Job Description P0AD65 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 422 % Identity 26% Template c3ue3A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:septum formation, penicillin binding protein 3, PDBTitle: crystal structure of acinetobacter baumanni pbp3 Resolution 2.30 Å

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		61	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	V	P	I	A	P	S	R	G	I	I	Y	D	R	N	G	I	P	L	A	L	N	R	T	I	Y	Q	I	E	M	M	P	E	K	V	D	N	V	Q	Q	T	L	D	A	L	R	S	V	V	D	L	T	D	D	D	I	A	A	F	R	K	E	R	A	R	S	H	R	F	T	S	I	P	V	K	T	N	L	T	E
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	E	R	L	E	A	M	R	G	V	I	S	D	R	H	G	V	P	L	A	I	S	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
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		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	Q	V	A	R	F	A	V	N	Q	Y	R	F	P	G	V	E	V	K	G	Y	K	R	R	Y	Y	P	Y	G	S	A	L	T	H	V	I	G	Y	V	S	K	I	N	D	K	D	V	E	R	L	N	N	D	G	K	L	A	N	Y	A	A	T	H	D	I	G	K	L	G	I	E	R	Y	Y	E	D	V	L	H	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	M	K	I	V	Y	T	E	K	S	Y	K	R	Y	Y	P	Q	P	Q	P	N	A	Q	I	I	G	L	T	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	G	R	G	I	E	G	L	E	M	Q	L	N	T	R	L	A	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																S	S											B		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S		B		S						T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.								.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	T	G	Y	E	E	V	E	V	N	N	R	G	R	V	I	R	Q	L	K	E	V	P	P	Q	A	G	H	D	I	Y	L	T	L	D	L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	.	.	.	.	.	.	.	A	G	S	R	A	A	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D
Query Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	G	E	Q	K	I	K	V	S	E	V	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	E	V	E	S	G	E	N	I	T	L	S	I	D	S	R	L	Q	Y	I	M	Y	R	E	L	T	A	A	G	V	A	N	N	A	R	S	A	T	A	I	A	V	D	V	K	T	G	E	I	L	A	M	T	S	W	P	S	Y	N
Template Known Secondary structure		B														.	.	.	.	.	.	.	.			B							B	S																				T	T		S									T	T	T		B								S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.									.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.		.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.
Query SS confidence																																																															.
Query Sequence		P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N	R	A	T	Q	G	V	Y	P	P	A	S	T	V	K	P	Y	V	A	V	S	A	L	S	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	.	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K
Query Conservation																																																															.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.									.	.								.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.								.
Template Sequence		P	N	D	K	G	G	L	S	N	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	M	R	N	R	G	A	I	D	M	F	E	P	G	S	T	M	K	P	F	T	V	A	A	A	L	E	S	G	Q	Y	T	P	N	S	I	V	N	T	A	P	G	T	M	R	L	G	W	.	.	H	T	I	R	D	T	H	.
Template Known Secondary structure		T	T			S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S								B			G	G	G	G											T	T	S			T	T						T	T	S					T	T	.	.						S	S	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.								.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.												.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.			370	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	S	A	D	T	F	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	G	I	D	R	L	S	E	W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y	Q	G	D	T	I	P	V	G
Query Conservation
Alig confidence		.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	N	Y	G	A	L	T	L	T	G	I	I	V	K	S	S	N	V	G	S	A	K	L	A	L	S	L	P	K	E	A	L	P	S	F	F	R	R	A	G	F	G	Q	S	S	D	V	K	F	P	G	E	S	A	G	L	L	Y	S	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	N	S	S	Q	L	G	T	M	A
Template Known Secondary structure		.														T												S		T	T									T	T	T	T	S			T	T			T	T					B				G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G										T
Template Predicted Secondary structure		.																																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.									.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.		.	.	.	.	.	.	.	530	.
Predicted Secondary structure																																																																								.
Query SS confidence																																																																								.
Query Sequence		I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	.	A	N	R	P	N	G	T	A	H
Query Conservation																																																																								.
Alig confidence						.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.							.	.	.
Template Conservation						.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		Y	G	Y	G	.	L	N	A	T	I	L	Q	L	A	Q	G	Y	A	M	L	A	N	H	G	V	E	M	P	L	S	L	H	K	L	D	Q	V	P	E	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	L	D	P	K	I	A	D	Q	V	L	M	M	L	E	Q	V	T	L	P	G	G	T	A	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T		S	.	S	B	B													T	T	T	T						B	S	B			S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S																T	S	T	T		S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		448	.	450	.		.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.												.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.					.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	N	G	G	.	.	.	.	A	G	P	A	V	G	T	L	M	R	Q	I
Query Conservation																																																																		.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	Q	A	V	I	P	G	Y	R	V	G	G	K	T	G	T	A	H	K	L	R	A	D	R	K	G	Y	S	.	.	.	.	.	.	.	N	S	E	Y	R	A	L	F	A	G	V	A	P	V	S	D	P	R	L	A	M	I	V	V	V	E	N	P	Q	G	R	Y	Y	G	G	L	V	A	A	P	V	F	A	K	I
Template Known Secondary structure		G	G	G		B	T	T	B														T	T		S	S			.	.	.	.	.	.	.	S	S	S											T	T	S											S			S	S	S	S	S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540								.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	D	H	I	M	L	G	D	N	N	T	D	L	P	A	E	N	P	A
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.
Template Conservation											.	.	.
Template Sequence		M	Q	E	S	L	R	L	L	N	.	.	.	V	P	L	D	K	P	L
Template Known Secondary structure									T	T	.	.	.					S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.
Template SS confidence
		586	.	.	.	590	.	.	.	.				.	.	.	.	.	600	.