Job Description P52647 Confidence 99.84% Date Thu Jan 5 12:05:59 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 488 % Identity 13% Template c2ag1A_ PDB info PDB header:lyase Chain: A: PDB Molecule:benzaldehyde lyase; PDBTitle: crystal structure of benzaldehyde lyase (bal)- semet Resolution 2.58 Å

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		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.			.	.	.	80
Predicted Secondary structure														.																																																														.	.
Query SS confidence														.																																																														.	.
Query Sequence		I	D	G	N	G	A	V	A	S	V	A	F	.	R	T	S	E	V	I	A	I	Y	P	I	T	P	S	S	T	M	A	E	Q	A	D	A	W	A	G	N	G	L	K	N	V	W	G	D	T	P	R	V	V	E	M	Q	S	E	A	G	A	I	A	T	V	H	G	A	L	Q	T	G	A	L	.	.	S	T	S	F
Query Conservation														.																																																														.	.
Alig confidence														.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	G	G	E	L	V	V	R	T	L	I	K	A	G	V	E	H	L	F	G	L	H	G	A	H	I	D	T	I	F	Q	A	C	L	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	P	I	I	D	T	R	H	E	A	A	A	G	H	A	A	E	G	Y	A	R	A	G	A	K	L	G	V	A	L	V
Template Known Secondary structure																T										G	G	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							S	S																T	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40												.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.		.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.
Query SS confidence																																	.
Query Sequence		T	S	S	Q	G	L	L	L	M	I	P	T	L	Y	K	L	A	G	E	L	T	P	F	V	L	H	V	A	A	R	T	.	V	A	T	H	A	L	S	I	F	G	D	H	S	D	V	M	A	V	R	Q	T	G	C	A	M	L	C	A	A	N	V	Q	E	A	Q	D	F	A	L	I	S	Q	I	A	T	L	K	S
Query Conservation																																	.
Alig confidence																																	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	G	G	G	F	T	N	A	V	T	P	I	A	N	A	W	L	D	R	T	P	V	L	F	L	T	G	S	G	A	L	R	D	D	E	T	N	T	L	Q	A	G	I	D	Q	V	A	X	A	A	P	I	T	K	W	A	H	R	V	X	A	T	E	H	I	P	R	L	V	X	Q	A	I	R	A	A	L	S	A
Template Known Secondary structure			T	T						T											T												S	T	T	T	T	S			T	T			S							G	G	G		S								G	G	G														S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		R	V	.	P	F	I	H	F	F	D	G	F	R	T	S	H	E	I	N	K	I	V	P	L	A	D	D	T	I	L	D	L	M	P	Q	V	E	I	D	A	H	R	A	R	A	L	N	P	E	H	P	V	I	R	G	T	S	A	N	P	D	T	Y	F	Q	S	R	E	A	T	N	P	W	Y	N	A	V	Y	D	H
Query Conservation				.
Alig confidence				.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	R	G	P	V	L	L	D	L	P	W	D	I	L	X	N	Q	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	S	V	I	I	P	D	L	V	L	S	A	H	G	A	R	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	D
Template Known Secondary structure		S																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S									S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190																	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	Q	A	M	N	D	F	S	A	A	T	G	R	Q	Y	Q	P	F	E	Y	Y	G	H	P	Q	A	E	R	V	I	I	L	M	G	S	A	I	G	T	C	E	E	V	V	D	E	L	L	T	R	.	G	E	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	Q	A	L	A	L	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	E	R	P	V	I	V	L	G	S	E	A	S	R	T	A	R	K	T	A	L	S	A	F	V	A	A	T	G	V	P	V	F	A	D	Y	E	G	L	S	X	L	S	G	L	P	D	A	X	R	G	G	L	V	Q	N
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S													T																				G	G	G	G	G	G	G	T	T	S		G	G	G					G	G	G
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.															.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.					.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	L	K	V	R	L	Y	R	P	F	S	A	K	H	L	L	Q	A	L	P	G	S	V	R	S	V	A	V	L	D	R	.	.	.	.	T	K	E	P	G	A	Q	A	E	P	L	Y	L	D	V	M	T	A	L	A	E	A	F	N	N	G	E	R	E	T	L	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	S	F	A	K	A	D	A	A	P	D	L	V	L	X	L	G	A	R	F	G	L	N	T	G	H	G	S	G	Q	L	I	P	H	S	A	Q	V	I	Q	V	D	P	D	A	C	E	L	G	R	L	Q	G	I	A	L	G	I	V	A	D	V	G	G	T	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	G	G	T				S						S			S	S	G	G	G	T	T	T	S		S	S	S		T	T	S							S	S	G	G	G	T	T	S	S	S			S					S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	V	I	G	G	R	Y	G	L	S	S	K	E	F	G	P	D	C	V	L	A	V	F	A	E	L	N	A	A	K	P	K	A	R	F	T	V	G	I	Y	D	D	V	T	N	L	S	L	P	L	P	E	N	T	L	P	N	S	A	K	L	E	A	L	F	Y	G	L	G	S	D	G	S	V	S	A	T	K	N	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	L	A	Q	A	T	A	Q	D	A	A	W	P	D	R	G	D	W	C	A	K	V	T	D	L	A	Q	E	R	Y	A	S	I	A	A	K	S	S	S	E	H	A	L	H	P	F	H	A	S	Q	V	.	.	.	.	.	I	A	K	H	V	D	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T																										T	T				S	S	S										.	.	.	.	.			T	T		S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
																		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.						.	380	.	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	I	I	G	N	S	T	P	W	Y	A	Q	G	Y	F	V	Y	D	S	K	K	A	G	G	L	T	V	S	H	L	R	V	S	E	Q	P	I	R	S	A	Y	L	I	S	Q	A	D	F	V	G	C	H	Q	L	Q	F	I	D	K	Y	Q	M	A	E	R	L	K	P	G	G	I	F	L	L	N	T	P	Y	S
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	T	V	V	A	D	G	A	L	T	Y	L	W	L	S	E	V	X	S	R	V	K	P	G	G	F	L	C	H	G	Y	L	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	X	G	V	G	F	G	T	A	L	G	A	Q	V	A	D	L	E	A	G	R	R	T	I	L	V	T	G	D
Template Known Secondary structure		T							S	T											T	T	S			S							T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	E	V	W	S	R	L	P	Q	E	V	Q	A	V	L	N	Q	K	K	A	R	F	Y	V	I	N	A	A	K	I	A	R	E	C	G	L	A	A	R	I	N	T	V	M	Q	M	A	F	F	H	L	T	Q	I	L	P	G	D	S	A	L	A	E	L	Q	G	A	I	A	K	S	Y	S	S	K	G	Q	D	L
Query Conservation
Alig confidence							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	V	G	Y	.	S	I	G	E	F	D	T	L	V	R	K	Q	L	P	L	I	V	I	I	X	N	N	Q	S	W	G	A	T	L	H	F	Q	Q	L	A	V	G	P	N	R	V	T	G	T	R	L	E	N	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	G	V	A	A	A	F	G	A	D	G	Y	H	V
Template Known Secondary structure					G	G	.	G	T	T								T	T											S	B												T		T	T				S		B						.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		449	450	.	.	.		.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.										.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
		598	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	E	R	N	W	Q	A	L	A	L	A	R	E	S	V	E	E	V	P	L	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	D	S	V	E	S	F	S	A	A	L	A	Q	A	L	A	H	N	R	P
Template Known Secondary structure		.	.		S														S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.