Job Description P39389 Confidence 99.76% Date Thu Jan 5 12:00:20 GMT 2012 Rank 212 Aligned Residues 375 % Identity 13% Template d2v1pa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 1.9

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		P	V	P	P	M	T	R	P	V	Q	R	P	V	E	I	T	Q	W	D	Q	V	L	D	M	L	E	A	H	S	D	S	S	I	V	P	L	S	K	S	T	P	D	V	E	A	P	S	L	K	P	L	.	W	R	E	L	S	R	V	V	Q	H	N	L	Q	T	V	L	G	Y	D	L	L	A	G	Q	R	V	L	R
Query Conservation																																																					.
Alig confidence																																																					.										.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.
Template Sequence		P	E	P	F	R	I	R	V	I	E	P	V	K	R	T	T	R	A	Y	R	E	E	A	I	I	K	S	G	M	N	P	F	L	L	D	S	E	D	V	F	I	D	L	L	T	D	S	G	T	G	A	V	T	Q	S	M	Q	A	A	M	M	.	.	.	R	G	D	E	A	F	S	G	S	R	S	Y	Y	A	L	A
Template Known Secondary structure				S	S																							T	T	S		G	G	G	S		G	G	G		S				S			T	T		S										T	T	.	.	.	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.				.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.										.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Q	I	A	R	L	M	L	D	S	G	S	V	V	T	A	D	D	I	I	I	T	S	G	C	H	N	S	M	S	L	A	L	M	A	V	C	K	P	G	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	V	E	S	P	C	Y	Y	G	S	M	Q	M	L	R	G	M	G	V	K	V	I	E	I	P	T	D	P
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	S	V	K	N	I	F	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	Q	Y	T	I	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	Q	I	Y	I	P	V	L	I	K	K	R	E	Q	E	K	G	L	D	R	S	K	M	V	A	F	S	N	Y	F	F	D	T	T	Q	G	H	S	Q	I	N	G	C	T	V	R	N	V	Y	I	K	E
Template Known Secondary structure								T			.	.	.	.	.	.	.	S							S	S	T	T	T																				T	T	T						S	S												T	T							B		T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.								.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
												224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.			.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.		.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.													.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.													.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	G	I	S	V	E	A	L	E	L	A	L	E	Q	W	P	I	K	.	.	G	I	I	L	V	P	N	C	N	N	P	L	.	G	F	I	M	P	D	A	R	K	R	A	V	L	S	L	A	Q	R	H	D	I	V	I	F	E	D	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.													.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.													.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	D	T	G	V	R	Y	D	F	K	G	N	F	D	L	E	G	L	E	R	G	I	E	E	V	G	P	N	N	V	P	Y	I	V	A	T	I	T	S	N	S	A	G	G	Q	P	V	S	L	A	N	L	K	A	M	Y	S	I	A	K	K	Y	D	I	P	V	V	M	D	S	A	R	F	A	E	N	A	Y	F
Template Known Secondary structure		T	T		T	T	S			T	T	T	T		B														G	G	G								S	S	B		G	G	G		B																	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
				283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.		.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																												.																		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																												.																		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	Y	G	E	L	A	T	E	Y	P	R	P	R	T	I	H	S	W	D	I	D	G	R	V	L	L	C	S	S	F	S	K	S	I	A	P	G	L	R	V	G	W	V	A	.	P	G	R	Y	H	D	K	L	M	H	M	K	Y	A	I	S	S	.	.	.	.	.	.	.	F	N	V	P	S	T	Q	M	A	A
Query Conservation		.	.																																												.																		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																												.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	K	Q	R	E	A	E	Y	K	D	W	T	I	E	Q	I	T	R	E	T	Y	K	Y	A	D	M	L	A	M	S	A	K	K	D	A	M	V	P	M	G	G	L	L	C	M	K	D	D	S	F	F	D	V	Y	T	E	C	R	T	L	V	V	Q	E	G	F	P	T	Y	G	G	L	E	G	G	A	M	E	R	L
Template Known Secondary structure							G	G	G	T	T	S										G	G	G		S						S	S	S	T	T			S	S								S	G	G	G													T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.									.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420		.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.																.
Query Sequence		A	T	F	V	L	E	G	H	Y	H	R	H	I	R	R	M	R	Q	I	Y	Q	R	N	L	A	L	Y	T	C	W	I	R	E	Y	F	P	C	E	I	C	I	T	R	P	K	G	G	F	L	L	W	I	E	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	E	Q	V	D	M	V	C	V	A	R	Q	L	C	.	R	M	K
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.																.
Alig confidence																					.	.	.	.												.	.	.			.	.													.	.	.	.	.	.	.	.																.
Template Conservation																					.	.	.	.												.	.	.			.	.
Template Sequence		A	V	G	L	Y	D	G	M	N	L	D	W	L	A	Y	R	I	A	Q	.	.	.	.	V	Q	Y	L	V	D	G	L	E	E	I	.	.	.	G	V	.	.	V	Q	Q	A	G	G	H	A	A	F	V	D	A	G	K	L	L	P	H	I	P	A	D	Q	F	P	A	Q	A	L	A	C	E	L	Y	K	V	A	G
Template Known Secondary structure								T	T												.	.	.	.											T	.	.	.	T		.	.						S	S										S	T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.												.	.	.			.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.					.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.				.	350			.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		424	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.										.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.			450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Query Sequence		I	Q	V	A	A	G	S	I	F	S	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	Y	R	N	C	L	R	I	N	C	A	L	P	.	.	L	S	E	T	Y	R	E	A	L	K	Q	I	G	E	A	V	Y	R
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	K	T	G	K	Q	L	P	C	P	A	E	L	L	R	L	T	I	P	R	A	T	Y	T	Q	T	H	M	D	F	I	I	E	A	F	K	H	V	K	E	N
Template Known Secondary structure								S						B		T	T	T		S	B				S										T	T	T																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.