Job Description P52647 Confidence 99.77% Date Thu Jan 5 12:05:59 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 493 % Identity 12% Template c1ozhD_ PDB info PDB header:lyase Chain: D: PDB Molecule:acetolactate synthase, catabolic; PDBTitle: the crystal structure of klebsiella pneumoniae acetolactate2 synthase with enzyme-bound cofactor and with an unusual3 intermediate. Resolution 2.00 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.			.	.	.
Predicted Secondary structure															.																																																														.	.
Query SS confidence															.																																																														.	.
Query Sequence		T	I	D	G	N	G	A	V	A	S	V	A	F	.	R	T	S	E	V	I	A	I	Y	P	I	T	P	S	S	T	M	A	E	Q	A	D	A	W	A	G	N	G	L	K	N	V	W	G	D	T	P	R	V	V	E	M	Q	S	E	A	G	A	I	A	T	V	H	G	A	L	Q	T	G	A	L	.	.	S	T	S
Query Conservation															.																																																														.	.
Alig confidence															.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	A	H	G	A	D	L	V	V	S	Q	L	E	A	Q	G	V	R	Q	V	F	G	I	P	G	A	K	I	D	K	V	F	D	S	L	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	I	R	I	I	P	V	R	H	E	A	N	A	A	F	M	A	A	A	V	G	R	I	T	G	K	A	G	V	A	L
Template Known Secondary structure			S													T	T										G	G	G									T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S						S	S																S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.												.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	T	S	S	Q	G	L	L	L	M	I	P	T	L	Y	K	L	A	G	E	L	T	P	F	V	L	H	V	A	A	R	T	V	A	T	H	A	L	S	I	F	G	D	H	S	D	V	M	A	V	R	Q	T	G	C	A	M	L	C	A	A	N	V	Q	E	A	Q	D	F	A	L	I	S	Q	I	A	T	L	K	S
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	S	G	P	G	C	S	N	L	I	T	G	M	A	T	A	N	S	E	G	D	P	V	V	A	L	G	G	A	V	K	R	A	.	.	.	.	.	.	D	K	S	M	D	T	V	A	M	F	S	P	V	T	K	Y	A	I	E	V	T	A	P	D	A	L	A	E	V	V	S	N	A	F	R	A	A	E	Q	G
Template Known Secondary structure				S	T					T	T											T												G	G	.	.	.	.	.	.	G										G	G	G		S								G	G	G														S	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.							.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		R	V	.	P	F	I	H	F	F	D	G	F	R	T	S	H	E	I	N	K	I	V	P	L	A	D	D	T	I	L	D	L	M	P	Q	V	E	I	D	A	H	R	A	R	A	L	N	P	E	H	P	V	I	R	G	T	S	A	N	P	D	T	Y	F	Q	S	R	E	A	T	N	P	W	Y	N	A	V	Y	D	H
Query Conservation				.
Alig confidence				.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	P	G	S	A	F	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	Q	D	V	V	D	G	P	V	S	G	K	V	L	P	A	S	G	A	P	Q	M	G	A	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	A
Template Known Secondary structure		S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S												S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.																.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																												.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.								.	.	.								.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.					.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.					.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	Q	A	M	N	D	F	S	A	A	T	G	R	Q	Y	Q	P	F	E	Y	Y	G	H	P	Q	A	E	R	V	I	I	L	M	G	S	A	I	G	T	C	E	E	V	V	D	E	L	L	T	R	.	G	E	K	V	.	.	.	.	.	.	.	G	V	L	.	.	.	.	.	.	.	K	V	R	L	Y	R	P
Query Conservation																																																					.					.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.					.	.	.	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	D	Q	V	A	K	L	I	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	K	N	P	I	F	L	L	G	L	M	A	S	Q	P	E	N	S	K	A	L	R	R	L	L	E	T	S	H	I	P	V	T	S	T	Y	Q	A	A	G	A	V	N	Q	D	N	F	S	R	F	A	G	R	V	G	L
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S							G	G	G	G	S	G	G	G																			G	G	G	T	T	T	S		G	G	G		T	T						S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.															.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	S	A	K	H	L	L	Q	A	L	P	G	S	V	R	S	V	A	V	L	D	R	T	K	E	P	G	A	Q	A	E	P	L	Y	L	D	V	M	T	A	L	A	E	A	F	N	N	G	E	R	E	T	L	P	R	V	I	G	G	R	Y	G	L	S	S	K	E	F	G	P	D	C	V	L	A	V	F	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence															.																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation															.																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Sequence		F	N	N	Q	A	G	D	R	L	L	Q	L	A	.	D	L	V	I	C	I	G	Y	S	P	V	E	Y	E	P	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	S	G	N	A	T	L	V	H	I	D	V	L	P	A	Y	E	E	R	N	Y	T	.	.	P	D	V	E	L	V	G	D	I	A	G	T	L	N	K	L
Template Known Secondary structure		B	T	T											.	S						S			G	G	G	S		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	T			S		S							S	S					B	T	T	B		.	.		S					S
Template Predicted Secondary structure															.																		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template SS confidence
		263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.		.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.									.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.			.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.			420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		N	A	A	K	P	K	A	R	F	T	V	G	I	Y	D	D	V	T	N	L	S	L	P	L	P	E	N	T	L	P	N	S	A	K	L	E	.	.	A	L	F	Y	G	L	G	S	D	G	S	V	S	A	T	K	N	N	I	K	I	I	G	N	S	T	P	W	Y	A	Q	G	Y	F	V	Y	D	S	K	K	A	G
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence																																						.	.															.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	N	I	D	H	R	L	V	L	S	P	Q	A	A	E	I	L	R	D	R	Q	H	Q	R	E	L	L	D	L	N	Q	F	A	L	H	P	L	R	I	V	R	A	M	Q	D	I	V	N	S	D	V	.	.	.	.	.	.	T	L	T	V	D	M	G	S	F	H	I	W	I	A	R	Y	L	Y	T	F	R	A
Template Known Secondary structure				T			S																											S	S	B															T	T		.	.	.	.	.	.						S	S									T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.							.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	T	V	S	H	L	R	V	S	E	Q	P	I	R	S	A	Y	L	I	S	Q	A	D	F	V	G	C	H	Q	L	Q	F	I	D	K	Y	Q	M	A	E	R	L	K	P	G	G	I	F	L	L	N	T	P	Y	S	A	D	E	V	W	S	R	L	P	Q	E	V	Q	A	V	L	N	Q	K	K	A	R	F	Y
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.														.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.														.
Template Sequence		R	Q	V	M	I	S	N	G	Q	Q	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	V	A	L	P	W	A	I	G	A	W	L	V	N	P	E	R	.	.	K	V	V	S	V	S	G	D	G	G	F	L	Q	.	S	S	M	E	L	E	T	A	V	R	L	K	A	N	V	L	H	L
Template Known Secondary structure		S							T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T													S	T	T	S	.	.														.		T	T									T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.														.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.			440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	N	A	A	K	I	A	R	E	C	G	L	A	A	R	I	N	T	V	M	Q	M	A	F	F	H	L	T	Q	I	L	P	G	D	S	A	L	A	E	L	Q	G	A	I	A	K	S	Y	S	S	K	G	Q	D	L	V	E	R	N	W	Q	A	L	A	L	A	R	E	S	V	E	E	V	P	L	Q
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		I	W	V	D	N	G	Y	N	M	V	A	I	Q	E	E	K	K	Y	Q	R	L	S	G	V	E	F	G	P	M	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Y	A	E	S	F	G	A	K	G	F	A	V	E	S	A	.	.	E	A	L	E	P	T	L	R	A	A	M	D	V	D	G	P
Template Known Secondary structure						S	B													S	S			S		B							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	T	S							S	T	.	.	T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.												.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.			.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.