Job Description P11553 Confidence 97.04% Date Thu Jan 5 11:32:45 GMT 2012 Rank 75 Aligned Residues 316 % Identity 16% Template c1tuuA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:acetate kinase; PDBTitle: acetate kinase crystallized with atpgs Resolution 2.50 Å

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.									.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.														.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Query SS confidence																								.														.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Query Sequence		M	K	Q	E	V	I	L	V	L	D	C	G	A	T	N	V	R	A	I	A	V	N	.	R	Q	G	K	I	V	A	R	A	S	T	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	D	I	A	M	E	N	N	T	W	H	Q	W	S	L	D	A	I	L	Q	R	F	A	D	C	C	R	Q	I	N	S	E	L	.	.
Query Conservation																								.														.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Alig confidence				.	.	.																		.														.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation				.	.	.
Template Sequence		M	K	.	.	.	V	L	V	I	N	A	G	S	S	S	L	K	Y	Q	L	I	D	M	T	N	E	S	A	L	A	V	G	L	C	E	R	I	G	I	D	N	S	I	I	T	Q	K	K	F	D	G	K	K	L	E	K	L	T	D	L	P	T	H	K	D	A	L	E	E	V	V	K	A	L	T	D	D	E	F	G
Template Known Secondary structure				.	.	.								S	S									T	T	T	T											T	T	S	S	S								T	T	S											S													T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.
Template SS confidence
		1	.				.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
					80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	T	E	C	H	I	R	G	I	A	V	T	T	F	G	V	D	G	A	L	V	D	K	Q	G	N	L	L	Y	P	I	I	S	W	K	C	P	R	T	A	A	V	M	D	N	I	E	R	L	I	S	A	Q	R	L	Q	A	I	S	G	V	G	A	F	S	F	N	T	L	Y	K	L	V	W	L	K	E	N
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	I	K	D	M	G	E	I	N	A	V	G	H	R	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	G	E	K	F	T	T	S	A	L	Y	D	E	G	V	E	K	A	I	K	D	C	F	E	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	H	N	P	P	N	M	M	G	I	S	A	C	A	E	I
Template Known Secondary structure		S		S	S	G	G	G									S	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T			S															T	G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.										.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120												.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.			220	.	.	.	.	.	.	.	.					.	230
Predicted Secondary structure																																																																	.	.										.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.										.	.	.	.
Query Sequence		H	P	Q	L	L	E	R	A	H	A	W	L	F	I	S	S	L	I	N	H	R	L	T	G	E	F	T	T	D	I	T	M	A	G	T	S	Q	M	L	D	I	Q	Q	R	D	F	S	P	Q	I	L	Q	A	T	G	I	P	R	R	L	F	P	R	.	.	L	V	E	A	G	E	Q	I	G	.	.	.	.	T	L
Query Conservation																																																																	.	.										.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.						.				.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Sequence		M	P	G	T	P	M	V	I	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	T	A	F	H	Q	T	M	P	P	Y	A	Y	M	Y	A	L	P	Y	D	L	Y	E	K	H	G	V	R	K	Y	G	.	F	H	G	T	S	H	K	Y	V
Template Known Secondary structure			T	T	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	G	G	G	G	G									S	S															.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template SS confidence
		138	.	140	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.		.	180	.	.	.	.	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.		.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.		.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.																												.
Query SS confidence													.																												.
Query Sequence		Q	N	S	A	A	A	M	L	G	L	P	.	V	G	I	P	V	I	S	A	G	H	D	T	Q	F	A	L	F	G	A	G	A	E	Q	N	E	P	V	.	L	S	S	G	T	W	E	I	L	M	V	R	S	A	Q	V	D	T	S	L	L	S	Q	Y	A	G	S	T	C	E	L	D	S	Q	A	G	L	Y	N	P
Query Conservation													.																												.
Alig confidence													.																					.	.						.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																		.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Sequence		A	E	R	A	A	L	M	L	G	K	P	A	E	E	T	K	I	I	T	C	H	L	G	N	G	S	S	I	T	A	V	E	.	.	G	G	K	S	V	E	T	S	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	P	L	E	G	L	A	M	G	T	R	C	G	S	I	D	P	A	I	V	P	F	.
Template Known Secondary structure										T	S		G	G	G									S	S	S								.	.	T	T						S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T	S	S	S			S	S				S			T	T					.
Template Predicted Secondary structure																																		.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.			220	.	.	.	.	.	.	.	.	.													230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.										330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	M	Q	W	L	A	S	G	V	L	E	W	V	R	K	L	F	W	T	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	W	Q	M	L	I	E	E	A	R	L	I	A	P	G	A	D	G	V	K	M	Q	C	D	L	L	S	C	Q	N	A	G	W	Q	G	V	T	L	N	T	T	R	G	H	F	Y	R	A	A
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation		.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template Sequence		.	L	M	E	K	E	G	L	T	T	R	E	I	D	T	L	M	N	K	K	S	G	V	L	G	V	S	G	L	S	N	D	F	R	D	L	D	E	A	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	N	R	K	A	E	L	A	.	.	.
Template Known Secondary structure		.						T													S								S	S		S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Template SS confidence
			253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	300	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.		.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		L	E	G	L	T	A	Q	L	Q	R	N	L	Q	M	L	E	K	I	G	H	F	K	A	S	E	L	L	L	V	G	G	G	S	.	R	N	T	L	W	N	Q	I	K	A	N	M	L	D
Query Conservation																																			.
Alig confidence																						.													.
Template Conservation																						.
Template Sequence		L	E	I	F	A	Y	K	V	K	K	F	I	G	E	Y	S	A	V	L	N	.	G	A	D	A	V	V	F	T	A	G	I	G	E	N	S	A	S	I	R	K	R	I	L	T	G	L	D
Template Known Secondary structure																				T	T	.	S		S																					T	T		G
Template Predicted Secondary structure																						.
Template SS confidence
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.		.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.