Job Description P0AD65 Confidence 98.01% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 81 Aligned Residues 266 % Identity 15% Template d1yqsa1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase Resolution 1.05

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		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.								.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	S	R	A	A	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	.	.	.	.	.	.	.	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N	R	A	T	Q	G	V	Y	P	P
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	G	L	Q	A	V	L	H	T	A	L	S	Q	G	A	P	G	A	M	V	R	V	D	D	N	G	T	I	H	Q	L	S	E	G	V	A	D	R	A	T	G	R	A	I	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	F	R	V
Template Known Secondary structure														T	T		S									T	T									B	S		T	T	T			B			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	60
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.			.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	T	V	K	P	Y	V	A	V	S	.	.	.	A	L	S	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	.	.	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.																.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	V	T	K	S	F	S	A	V	V	L	L	Q	L	V	D	E	G	K	L	D	L	D	A	S	V	N	T	Y	L	P	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	D	D	R	I	T	V	R	Q	V	M	S	H	R	S	G	L	Y	D	Y	T	N	D	M	F	A	Q	T	V	P
Template Known Secondary structure		G	G	G															T	T	S			T	T	S	B					S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		T	T		B						T	T		S					T					T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.																.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
																																				388	.	390	.	.				.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410						.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																			.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																			.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	T	F	F	.	.	.	Y	Q	V	A	Y	D	M	G	I	D	R	L	S	E	W	M	G	K	.	.	.	.	.	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																			.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	E	S	V	R	N	K	V	F	S	Y	Q	D	L	I	T	L	S	L	K	H	G	V	T	N	A	P	G	A	A	Y	S	Y	S	N	T	N	F	V	V	A	G	M	L	I	E	K	L	T	G	H	S	V	A	T	E	Y	Q	N	R	I	F	T	P	L	N	L	T	D	T	F	Y	V	H	P	D	T	V	I
Template Known Secondary structure							T	T														T	S			S	S	S	T	T	S																					S	S										T	T	T	T	T	T		T	T		B			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.			.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y	Q	G	D	T	I	P	V	G	.	.	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P
Query Conservation																													.	.
Alig confidence																													.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	T	H	A	N	G	Y	L	T	P	D	E	A	G	G	A	L	V	D	S	T	E	Q	T	V	S	W	A	Q	S	A	G	A	V	I	S	S	T	Q	D	L	D	T	F	F	S	A	L	M	S	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	B								S	S	T	T												T	T	T	G	G	G	T																		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.		.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
Predicted Secondary structure																																				.
Query SS confidence																																				.
Query Sequence		V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	A	N	R	P	N	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	.	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N
Query Conservation																																				.
Alig confidence		.																																		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	Q	L	M	S	A	A	Q	L	A	Q	M	Q	Q	W	T	T	V	N	S	T	Q	G	Y	G	L	G	L	R	R	R	D	L	S	C	G	I	S	V	Y	G	H	T	G	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	Y	Y	T	Y	A	F	A	S	K	D	G	K
Template Known Secondary structure		.		S	S									T							T	T					S	S							T	T	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	N	G	G	A	G	P	A	V	G	T	L	M	R	Q	I	L	D	H	I	M	L	G	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	R	S	V	T	A	L	A	N	T	S	N	N	V	N	V	L	N	T	M	A	R	T	L	E	S	A	F	C	G	K	P
Template Known Secondary structure		.	.								S			S																	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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