Job Description P0AD65 Confidence 98.84% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 70 Aligned Residues 242 % Identity 23% Template d1w79a1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like Dac-like Resolution 1.8

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.						.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	.	.	.	.	.	S	R	A	A	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N	R	A	T	Q	G	V	Y	P	P	A	S
Query Conservation															.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	E	L	R	E	D	I	D	A	I	L	E	D	P	A	L	E	G	A	V	S	G	V	V	V	V	D	T	A	T	G	E	E	L	Y	S	R	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	Q	L	L	P	A	S
Template Known Secondary structure												T	T		G	G	G	T	T										T	T	T								S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			B			G	G
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.																																																.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	V	K	P	Y	V	A	V	S	A	L	S	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	W	W	Q	L	P	G	S
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		N	M	K	L	F	T	A	A	A	A	L	E	V	L	.	.	G	A	D	H	S	F	G	T	E	V	A	A	E	S	A	P	G	R	R	G	E	V	Q	D	L	Y	L	V	G	R	G	D	P	T	L	S	A	E	D	L	D	A	M	A	A	E	V	A	A	S	G	V	R	T	V	R	G	D	L	Y	A	D	D	T
Template Known Secondary structure		G													T	.	.		T	T										S	S				T	T	S			S								S		T	T																T	T						S							T
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.			.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	F	D	S	E	R	L	V	D	D	W	W	P	E	D	E	P	Y	A	Y	S	A	Q	I	S	A	L	T	V	A	H	G	E	R	F	D	T	G	V	T	E	V	S	V	T	P	A	A	E	G	E	P	A	D	V	D	L	G	A	A	E	G	Y	A	E	L	D	N	R	A	V	T	G	A	A	G	S	A	N	T
Template Known Secondary structure		T	S		S			S		T	T	S		G	G	G	T	T	B	G	G	G					S	S					T	T	T	T			S										S	T	T	S	B						G	G	G	T	T	T	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		128	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
																																																								376	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	V	I	D	R	P	V	G	T	N	T	I	A	V	T	G	S	L	P	A	D	A	A	P	V	T	A	L	R	T	V	D	E	P	A	A	L	A	G	H	L	F	E	E	A	L	E	S	N	G	V	T	V	K	G	D	V	G	L	G	G	V	P	A	D	W	Q	D	A	E	V	L	A	D	H	T	S	A	E	L
Template Known Secondary structure								T	T								S				T	T	S										S																	T	T					S									S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
					380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400													.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	V	T	R	S	L	E	E	S	A	D	T	F	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	R	L	S	E	W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y
Query Conservation		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	E	I	L	V	P	F	M	K	F	S	N	N	G	H	A	E	M	L	V	K	S	I	G	Q	E	T	A	G	A	G	T	W	D	A	G	L	V	G	V	E	E	A	L	S	G	L	G	V	.	D	T	A	G	L	V	L	.	N	D	G	S	G	L	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												T																		S			S															T	T		.			T	T		B		.	S		S	S	S		S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.								.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.		.	.	.	.	.	.	350	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	G	D	T	I	P	V	G	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	A	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	L	V	T	A	D	T	V	V	D	L	L	G	Q	A	G	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	W	A	Q	T	W	S	A	S	L	P	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		B	B														T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								S		B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
		525	.	.							.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540			.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		R	P	N	.	.	.	.	.	.	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	.	.	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	N	G	G	A
Query Conservation					.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.														.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		A	G	E	S	D	P	F	V	G	G	T	L	A	N	R	M	R	G	T	A	A	E	G	V	V	E	A	K	T	G	T	M	S	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	L	S	G	Y	V	P	G	P	E	G	E	L	A	F	S	I	V	N	N	G	.	H	S
Template Known Secondary structure		T	T		S	S					G	G	G	T	T	S	S	T	T	S	T	T	T	T	T									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T												.		S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		383	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.		440	.
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	P	A	V	G	T	L	M	R	Q	I	L	D	H	I	M	L	G	D	N	N	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	P	A	P	L	A	V	Q	D	A	I	A	V	R	L	A	E	Y	A	G	H	Q
Template Known Secondary structure		S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.