Job Description P0AD65 Confidence 97.64% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 92 Aligned Residues 242 % Identity 16% Template c3czdA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glutaminase kidney isoform; PDBTitle: crystal structure of human glutaminase in complex with l-glutamate Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	S	R	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	H	I	D	E	L	Y	E	S	A	K	K	Q	S	G	G	K	V	A	D	Y	I	P	Q	L	A	K	F	S	P	D	L	W	G	V	S	V	C	T	V	D	G	Q	R	H	S	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T									S	S					T	S		T	T									T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																									.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	T	Q	G	V	Y	P	P	A	S	T	V	K	P	Y	V	A	V	S	A	L	S	.	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	S	A	D	T	F	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.																																																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																							.																.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																							.	.	.	.	.
Template Sequence		.	D	T	K	V	P	F	C	L	Q	S	C	V	K	P	L	K	Y	A	I	A	V	N	D	L	G	T	E	Y	V	H	R	Y	V	G	K	E	P	S	.	.	.	.	.	G	L	R	L	F	L	N	E	D	D	K	P	H	N	P	M	V	N	A	G	A	I	V	V	T	S	L	I	K	Q	G	V	N	N	A	E
Template Known Secondary structure		.	S	T	T	S					G	G	G	G																			T	T	S		S	S			.	.	.	.	.	S							T	T	S	S		S		T	T	S											T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.																																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
			277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.						.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
						392	.	.	.	.	.	.	.																						400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	R	L	S	E	W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y	Q	G
Query Conservation		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	F	D	Y	V	M	Q	F	L	N	K	M	A	G	N	E	Y	V	G	F	S	N	A	T	F	Q	S	E	R	E	S	G	D	R	N	F	A	I	G	Y	Y	L	K	E	K	K	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	E	G	T	D	M	V
Template Known Secondary structure														T	T	T																														T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400																										.	.	.	.	.	.	.	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	T	I	P	V	G	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S	T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	A	N	R	P
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Sequence		G	I	L	D	F	Y	F	Q	L	C	S	I	E	V	T	C	E	S	A	S	V	M	A	A	T	L	A	N	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	C	P	I	T	G	E	R	V	L	S	P	E	A	V	R	N	T	L	S	L	M	H	S	C	G	M	Y	.
Template Known Secondary structure												T																	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		T	T	T			B		S																T	T	G	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template SS confidence
		409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590				.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.
Query Sequence		N	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E	R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	.	.	.	L	E	N	G	G	A	G	P	A	V	G	T	L
Query Conservation																																																																		.	.	.
Alig confidence											.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.									.	.	.
Template Conservation											.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Sequence		D	F	S	G	Q	F	A	F	H	.	.	.	V	G	L	P	A	K	S	G	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	I	L	L	V	V	P	.	.	.	N	V	M	G	M	M	C	W	S	P	P	L	D	K	M	G	N	S	V	K	G	I	H	F
Template Known Secondary structure		G	G								.	.	.	T		S						T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S							T	.	.	.	T	T								S				T	T	S	S	B
Template Predicted Secondary structure											.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template SS confidence
		467	.	.	470	.	.	.	.	.				.	.	.	.	480	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	490	.	.	.				.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		604	.	.	.	.	.	610	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	R	Q	I	L	D	H	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		C	H	D	L	V	S	L	C
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		518	.	520	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions