Job Description P52647 Confidence 27.88% Date Thu Jan 5 12:05:59 GMT 2012 Rank 236 Aligned Residues 242 % Identity 24% Template d2jioa2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.2

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		748	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.							.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.																.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	N	L	C	V	E	V	C	P	A	K	D	R	Q	N	P	E	I	K	A	I	N	M	M	S	R	L	E	H	.	.	.	.	.	.	V	E	E	E	K	I	N	Y	D	F	F	L	N	L	P	E	I	D	R	S	K	L	E	R	I	D	I	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.														.	.	.	.	.	.														.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.																																	.
Template Sequence		C	R	Y	C	G	T	G	C	G	V	L	V	G	V	K	.	D	G	K	A	V	A	I	Q	G	D	P	N	N	H	N	A	G	L	L	C	L	K	G	S	L	L	I	P	V	L	N	S	.	K	E	R	V	T	Q	P	L	V	R	R	H	K	G	G	K	L	E	P	V	S	W	D	E	A	L	D	L	M	A	S
Template Known Secondary structure			S	S		T	T										.	T	T									T	T	S	T	T	T	T								T								.	S		S			S					S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.																																	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.		.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.		60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		807	.	.	810	.										.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.									.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	I	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	E	Y	S	G	A	C	S	G	C	G	E	T	P	Y	I	K	L	L	T	Q	L	Y	G	D	R	M	L	I	A	N	A	T	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	I	Y	G	G	N	L	P	S	T	P	Y	T	T	D	A	N	G	R	G	P
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	F	R	S	S	I	D	M	Y	G	P	N	S	V	A	W	Y	G	S	G	Q	C	L	T	E	E	S	Y	V	A	N	K	I	F	K	G	G	F	G	T	N	N	V	D	G	N	P	R	L	C	M	A	S	A	V	G	G	Y	V	T	S	F	G	K	D	E	P	M	G	T	Y	A	D	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure												G	G	G							T	T	S															T	T								G	G	G	G	T	T												S	S		S		S	S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	A	N	S	L	F	E	D	N	A	E	F	G	L	G	F	R	L	T	V	D	Q	H	R	V	R	V	L	R	L	L	D	Q	F	A	D	K	I	P	A	E	L	L	T	A	L	K	S	D	A	T	P	E	V	R	R	E	Q	V	A	A	L	R	Q	Q	L	N	D	V	A	E	A	H	E	L	L	R	D	A
Query Conservation
Alig confidence		.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	I	D	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	G	G	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			164	.	.	.
		950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.		.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.
Query SS confidence																.
Query Sequence		D	A	L	V	E	K	S	I	W	L	I	G	G	D	.	G	W	A	Y	D	I	G	F	G	G	L	D	H	V	L	S	L	T	E	N	V	N	I	L	V	L	D	T	Q	C	Y	S	N	T	G	G	Q	A	S	K	A	T	P	L	G	A	V	T	K	F	G	E	H	G	K	R	K	A	R	K	D	L	G	V	S
Query Conservation																.
Alig confidence		.	.	.	.	.										.																														.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																																								.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	T	C	F	F	I	I	G	S	N	T	S	E	A	H	P	V	L	F	R	R	I	A	R	R	K	Q	V	E	P	G	V	K	I	I	V	A	D	P	R	.	R	T	N	T	S	R	I	A	D	M	H	V	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	P	G	T	D	L	A	F	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S						S							S															T	T								S	S	.			G	G	G	G	G		S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																								.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.		.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220													.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1029	1030																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Y	G	H	V	Y	V	A	Q	I	S	L	G	A	Q	L	N	Q	T	V	K	A	I	Q	E	A	E	A	Y	P	G	P	S	L	I	I	A	Y
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.			.
Template Conservation																																																							.			.
Template Sequence		H	S	M	A	W	V	I	I	N	E	E	L	D	N	P	R	F	W	Q	R	Y	V	N	F	M	D	A	E	G	K	P	S	D	F	E	G	Y	K	A	F	L	E	N	Y	R	P	E	K	V	A	E	I	C	.	R	V	.	P	V	E	Q	I	Y	G	A	A	R	A	F	A	E	S	A	A	T	M	S	L	W	C
Template Known Secondary structure											T	T		S														T	T	S													G	G	G										.	T	S	.															S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																							.			.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.		.	.		.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		1069	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	C	E	E	H	G	Y	D	L	A	L	S	H	D	Q	M	R	Q	L	T	A	T	G	F	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		M	G	I	N	Q	R	V	Q	G	V	F	A	N	N	L	I	H	N	L	H	L	I	T	G	Q	I
Template Known Secondary structure						S	S	T	T																T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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