Job Description P0ABH0 Confidence 99.28% Date Thu Jan 5 11:15:29 GMT 2012 Rank 43 Aligned Residues 354 % Identity 14% Template c3gbtA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:gluconate kinase; PDBTitle: crystal structure of gluconate kinase from lactobacillus acidophilus Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		K	L	V	V	G	L	E	I	G	T	A	K	V	A	A	L	V	G	E	V	L	P	D	G	M	V	N	I	I	G	V	G	S	C	P	S	R	G	M	D	K	G	G	V	N	.	D	L	E	S	V	V	K	C	V	Q	R	A	I	D	Q	A	E	L	M	A	D	C	Q	I	S	S	V	Y	L	A	L	S	G	K
Query Conservation																																															.
Alig confidence																					.	.																									.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		K	Y	I	I	G	X	D	V	G	T	T	A	T	K	G	V	L	Y	D	.	.	I	N	G	K	A	V	A	S	V	S	K	G	Y	P	L	I	Q	T	K	V	G	Q	A	E	E	D	P	K	L	I	F	D	A	V	Q	E	I	I	F	D	L	T	Q	K	I	D	G	K	I	A	A	I	S	W	S	S	Q	X	H
Template Known Secondary structure											S	S									.	.	T	T	S													B		S	S	T	T																							T		S	S											S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20			.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.										.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	I	S	C	Q	N	E	I	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	I	S	E	E	E	V	T	Q	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	N	V	V	H	T	A	K	S	V	R	V	R	D	E	H	R	V	L	H	V	I	P	Q	E	Y	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	L	I	G	L	G	S	D	D	E	L	L	T	N	S	I	T	W	A	D	N	C	A	K	S	I	V	Q	D	A	K	N	R	G	F	A	Q	Q	I	Y	R	K	T	G	X	P	X	H	P	X	A	P	I	Y	K	L	L	W	L	K	N	K	K	T	E	V	F	S	Q	A	Q	K	W	I	G	I	K	E	Y	I
Template Known Secondary structure			B					T	T	S		B	S	S					T	T			T	T										T	T													S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.		.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	D	Y	Q	E	G	I	K	N	P	.	V	G	L	S	G	V	R	M	Q	A	K	V	H	L	I	T	C	H	N	D	M	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	I	V	K	A	V	E	R	C	G	L	K	V	D	Q	L	I	F	A	G	L	A	S	S	Y
Query Conservation												.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	F	R	L	T	G	K	L	V	T	D	T	T	X	A	A	G	T	G	I	L	N	L	K	T	L	T	W	D	Q	E	L	L	D	I	L	K	I	K	K	E	Q	L	P	K	I	A	Q	P	T	K	V	I	F	P	I	K	T	E	Y	V	K	K	L	G	I	D	S	D	T	K	I	I	L	G	A	S	D	G	Y
Template Known Secondary structure							S										T	T	T	T		B		T	T	T	S	S	B									T			G	G	G	S						T	T														T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		195	.	.	.	.	200	.		.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	L	T	E	D	E	.	R	E	L	G	V	C	V	V	D	I	G	G	G	T	M	D	I	A	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	G	A	L	R	H	T	K	V	I	P	Y	A	G	N	V	V	T	S	D	I	A	Y	A	F	G	T	P	P	S	D	A	E	A	I
Query Conservation									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	T	I	G	V	N	A	I	D	S	D	H	C	A	L	N	V	G	T	S	G	A	I	R	T	I	V	D	Q	P	K	I	D	P	S	A	S	Y	F	C	Y	P	A	D	K	T	H	Y	L	L	G	G	P	V	N	N	G	G	I	V	F	N	W	A	R	Q	T	L	F	D	A	D	E	T	P	Q	D	F	L
Template Known Secondary structure						T	T	T			S	T	T							S	S	S								S	S					T	T			S							T	T									S		S												T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.													290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	R	H	G	C	A	L	G	S	I	V	G	K	D	E	S	V	E	V	P	S	V	G	G	R	P	P	R	S	L	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	T	L	A	E	V	I	E	P	R	Y	T	E	L	L	N	L	V	N	E	E	I	L	Q	L	Q	E	K	L	R	Q	Q	G	V	K
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	.	.	.	.	A	Q	T	A	P	A	G	S	R	N	L	I	F	L	P	Y	L	G	G	E	R	A	P	I	W	D	A	N	A	R	G	S	F	V	G	L	T	R	X	H	Q	K	P	E	X	A	R	A	V	I	E	G	I	I	F	N	L	Y	D	A	A	S	N	L	I	K	N	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.			T	S		T	T	G	G	G							T	T		B		T	T	T		B	T	T							S			T	T																											T	T	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		320	.					.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		326	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	H	L	A	A	G	I	V	L	T	G	G	A	A	Q	I	E	G	L	A	A	C	A	Q	R	V	F	H	T	Q	V	R	I	G	A	P	L	N	I	T	G	L	T	D	Y	A	Q	E	P	Y	Y	S	T	A	V	G	L	L	H	Y	G	K
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	K	K	P	V	A	I	N	A	T	G	G	F	L	K	S	D	F	V	R	Q	L	C	A	N	I	F	N	V	P	I	V	T	X	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Q	Q	S	G	T	L	A	A	X	F	L	A	R
Template Known Secondary structure		S				S						S	G	G	G		S												T	S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.														.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.