Job Description P0ABH0 Confidence 99.14% Date Thu Jan 5 11:15:29 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 349 % Identity 14% Template c3flcX_ PDB info PDB header:transferase Chain: X: PDB Molecule:glycerol kinase; PDBTitle: crystal structure of the his-tagged h232r mutant of glycerol kinase2 from enterococcus casseliflavus with glycerol Resolution 1.85 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.		.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80				.
Predicted Secondary structure																																																.																														.	.	.
Query SS confidence																																																.																														.	.	.
Query Sequence		D	R	K	L	V	V	G	L	E	I	G	T	A	K	V	A	A	L	V	G	E	V	L	P	D	G	M	V	N	I	I	G	V	G	S	C	P	S	R	G	M	D	K	G	G	V	.	N	D	L	E	S	V	V	K	C	V	Q	R	A	I	D	Q	A	E	L	M	A	D	C	Q	I	S	S	V	Y	.	.	.	L
Query Conservation																																																.																														.	.	.
Alig confidence																					.	.																										.																														.	.	.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		E	K	N	Y	V	M	A	I	D	Q	G	T	T	S	S	R	A	I	I	.	.	F	D	R	N	G	K	K	I	G	S	S	Q	K	E	F	P	Q	Y	F	P	K	S	G	W	V	E	H	N	A	N	E	I	W	N	S	V	Q	S	V	I	A	G	A	F	I	E	S	G	I	R	P	E	A	I	A	G	I	G	I
Template Known Secondary structure													S	S							.	.			T	T	S													B		S	S	T	T																												G	G	G
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.			.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.														.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.																							.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	S	G	K	H	I	S	C	Q	N	E	I	G	M	V	P	I	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	V	T	Q	E	D	V	E	N	V	V	H	T	A	K	S	V	R	V	R	D	E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	Q	R	E	T	T	V	V	W	D	K	T	T	G	Q	P	I	A	N	A	I	V	W	Q	S	R	Q	S	S	P	I	A	D	Q	L	K	V	D	G	H	T	E	M	I	H	E	K	T	G	L	V	I	D	A	Y	F	S	A	T	K	V	R	W	L	L	D	N	I	E	G	A	Q	E	K	A	D	N	G	E
Template Known Secondary structure					S	S							T	T	T			B	S	S					T	T			T	T										T	T										S					T	T	S												S	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.				.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	H	V	I	P	Q	E	Y	A	I	D	Y	Q	E	G	.	.	.	I	K	N	P	V	G	L	S	G	V	R	M	Q	A	K	V	H	L	I	T	C	H	N	D	M	A	K	N	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	A	V	E	R	C	G	L	K	V
Query Conservation																		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	F	G	T	I	D	S	W	L	V	W	K	L	T	D	G	Q	V	H	V	T	D	Y	S	N	A	S	R	T	M	L	Y	N	I	H	K	L	E	W	D	Q	E	I	L	D	L	L	N	I	P	S	S	M	L	P	E	V	K	S	N	S	E	V	Y	G	H	T	R	S	Y	R	F	Y	G	S	E	V	P	I
Template Known Secondary structure																T	T	T	S											T	T	T	S			T	T	T	T										T	T			G	G	G							S									G	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	Q	L	I	F	A	G	L	A	S	S	Y	S	V	L	T	E	D	E	R	E	L	G	V	C	V	V	D	I	G	G	G	T	M	D	I	A	V	Y	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	A	L	R	H	T	K	V	I	P	Y	A	G	N	V	V	T	S	D	I
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.
Template Sequence		A	G	M	A	G	D	Q	Q	A	A	L	F	G	Q	M	A	F	E	K	G	M	.	.	.	I	K	N	T	Y	G	T	G	A	F	I	V	M	N	T	G	E	E	P	L	S	D	N	D	L	L	T	T	I	G	Y	G	I	N	G	K	V	Y	Y	A	L	E	G	S	I	F	V	A	G	S	A	I	Q	W	L	R
Template Known Secondary structure															T	T			S	T	T		.	.	.						S	S	S									T						T	T	S									T	T											S		S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.				.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.																.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	A	F	G	T	P	P	S	D	A	E	A	I	K	V	R	H	G	C	A	L	G	S	I	V	G	K	D	E	S	V	E	V	P	S	V	G	G	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	S	L	Q	R	Q	T	L	A	E	V	I	E	P	R	Y	T	E	L	L	N	L	V
Query Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template Sequence		D	G	L	R	M	I	E	T	S	P	Q	S	E	E	.	.	.	.	.	.	L	A	A	K	A	K	G	D	N	E	V	Y	V	V	P	A	F	T	G	L	G	A	P	Y	W	D	S	E	A	R	G	A	V	F	G	L	T	R	G	T	T	K	E	D	.	.	.	F	V	R	A	T	L	Q	A	V	A	Y	Q	S
Template Known Secondary structure			T	S			S	S	S	T	T					.	.	.	.	.	.							S		S								T	T		B		T	T	T		B	T	T										T	T						.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.																																													.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.							.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	E	E	I	L	Q	L	Q	E	K	L	R	Q	Q	G	V	K	H	H	L	A	A	G	I	V	L	T	G	G	A	A	Q	I	E	G	L	A	A	C	A	Q	R	V	F	H	T	Q	V	R	I	G	A	P	L	N	I	T	G	L	T	D	Y	A	Q	E	P	Y	Y	S	T	A	V	G	L	L	H	Y	G	K
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	D	V	I	D	T	M	K	K	D	S	.	.	.	.	.	.	G	I	D	I	P	L	L	K	V	D	G	G	A	A	K	N	D	L	L	M	Q	F	Q	A	D	I	L	D	I	D	V	Q	R	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	E	T	T	A	L	G	A	A	Y	L	A	G
Template Known Secondary structure													.	.	.	.	.	.											S	G	G	G	G													T	S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400							.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.														.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.