Job Description P76577 Confidence 98.64% Date Thu Jan 5 12:24:46 GMT 2012 Rank 67 Aligned Residues 247 % Identity 21% Template d1w79a1 SCOP info beta-lactamase/transpeptidase-like beta-lactamase/transpeptidase-like Dac-like Resolution 1.8

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		A	G	L	Q	R	R	L	E	E	L	A	Q	N	W	K	G	R	L	P	P	R	S	S	L	A	M	I	V	V	D	H	T	D	M	R	V	R	G	W	V	G	S	V	D	L	N	D	D	S	R	F	G	H	V	D	M	V	N	S	I	R	S	P	G	S	V	L	K	P	F	V	Y	G	L	A	L	D	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence														.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation														.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	E	L	R	E	D	I	D	A	I	L	E	.	.	.	D	P	A	L	E	G	A	V	S	G	V	V	V	V	D	T	A	T	G	E	E	L	Y	S	R	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	Q	L	L	P	A	S	N	M	K	L	F	T	A	A	A	A	L	E	V	L	G
Template Known Secondary structure												T	T	.	.	.		G	G	G	T	T										T	T	T								S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T			B			G	G	G													T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.				.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.																.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
																																																								355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	I	H	P	A	S	L	L	Q	D	V	P	R	R	T	G	D	Y	R	P	G	N	F	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	H	S	F	G	T	E	V	A	A	E	S	A	P	G	R	R	G	E	V	Q	D	L	Y	L	V	G	R	G	D	P	T	L	S	A	E	D	L	D	A	M	A	A	E	V	A	A	S	G	V	R	T	V	R	G	D	L	Y	A	D	D	T	W	F	D	S	E	R	L	V	D	D	W	W	P	E	D	E	P
Template Known Secondary structure		T	T										S	S				T	T	S			S								S		T	T																T	T						S							T	T	S		S			S		T	T	S		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		381	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	Y	S	A	Q	I	S	A	L	T	V	A	H	G	E	R	F	D	T	G	V	T	E	V	S	V	T	P	A	A	E	G	E	P	A	D	V	D	L	G	A	A	E	G	Y	A	E	L	D	N	R	A	V	T	G	A	A	G	S	A	N	T	L	V	I	D	R	P	V	G	T	N	T	I	A	V	T	G	S
Template Known Secondary structure		B	G	G	G					S	S					T	T	T	T			S										S	T	T	S	B						G	G	G	T	T	T	S											T	T											T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
																																						384	.	.	.	.																										.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	P	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	S	E	A	L	V	R	S	L	N	L	P	A	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	A	D	A	A	P	V	T	A	L	R	T	V	D	E	P	A	A	L	A	G	H	L	F	E	E	A	L	E	S	N	G	V	T	V	K	G	D	V	G	L	G	G	V	P	A	D	W	Q	D	A	E	V	L	A	D	H	T	S	A	E	L	S	E	I	L	V	P	F	M	K	F	S	N	N	G	H	A	E
Template Known Secondary structure				T	T	S										S																	T	T					S									S			T	T																							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.													410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.		.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Query Sequence		Q	V	L	E	A	Y	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	R	F	A	A	K	L	R	N	V	G	L	.	P	L	Y	L	P	N	G	A	A	P	N	L	S	L	I	L	G	G	A	G	A	K	L	E	D	M	A	A	A	Y	T	A	F	A	R	H	G	K	A	G	K	L	R	L	Q	P	D
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.														.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	L	V	K	S	I	G	Q	E	T	A	G	A	G	T	W	D	A	G	L	V	G	V	E	E	A	L	S	G	L	G	V	D	T	A	G	L	V	L	N	D	G	S	G	L	S	.	.	.	R	G	N	L	V	T	A	D	T	V	V	D	L	L	G	Q	A	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													S			S															T	T				T	T		B		S		S	S	S		S	.	.	.	T	T		B	B														T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350				.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.					.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.					.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.																				.	.	.	.
Query SS confidence																																								.	.	.	.																				.	.	.	.
Query Sequence		D	P	L	L	E	R	P	L	M	S	S	G	A	A	W	I	I	R	R	I	M	A	D	E	A	Q	P	L	P	D	S	A	L	P	R	V	A	P	.	.	.	.	L	A	W	K	T	G	T	S	Y	G	Y	R	D	A	W	A	I	G	V	.	.	.	.	N	A	R	Y	V	I	G	I	W	T	G	R	P	D	G
Query Conservation																																								.	.	.	.																				.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																		.	.	.	.														.	.					.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																																			.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	A	P	W	A	Q	T	W	S	A	S	L	P	V	A	G	E	S	D	P	F	V	G	G	T	L	A	N	R	M	R	G	T	A	A	E	G	V	V	E	A	K	T	G	T	M	S	G	V	S	A	.	.	L	S	G	Y	V	P	G	P	E	G	E	L	A	F	S	I	V	N	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S	T	T								S		B	T	T		S	S					G	G	G	T	T	S	S	T	T	S	T	T	T	T	T									T	T				.	.								T	T										.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																																			.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
							370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	P	V	V	G	Q	F	G	F	A	S	A	V	P	L	L	N	Q	V	N	N	I	L	L	S	R	S	A	N	L	P	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	N	G	H	S	G	P	A	P	L	A	V	Q	D	A	I	A	V	R	L	A	E	Y	A	G	H	Q	A	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.				S	S	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Template SS confidence
						438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.