Job Description P39389 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:00:20 GMT 2012 Rank 71 Aligned Residues 376 % Identity 14% Template d2hoxa1 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases AAT-like Resolution 1.40

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		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.								.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	A	Y	Q	T	L	E	T	M	K	L	I	T	P	Q	P	R	S	G	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	V	A	Q	R	K	A	Q	P	P	V	P	P	M	T	R	P	V	Q	R	P	V	E	I	T	Q	W	D	Q	V	L	D	M	L	E	A	H	S	D	S	S	I	V	P	L	S	K	S	T	P	D	V
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.											.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	K	A	A	E	E	A	E	A	.	.	.	V	A	N	I	N	C	S	E	H	G	R	A	F	L	D	G	I	I	S	E	G	S	P	K	C	E	C	N	T	C	Y	T	G	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	S	E	K	I	Q	G	C	S	A	D	V	A	S	G	D	G	L	F
Template Known Secondary structure											.	.	.			T	S			G	G	G					T	T	S				T	T								T	T			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S					T	T							S				G	G
Template Predicted Secondary structure											.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.				.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.															50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
		117	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.			.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.																										.
Query SS confidence																															.	.																										.
Query Sequence		E	A	P	S	L	K	P	L	W	R	E	L	S	R	V	V	Q	H	N	L	Q	T	V	L	G	Y	D	L	L	.	.	A	G	Q	R	V	L	R	E	Q	I	A	R	L	M	L	D	S	G	S	V	V	T	A	D	D	.	I	I	I	T	S	G	C	H	N	S	M	S	L	A	L	M	A	V	C	K	P	G	D
Query Conservation																															.	.																										.
Alig confidence																															.	.																										.
Template Conservation
Template Sequence		L	E	E	Y	W	K	Q	H	K	E	A	S	A	V	L	V	S	P	W	H	R	M	S	Y	F	F	N	P	V	S	N	F	I	S	F	E	L	E	K	T	I	K	E	L	H	E	V	V	G	N	A	A	A	K	D	R	Y	I	V	F	G	V	G	V	T	Q	L	I	H	G	L	V	I	S	L	S	P	N	M	T
Template Known Secondary structure		G					T	T	S										T	T	T	T		S	S	S		S	S			T	T																	T		B			T	T							S														S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		194									.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	V	E	S	P	C	Y	Y	G	S	M	Q	M	L	R	G	M	G	V	K	V	I	E	I	P	T	D	P	E	T	G	I	S	V	E	A	L	E	L	A	L	E	Q	W	P	I	K	G	I	I	L	V	P	N	C	N	N	P	L	G	F	I	M	P	D	A	R	K	R	A
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	P	D	A	P	E	S	K	V	V	A	H	A	P	F	Y	P	V	F	R	E	Q	T	K	Y	F	D	K	K	G	Y	V	W	A	.	.	.	.	.	.	G	N	A	A	N	Y	V	N	V	S	N	P	E	Q	.	.	Y	I	E	M	V	T	S	P	N	N	P	E	G	L	L	R	H	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T		T	T	S									S	S												S			T	T					.	.	.	.	.	.			G	G	G	G	T	T		S		G	G	G	.	.							S	S		T	T	T						.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.															.	.																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.							.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.			.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.			.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.												.	.
Query SS confidence																																																					.												.	.
Query Sequence		V	L	S	L	A	Q	R	H	D	I	V	I	F	E	D	D	V	Y	G	E	L	A	T	E	Y	P	R	P	R	T	I	H	S	W	D	I	D	G	R	V	L	L	C	S	S	F	S	K	S	I	A	.	P	G	L	R	V	G	W	V	A	P	G	.	.	R	Y	H	D	K	L	M	H	M	K	Y	A	I	S	S
Query Conservation																																																					.												.	.
Alig confidence		.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.															.												.	.
Template Conservation		.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	V	I	K	G	C	K	S	I	Y	D	M	V	Y	Y	W	P	H	Y	T	P	I	K	Y	K	A	.	.	.	.	.	.	.	D	E	D	I	L	L	F	T	M	S	K	F	T	G	H	S	G	S	R	F	G	W	A	L	I	K	D	E	S	V	Y	N	N	L	L	N	Y	M	T	K	N	T	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		S	S	T	T								T	T		S	T	T	T	S				S		B	.	.	.	.	.	.	.			S										T	S		G	G	G																								T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240								.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.										.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.													.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	N	V	P	S	T	Q	M	A	A	A	T	F	V	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	H	Y	H	R	H	I	R	R	M	R	Q	I	Y	Q	R	N	L	A	L	Y	T	C	W	I	R	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	P	C	E	I	C	I	T	R	P	K	G	G	F	L
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	P	R	E	T	Q	L	R	S	L	K	V	L	K	E	V	V	A	M	V	K	T	Q	K	G	T	M	R	D	L	N	T	F	G	F	K	K	L	R	E	R	W	V	N	I	T	A	L	L	D	Q	S	D	R	F	S	Y	Q	E	L	P	Q	S	E	Y	C	N	Y	F	R	R	M	R	P	P	S	P	S	Y
Template Known Secondary structure		S																								T	T	S	T	T	S																					T	T	S	S	S								S					T	T	T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	W	I	E	L	P	E	Q	V	D	M	V	C	V	A	R	Q	L	C	R	M	K	I	Q	V	A	A	G	S	I	F	S	A	S	G	K	Y	R	N	C	L	R	I	N	C	A	L	P	L	S	E	T	Y	R	E	A	L	K	Q	I	G	E	A	V	Y
Query Conservation
Alig confidence										.																							.	.	.														.
Template Conservation										.																							.	.	.														.
Template Sequence		A	W	V	K	C	E	W	E	.	E	D	K	D	C	Y	Q	T	F	Q	N	G	R	I	N	T	Q	N	G	V	G	F	.	.	.	E	A	S	S	R	Y	V	R	L	S	L	I	K	.	T	Q	D	D	F	D	Q	L	M	Y	Y	L	K	D	M	V	K
Template Known Secondary structure								S	G	.	G	G		S								T	T						G	G	G	G	.	.	.	T	S		T	T							S	S	.																	T
Template Predicted Secondary structure										.																							.	.	.														.
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.		.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.				.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.