![]() |
|
![]() |
  | Insertion relative to template |
  | Deletion relative to template |
  | Catalytic residue from the CSA |
  | |
Detailed help on interpreting your alignment |
  |   | 692 | . | . | . | . | . | . | . | 700 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 710 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 720 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 730 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 740 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 750 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 760 | . | . | . | ||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | . | . | . | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | L | Q | L | T | G | V | R | D | G | A | I | I | K | R | L | P | G | A | A | E | A | T | L | P | L | Q | S | . | S | G | G | A | G | E | R | W | W | F | L | N | G | E | P | L | T | E | . | . | R | G | R | N | V | T | L | H | L | T | D | K | G | D | Y | Q | L | L | V | . | . | M | D | D | V | G | Q | . | . | . | I | A |
Template Sequence |   | V | K | L | T | A | P | K | S | N | V | V | A | . | . | . | . | . | Y | G | N | E | F | L | K | I | T | A | T | A | S | K | I | S | R | V | D | F | L | V | D | G | E | V | I | G | S | D | R | E | A | P | Y | E | Y | E | W | K | A | V | E | G | N | H | E | I | S | V | I | A | Y | D | D | D | D | A | A | S | T | P | D |
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | B | ![]() | ||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | . | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||
  |   | 2 | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | . | . | . | . | . | . | |||||
  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 764 | . | . | . | . | . | 770 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Query Sequence |   | T | V | K | F | V | M | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Sequence |   | S | V | K | I | F | V | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Known Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |   | 81 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  |
Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
  | ||||||||
|
|