Job Description P0AD65 Confidence 99.31% Date Thu Jan 5 11:20:07 GMT 2012 Rank 66 Aligned Residues 233 % Identity 15% Template c3cjmA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative beta-lactamase; PDBTitle: crystal structure of putative beta-lactamase (np_815223.1) from2 enterococcus faecalis v583 at 1.50 a resolution Resolution 1.50 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.			.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.
Query SS confidence																		.	.
Query Sequence		K	L	Q	Q	Y	I	E	T	L	L	A	G	S	R	A	A	.	.	V	V	V	T	D	P	R	T	G	G	V	L	A	L	V	S	T	P	S	Y	D	P	N	L	F	V	D	G	I	S	S	K	D	Y	S	A	L	L	N	D	P	N	T	P	L	V	N	R	A	T	Q	G	V	Y	P	P	A	S	T	V	K	P
Query Conservation																		.	.
Alig confidence																		.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	N	D	L	L	V	A	S	V	K	E	F	E	G	T	V	G	I	S	Y	L	D	L	E	T	G	E	Q	R	S	V	N	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	F	Y	T	A	S	T	I	K	V
Template Known Secondary structure															S	S									T	T	T							S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.
		335	.	.	.	.	340				.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.					.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.																																															.	.	.	.															.
Query SS confidence								.	.	.																																															.	.	.	.															.
Query Sequence		Y	V	A	V	S	A	.	.	.	L	S	A	G	V	I	T	R	N	T	T	L	F	D	P	G	W	W	Q	L	P	G	S	E	K	R	Y	R	D	W	K	K	W	G	H	G	R	L	N	V	T	R	S	L	E	E	.	.	.	.	S	A	D	T	F	F	Y	Q	V	A	Y	D	M	G	.	I	D	R	L	S	E
Query Conservation								.	.	.																																															.	.	.	.															.
Alig confidence								.	.	.																																	.	.	.												.	.	.	.															.
Template Conservation																																											.	.	.
Template Sequence		P	L	T	X	L	V	A	D	T	V	A	S	G	Q	K	K	W	T	D	L	I	P	Y	N	A	E	E	D	Y	E	E	G	T	G	I	I	A	Y	N	I	Q	.	.	.	P	E	Y	P	L	K	T	L	Q	E	Y	A	I	T	Y	S	D	N	I	A	K	N	X	L	Y	D	T	L	G	G	D	A	K	A	K	R
Template Known Secondary structure													T	T	S			T	T														S	S		S	G	G	G	S			.	.	.	S														T													T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Template SS confidence
		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.				.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	M	G	K	F	G	Y	G	H	Y	T	G	I	D	L	A	E	E	R	S	G	N	M	P	T	R	E	W	K	Q	K	R	F	K	K	P	W	Y	Q	G	D	T	I	P	V	G	I	G	Q	G	Y	W	T	A	T	P	I	Q	M	S	K	A	L	M	I	L	I	N	D	G	I	V	K	V	P	H	L	L	M	S
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	X	Y	Q	R	Y	L	H	K	T	P	S	I	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	F	S	S	E	D	A	L	V	I	L	Q	K	L	Y	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	S					S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		487	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	E	D	G	K	Q	V	P	W	V	Q	P	H	E	P	P	V	G	D	I	H	S	G	Y	W	E	L	A	K	D	G	M	Y	G	V	A	N	R	P	N	G	T	A	H	K	Y	F	A	S	A	P	Y	K	I	A	A	K	S	G	T	A	Q	V	F	G	L	K	A	N	E	T	Y	N	A	H	K	I	A	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	T	K	P	D	Y	Q	A	I	Y	D	S	X	K	Q	S	V	F	H	E	R	X	.	.	.	.	.	E	T	P	T	T	Q	G	K	V	A	H	K	I	G	S	Y	D	E	F	I	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T													S		S				T	T	.	.	.	.	.			T	T	T	T	T	S									T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.						.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
		567	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.				.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.
Query Sequence		R	L	R	D	H	K	L	M	T	A	F	A	P	Y	N	N	P	Q	V	A	V	A	M	I	L	E	N	G	G	.	.	.	A	G	P	A	V	G	T	L	M	R	Q	I	L	D	H	I	M	L	G	D	N	N
Query Conservation																															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.											.												.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	D	X	G	I	L	E	T	P	H	P	.	F	A	L	A	I	F	T	K	G	P	D	N	A	K	S	A	A	F	I	A	S	V	T	D	K	L	W	Q	L	Q	V	S	E	Y	P	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.							S	S	S		.										S																							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
									267	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions