Job Description P0AD65 Confidence 97.80% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 86 Aligned Residues 231 % Identity 17% Template c3uo9B_ PDB info PDB header:hydrolase/hydrolase inhibitor Chain: B: PDB Molecule:glutaminase kidney isoform, mitochondrial; PDBTitle: crystal structure of human gac in complex with glutamate and bptes Resolution 2.30 Å

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		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	S	R	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	I	D	E	L	Y	E	S	A	K	K	Q	S	G	G	K	V	A	D	Y	I	P	Q	L	A	K	F	S	P	D	L	W	G	V	S	V	C	T	V	D	G	Q	R	H	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T					B				S	S					T	S		T	T									T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.											.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	T	Q	G	V	Y	P	P	A	S	T	V	K	P	Y	V	A	V	S	A	L	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	S	A	D
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	D	T	K	V	P	F	C	L	Q	S	C	V	K	P	L	K	Y	A	I	A	V	N	D	L	G	T	E	Y	V	H	R	Y	V	G	K	E	P	S	K	L	F	L	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	K	P	H	N	P	M	V	N	A	G	A	I	V	V	T	S	L
Template Known Secondary structure		.	S		S						G	G	G																						S			S					S	S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	S		S		T	T	S									T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		390	.												.	.	.	.	.	.	.	.																						400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	R	L	S	E	W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	Q	G	V	N	N	A	E	K	F	D	Y	V	M	Q	F	L	N	K	M	A	G	N	E	Y	V	G	F	S	N	A	T	F	Q	S	E	R	E	S	G	D	R	N	F	A	I	G	Y	Y	L	K	E	K	K	C	.	.	.	.	.	.	.	F	P	E	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S																	T	T	T																														T	T		.	.	.	.	.	.	.	S		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400								.	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	K	K	P	W	Y	Q	G	D	T	I	P	V	G	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	D	M	V	G	I	L	D	F	Y	F	Q	L	C	S	I	E	V	T	C	E	S	A	S	V	M	A	A	T	L	A	N	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	C	P	I	T	G	E	R	V	L	S	P	E	A	V	R	N	T	L	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.														T																	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	T			B		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Query SS confidence																																																																													.	.
Query Sequence		G	M	Y	G	V	A	N	R	P	N	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	.	.	N	G	G
Query Conservation																																																																													.	.
Alig confidence										.										.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.											.	.
Template Conservation										.										.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Sequence		L	M	H	S	C	G	M	Y	.	D	F	S	G	Q	F	A	F	H	.	.	.	V	G	L	P	A	K	S	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	L	L	V	V	P	.	.	.	N	V	M	G	M	M	C	W	S	P	P	L	D	K	M
Template Known Secondary structure							S	S	G	.	G	G								.	.	.	T		S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							T	.	.	.	T	T								S		B		T	T
Template Predicted Secondary structure										.										.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.		.	.	.	470	.	.	.	.	.				.	.	.	.	480	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	490	.	.	.				.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		596	.	.	.	600	.		.	.	.	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure								.
Query SS confidence								.
Query Sequence		A	G	P	A	V	G	.	T	L	M	R	Q	I	L	D	H	I
Query Conservation								.
Alig confidence								.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	S	V	K	G	I	H	F	C	H	D	L	V	S	L	C
Template Known Secondary structure		S	S	B														B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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