Job Description P39389 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:00:20 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 420 % Identity 17% Template c2zy3A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:l-aspartate beta-decarboxylase; PDBTitle: dodecameric l-aspartate beta-decarboxylase Resolution 2.50 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.		.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		T	L	L	A	E	R	I	E	Q	G	L	Y	R	H	G	E	K	L	P	S	V	R	S	L	S	Q	E	H	G	.	V	S	I	S	T	V	Q	Q	A	Y	Q	T	L	E	T	M	K	L	I	T	P	Q	P	R	S	G	Y	F	V	A	Q	R	K	A	Q	P	P	V	P	P	M	T	R	P	V	Q	R	P	V	E
Query Conservation																															.
Alig confidence																															.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	N	R	L	M	L	N	A	G	R	G	N	P	N	F	L	A	T	T	P	R	R	A	F	F	R	L	G	L	F	A	A	A	E	S	E	L	S	Y	S	Y	M	T	T	V	G	V	G	G	L	A	K	I	D	G	I	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																S																							T	T			S			S	S								S	T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.					.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.
Query Sequence		I	T	Q	W	D	Q	V	L	D	M	L	E	A	H	S	D	S	S	I	V	P	L	S	K	S	T	P	D	V	E	A	P	S	L	K	P	L	W	R	E	L	S	R	V	V	Q	H	N	L	Q	T	V	L	G	Y	D	L	L	A	G	Q	R	V	L	R	E	Q	I	A	R	L	M	L	D	S	.	.	.	.	G
Query Conservation																																																																													.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																																																							.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	R	F	E	R	Y	I	A	E	N	R	D	Q	E	G	V	R	F	L	G	K	S	L	S	Y	V	R	D	Q	L	G	L	D	P	A	A	F	L	H	E	M	V	D	G	I	L	G	C	N	Y	P	V	P	P	R	M	L	N	I	S	E	K	I	V	R	Q	Y	I	I	R	E	M	G	A	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.									T	T	T	S																T	S																	T		S			S	S	T	T																	T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.						.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.			.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.			.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																					.	.																			.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.																					.	.																			.	.
Query Sequence		S	V	V	T	A	D	D	I	I	I	T	S	G	C	H	N	S	M	S	L	A	L	M	A	V	.	.	.	.	.	C	K	P	G	D	I	V	A	V	E	S	P	C	Y	Y	G	S	M	Q	M	.	.	L	R	G	M	G	V	K	V	I	E	I	P	T	D	P	E	T	G	.	.	I	S	V	E	A	L	E	L
Query Conservation																											.	.	.	.	.																					.	.																			.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.																					.	.																			.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	S	E	S	V	N	L	F	A	V	E	G	G	T	A	A	M	A	Y	I	F	E	S	L	K	L	N	G	L	L	K	A	G	D	K	V	A	I	G	M	P	V	F	T	P	Y	I	E	I	P	E	L	A	Q	Y	A	L	E	E	V	A	I	N	A	D	P	S	L	N	W	Q	Y	P	D	S	E	L	D	K
Template Known Secondary structure		S		G	G	G							S																T	T	S	S		T	T								S			T					S	T	T	S	T	T	T										B	G	G	G	T	S	B							G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.			.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.
Query SS confidence																																									.	.
Query Sequence		A	L	E	Q	W	P	I	K	G	I	I	L	V	P	N	C	N	N	P	L	G	F	I	M	P	D	A	R	K	R	A	V	L	S	L	A	Q	R	H	.	.	D	I	V	I	F	E	D	D	V	Y	G	E	L	A	T	E	Y	P	R	P	R	T	I	H	S	W	D	I	D	G	R	V	L	L	C	S	S	F	S
Query Conservation																																									.	.
Alig confidence				.										.																											.	.																							.	.	.	.
Template Conservation				.										.																																																			.	.	.	.
Template Sequence		L	K	.	D	P	A	I	K	I	F	F	C	.	V	N	P	S	N	P	P	S	V	K	M	D	Q	R	S	L	E	R	V	R	N	I	V	A	E	H	R	P	D	L	M	I	L	T	D	D	V	Y	G	T	F	A	D	D	F	Q	S	L	F	A	.	.	.	.	I	C	P	E	N	T	L	L	V	Y	S	F	S
Template Known Secondary structure		G	G	.		T	T							.		S	S		S	S	S		B																	T		T	T								T	T	G	G	G	S	S	S							.	.	.	.			G	G	G							S	T
Template Predicted Secondary structure				.										.																																																			.	.	.	.
Template SS confidence
		241	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.					.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		313	.	.	.		.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure						.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	S	I	A	.	P	G	L	R	V	G	W	V	A	P	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	D	K	L	M	H	M	K	Y	A	I	S	S	F	N	V	P	S	T	Q	M
Query Conservation						.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	F	G	A	T	G	W	R	L	G	V	V	A	A	H	Q	Q	N	V	F	D	L	A	L	D	K	L	Q	E	S	E	K	V	A	L	D	H	R	Y	R	S	L	L	P	D	V	R	S	L	K	F	I	D	R	L	V	A	D	S	R	A	V	A	L	N	H	T	A	G	L	S	T	P	Q	Q	V	Q	M	A
Template Known Secondary structure		T	T	T	T		G	G	G									S	S									S	S												T	T	T	T		S		G	G	G											T	T	T	T	T	T	G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	A	T	F	V	L	E	G	H	Y	H	R	H	I	R	R	M	R	Q	I	Y	Q	R	N	L	A	L	Y	T	C	W	I	R	E	Y	F	P	C	E	I	C	I	T	R	P	K	G	G	F	L	L	W	I	E	L	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	D	M	V	C
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		L	F	S	L	F	A	L	M	D	E	A	D	E	Y	K	H	T	L	K	Q	L	I	R	R	R	E	T	T	L	Y	R	E	L	G	M	P	P	L	R	.	.	.	.	D	E	N	A	V	D	Y	Y	T	L	I	D	L	Q	D	V	T	A	K	L	Y	G	E	A	F	S	E	W	A	V	K	Q	S	S	T	G	D
Template Known Secondary structure											T	T																			T	T	T	T	T	S					.	.	.	.		T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.					.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		415	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		V	A	R	Q	L	C	R	M	.	K	I	Q	V	A	A	G	S	I	F	S	A	S	G	K	Y	R	N	C	L	R	I	N	C	A	L	P	L	S	E	T	Y	R	E	A	L	K	Q	I	G	E	A	V	Y	R
Query Conservation										.
Alig confidence										.												.	.	.
Template Conservation																						.	.	.
Template Sequence		M	L	F	R	I	A	D	E	T	G	I	V	L	L	P	G	R	G	F	G	.	.	.	S	N	R	P	S	G	R	A	S	L	A	N	L	N	E	Y	E	Y	A	A	I	G	R	A	L	R	K	M	A	D	E
Template Known Secondary structure											S								S	S		.	.	.	T	T	S							S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490				.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.