	L	D	R	L	F	R	E	G	G	E	D	T	R	E	A	H	K	R	K	T	S	R	I	L	Y	I	S	P	I	K	A	L	G	T	D	V	Q	R
Query Conservation													.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		A	N	L	R	P	Y	Q	I	K	G	F	S	W	X	R	F	X	N	K	L	G	F	G	I	C	L	A	D	D	X	G	L	G	K	T	L	Q	T	I	A	V	F	S	D	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	N	E	L	T	P	S	L	V	I	C	P	L	.	S	V	L	K	N	W	E	E
Template Known Secondary structure		S																			T	T									T	T	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T			S	S							S	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.												.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	Q	I	P	L	K	G	I	A	D	E	R	R	R	R	G	E	T	E	V	N	L	R	V	G	I	R	T	G	D	T	P	A	Q	E	R	S	K	L	T	R	N	P	P	D	I	L	I	T	T	P	E	S	L	Y	L	M	L	T	S	R	A	R	E	T	L	R	G	V	E	T	V	I	I	D	E	V	H	A
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Sequence		E	L	S	K	F	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	R	F	A	V	F	H	E	D	R	.	.	.	.	.	S	K	I	K	L	E	D	Y	D	I	I	L	T	T	Y	A	V	L	L	R	D	T	R	L	K	E	V	E	W	.	.	.	.	K	Y	I	V	I	D	E	A	Q	N
Template Known Secondary structure								T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S						S	S	S	T	.	.	.	.	.	T	S			G	G	G	S	S										T	T						T				.	.	.	.							T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template SS confidence
		510	.	.	.	.	.	.															.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.						.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.					.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	A	G	S	K	R	G	A	H	L	A	L	S	L	E	R	L	D	A	L	L	H	T	S	A	Q	R	I	G	L	S	A	T	V	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	D	V	A
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	N	P	Q	T	K	I	F	K	A	V	K	.	.	.	.	.	.	.	E	L	K	S	K	Y	R	I	A	L	T	G	T	P	I	E	N	K	V	D	D	L	W	S	I	X	T	F	L	N	P	G	L	L	G	S	Y	S	E	F	K	S	K	F	A	T	P	I	K	K	G	D	N	X	A	K	E	E	L	K
Template Known Secondary structure		G	S		T	T	S								.	.	.	.	.	.	.	T	S										S	S		S	T	T													S	T	T	T	T								T	T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.								580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		225	.	.	.	.						230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	F	L	G	G	.	.	.	.	.	D	R	P	V	T	V	V	N	P	P	A	M	R	H	P	Q	I	R	I	V	V	P	V	A	N	M	D	D	V	S	S	V	A	S	G	T	G	E	D	S	H	A	G	R	E	G	S	I	W	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	I	S	P	F	I	L	R	R	T	K	Y	D	K	A	I	I	N	D	L	P	D	K	I	E	T	N	V	Y	C	N	L	T	P	E	Q	A	A	X	Y	K	A	E	V	E	N	L	F	N	N	I	D	S	V	T	G	I	K	R	K	G	X	I	L	S	T	L	L	K	L	K	Q	I	V	D	H	P	A	L
Template Known Secondary structure					T	T	T						T	T						T	T	S		S																										T	T	T	T	T	T			T																		T	T		T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	T	G	I	L	D	E	V	L	R	H	R	S	T	I	V	F	T	N	S	R	G	L	A	E	K	L	T	A	R	L	N	E	L	Y	A	A	R	L	Q	R	S	P	S	I	A	V	D	A	A	H	F	E	S	T	S	G	A	T	S	N	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	G	G	E	Q	S	V	R	R	S	G	K	X	I	R	T	X	E	I	I	E	E	A	L	D	E	G	D	K	I	A	I	F	T	Q	F	V	D	X	G	K	I	I	R	N	I	I	E	K	E	L	N	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S				S	T	T																T	T	T								S																	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.
Query SS confidence																														.
Query Sequence		Q	S	S	D	V	F	I	A	R	S	H	H	G	S	V	S	K	E	Q	R	A	I	T	E	Q	A	L	K	.	S	G	E	L	R	C	V	V	A	T	S	S	L	E	L	G	I	D	M	G	A	V	D	L	V	I	Q	V	A	T	P	L	S	V	A	S	G	L	Q	R	I	G	R	A	G	H	Q	V	G	G	V
Query Conservation																														.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																						.																																				.	.	.										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	V	P	F	L	Y	G	E	L	S	K	K	E	R	D	D	I	I	S	K	F	Q	N	N	P	S	V	K	F	I	V	L	S	V	K	A	G	F	G	I	N	L	T	S	A	N	R	V	I	H	F	D	R	W	W	N	P	D	.	.	.	Q	A	T	D	R	V	Y	R	I	.	G	Q	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.						T	T	S																T	T																	T	T		S					S	S			S				.	.	.					T	T	T	T	T	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.										.
Template SS confidence
									775	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.				.	.	.	.	.	.	.	.	840		.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	K	G	L	F	F	P	R	T	R	R	D	L	V	D	S	A	V	I	V	E	C	M	F	A	G	R	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	N	V	I	V	H	K	L	I	S	V	G	T	L	E	E	K	I	D	Q	L	L	A	F	K	R	S	L
Template Known Secondary structure		S										T	T	S					T					T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		848	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.