Job Description P52647 Confidence 99.52% Date Thu Jan 5 12:05:59 GMT 2012 Rank 36 Aligned Residues 468 % Identity 13% Template c3lq1A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene- PDBTitle: crystal structure of 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene2 1-carboxylic acid synthase/2-oxoglutarate decarboxylase3 from listeria monocytogenes str. 4b f2365 Resolution 2.60 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																.																																																														.	.
Query SS confidence																.																																																														.	.
Query Sequence		I	T	I	D	G	N	G	A	V	A	S	V	A	F	.	R	T	S	E	V	I	A	I	Y	P	I	T	P	S	S	T	M	A	E	Q	A	D	A	W	A	G	N	G	L	K	N	V	W	G	D	T	P	R	V	V	E	M	Q	S	E	A	G	A	I	A	T	V	H	G	A	L	Q	T	G	A	L	.	.	S	T
Query Conservation																.																																																														.	.
Alig confidence																.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	T	D	Y	L	A	A	F	I	E	E	L	V	Q	A	G	V	K	E	A	I	I	S	P	G	S	R	S	T	P	L	A	L	M	M	A	E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I	L	K	I	Y	V	D	V	D	E	R	S	A	G	F	F	A	L	G	L	A	K	A	S	K	R	P	V	V	L
Template Known Secondary structure																	T	T										T	T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							S	S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.											.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.		.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.							.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
Predicted Secondary structure																																								.																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																								.																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	F	T	S	S	Q	G	L	L	L	M	I	P	T	L	Y	K	L	A	G	E	L	T	P	F	V	L	H	V	A	A	R	T	V	A	T	H	A	.	L	S	I	F	G	D	H	S	D	V	M	A	V	R	Q	T	G	C	.	.	.	.	.	.	A	M	L	C	A	A	N	V	Q	E	A	Q	D	F	A	L	I
Query Conservation																																								.																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																								.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	C	T	S	G	T	A	A	A	N	Y	F	P	A	V	A	E	A	N	L	S	Q	I	P	L	I	V	L	T	A	D	R	P	H	E	L	R	N	V	G	A	P	Q	A	M	D	Q	L	H	L	Y	G	S	H	V	K	D	F	T	D	M	A	L	P	E	N	S	E	E	M	L	R	Y	A	K	W	H	G	S	R
Template Known Secondary structure					S	S					T	T										T	T												G	G	G	T	T	S	S		T	T					T	T	T	T	G	G	G	S	S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.								.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure												.					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	I	A	T	L	K	S	R	V	.	P	F	I	H	.	.	.	.	.	.	.	F	F	D	G	F	R	T	S	H	E	I	N	K	I	V	P	L	A	D	D	T	I	L	D	L	M	P	Q	V	E	I	D	A	H	R	A	R	A	L	N	P	E	H	P	V	I	R	G	T	S	A	N	P	D	T	Y	F	Q
Query Conservation												.					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.					.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Sequence		A	V	D	I	A	M	K	T	P	R	G	P	V	H	L	N	F	P	L	R	E	P	L	V	P	I	L	E	P	S	P	F	Y	Y	T	H	E	V	L	D	D	S	S	I	Q	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	E	C	T	G	K	K	G	V	F	V	V	G	P	I	D	K	K	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S	S												S							S	S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T	S								S				T	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.
Template SS confidence
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.											.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250		.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		S	R	E	A	T	N	P	W	Y	N	A	V	Y	D	H	V	E	Q	A	M	N	D	F	S	A	A	T	.	G	R	Q	Y	Q	P	F	E	Y	Y	G	H	P	Q	A	E	R	V	I	I	L	M	G	S	A	I	G	T	C	E	E	V	V	D	E	L	L	T	R	G	E	K	V	G	V	L	K	V	R	L	Y	R
Query Conservation																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																																			.	.	.	.	.					.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	E	Q	P	M	V	D	L	A	K	K	L	G	W	P	I	L	A	D	P	L	S	G	L	R	S	Y	G	A	L	D	E	V	V	I	D	Q	Y	D	A	F	L	K	E	A	E	I	I	D	K	L	.	.	.	.	.	T	P	E	V	.	V	I	R	F	G	S	M	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T													T							G	G	G	S	T	T	S	B	S	S			S	S									T	T	S							T	.	.	.	.	.			S		.					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.					.
Template SS confidence
												235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.						.	.	.	290		.	.	.	.	.	.	.	.
		303	.		.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.				.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.											.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																			.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.																			.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	.	S	A	K	H	L	L	Q	A	L	P	G	S	V	R	S	V	A	V	.	.	.	L	D	R	T	K	E	P	G	A	Q	A	E	P	L	Y	L	D	V	M	T	A	L	A	E	A	F	N	N	G	E	R	E	T	L	P	R	V	I	G	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	L	S	S
Query Conservation				.																			.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.													.						.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.
Template Sequence		V	S	K	P	L	K	N	W	L	E	Q	L	S	D	I	.	R	F	Y	V	V	D	P	G	A	A	W	K	D	P	I	K	A	V	T	D	M	I	H	C	D	E	R	F	L	L	D	I	M	Q	Q	N	M	P	D	D	A	K	D	A	A	W	L	N	G	W	T	S	Y	N	K	V	A	R	E	I	V	L	A	E
Template Known Secondary structure		S													S	S	.							T	T						T	T				S					S													S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																	.
Template SS confidence
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.		.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	F	G	P	D	C	V	L	A	V	F	A	E	L	N	A	A	K	P	K	A	R	F	T	V	G	I	Y	D	D	V	T	N	L	S	L	P	L	P	E	N	T	L	P	N	S	A	K	L	E	A	L	F	Y	G	L	G	S	D	G	S	V	S	A	T	K	N	N	I	K	I	I	G	N	S	T	P	W	Y
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	A	N	E	E	G	K	I	V	A	E	L	R	R	L	L	P	D	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	F	I	G	N	S	M	P
Template Known Secondary structure		S				T	T										S		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	400	.	.	.	.	.	.
		449	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.
Query SS confidence						.
Query Sequence		A	Q	G	Y	.	F	V	Y	D	S	K	K	A	G	G	L	T	V	S	H	L	R	V	S	E	Q	P	I	R	S	A	Y	L	I	S	Q	A	D	F	V	G	C	H	Q	L	Q	F	I	D	K	Y	Q	M	A	E	R	L	K	P	G	G	I	F	L	L	N	T	P	Y	S	A	D	E	V	W	S	R	L	P	Q
Query Conservation						.
Alig confidence						.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.														.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.														.
Template Sequence		I	R	D	V	D	T	Y	F	S	Q	I	D	K	K	I	K	M	L	A	N	R	G	A	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	V	V	S	S	A	L	G	A	S	V	V	F	Q	P	.	.	.	.	M	F	L	L	I	G	D	L	S	F	Y	H	D	.	M	N	G
Template Known Secondary structure													S	S									S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S									T	T	T	S	S	S	.	.	.	.													T	.	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.														.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.					.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.		.	.	.
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	Q	A	V	L	N	Q	K	K	A	R	F	Y	V	I	N	A	A	K	I	A	R	E	C	G	L	A	A	R	I	N	T	V	M	Q	M	A	F	F	H	L	T	Q	I	L	P	G	D	S	A	L	A	E	L	Q	G	A	I	A	K	S	Y	S	S	K	G	Q	D	L	V	E	R	N	W	Q	A	L	A	L
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template Sequence		L	L	M	A	K	K	Y	K	M	N	L	T	I	V	I	V	N	N	D	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	R	F	A	A	A	F	Y	D	A	D	Y	H	E	A	.	.	K	S	V	D	E	L	E	E
Template Known Secondary structure		G						T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T							T	T							.	.		S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.			.	.	.	.	510	.	.	.
		608	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	E	S	V	E	E	V	P	L	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	I	D	K	A	S	Y	H	K	G	L
Template Known Secondary structure							T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.