Job Description P52647 Confidence 99.69% Date Thu Jan 5 12:05:59 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 471 % Identity 13% Template c1ovmC_ PDB info PDB header:lyase Chain: C: PDB Molecule:indole-3-pyruvate decarboxylase; PDBTitle: crystal structure of indolepyruvate decarboxylase from2 enterobacter cloacae Resolution 2.65 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.		.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.		70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure													.																																																							.
Query SS confidence													.																																																							.
Query Sequence		D	G	N	G	A	V	A	S	V	A	F	.	R	T	S	E	V	I	A	I	Y	P	I	T	P	S	S	T	M	A	E	Q	A	D	A	W	A	G	N	G	L	K	N	V	W	G	D	T	P	R	V	V	E	M	Q	S	E	A	G	A	I	A	T	V	H	G	.	A	L	Q	T	G	A	L	S	T	S	F	T	S
Query Conservation													.																																																							.
Alig confidence													.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	V	A	D	Y	L	L	D	R	L	T	D	C	G	A	D	H	L	F	G	V	P	G	D	Y	N	L	Q	F	L	D	H	V	I	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	I	C	W	V	G	C	A	N	E	L	N	A	S	Y	A	A	D	G	Y	A	R	C	K	G	F	A	A	L	L	T	T	F
Template Known Secondary structure		B												T	T										G	G	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							S	S																S								T
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.											.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.									.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	G	L	L	L	M	I	P	T	L	Y	K	L	A	G	E	L	T	P	F	V	L	H	V	A	A	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	T	H	A	L	S	I	F	G	D	H	S	D	V	M	A	V	R	Q	T	G	C	A	M	L	C	A	A	N	V	Q	E	A	Q	D	F	A	L	I	S	Q	I
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	V	G	E	L	S	A	M	N	G	I	A	G	S	Y	A	E	H	V	P	V	L	H	I	V	G	A	P	G	T	A	A	Q	Q	R	G	E	L	L	H	H	T	L	G	D	G	E	F	R	H	F	Y	H	M	S	E	P	I	T	V	A	Q	A	V	L	T	E	Q	N	A	C	Y	E	I	D	R	V	L	T	T
Template Known Secondary structure		T						T										T	T																		T				T	T	S		S	S	S									T	G	G	G		S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	L	K	S	R	V	P	F	I	H	F	F	D	G	F	R	T	S	H	E	I	N	K	I	V	P	L	A	D	D	T	I	L	D	L	M	P	Q	V	E	I	D	A	H	R	A	R	A	L	N	P	E	H	P	V	I	R	G	T	S	A	N	P	D	T	Y	F	Q	S	R	E	A	T	N	P	W	Y	N	A
Query Conservation
Alig confidence								.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	L	R	E	R	R	.	P	G	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	L	P	A	D	V	A	K	K	A	A	T	P	P	V	N	A	L	T	H	K	Q	A	H	A	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	C
Template Known Secondary structure						T		.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S	B					S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.		.	.	.	.															.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.																											.	.
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	Y	D	H	V	E	Q	A	M	N	D	F	S	A	A	T	G	R	Q	Y	Q	P	F	E	Y	Y	G	H	P	Q	A	E	R	V	I	I	L	M	G	S	A	I	G	T	C	E	E	V	V	D	E	L	L	T	R	G	E	K	V	G	V	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	R
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Sequence		L	K	A	F	R	D	A	A	E	N	K	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	S	K	R	T	A	L	L	A	D	F	L	V	L	R	H	G	L	K	H	A	L	Q	K	W	V	K	E	.	V	P	M	A	H	A	T	M	L	M	G	K	G	I	F	D	E	R	Q	A	G	F	Y	G
Template Known Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S												T	T												.	S								T	T	T	T	T	S	S		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.															.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		300	.		.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		L	Y	.	R	P	F	S	A	K	H	L	L	Q	A	L	P	G	S	V	R	S	V	A	V	L	D	R	T	K	E	P	G	A	Q	A	E	P	L	Y	L	D	V	M	T	A	L	A	E	A	F	N	N	G	E	R	E	T	L	P	R	V	I	G	G	R	Y	G	L	S	S	K	E	F	G	P	D	C	V	L	A
Query Conservation				.
Alig confidence				.																.																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																				.																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Sequence		T	Y	S	G	S	A	S	T	G	A	V	K	E	A	I	E	G	A	.	D	T	V	L	C	V	G	T	R	F	T	D	T	L	T	A	G	F	T	H	.	.	.	.	.	.	Q	L	T	P	A	Q	T	I	E	V	Q	P	H	A	A	R	V	G	D	V	W	F	T	.	.	.	G	I	P	M	N	Q	A	I	E
Template Known Secondary structure					G	G	G	S										T	S	.	S						S					T	T	T	T	T	T	T			.	.	.	.	.	.				T	T	T						S	S					T	T					.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																				.																					.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template SS confidence
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.		.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.							.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320				.	.	.	.	.	.	.	.	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	A	E	L	N	A	A	K	P	K	A	R	F	T	V	G	I	Y	D	D	V	T	N	L	S	L	P	L	P	E	N	T	L	P	N	S	A	K	L	E	A	L	F	Y	G	L	G	S	D	G	S	V	S	A	T	K	N	N	I	K	I	I	G	N	S	T	P	W	Y	A	Q	G	Y	F	V	Y	D	S	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	V	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	K	Q	H	V	H	A	P	D	G	S	L	T	Q	E	N	F	W	R	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	T	F	I	R	P	G	D	I
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S						S	B											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		330	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	360	.	.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	G	G	L	T	V	S	H	L	R	V	S	E	Q	P	I	R	S	A	Y	L	I	S	Q	A	D	F	V	G	C	H	Q	L	Q	F	I	D	K	Y	Q	M	A	E	R	L	K	P	G	G	I	F	L	L	N	T	P	Y	S	A	D	E	V	W	S	R	L	P	Q	E	V	Q	A	V	L	N	Q	K	K	A
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.														.
Template Conservation																																																			.	.														.
Template Sequence		I	L	A	D	Q	G	T	S	A	F	G	A	I	D	L	R	L	P	A	D	V	N	F	I	V	Q	P	L	W	G	S	I	G	Y	T	L	A	A	A	F	G	A	Q	T	A	C	P	N	R	.	.	R	V	I	V	L	T	G	D	G	A	A	Q	L	.	T	I	Q	E	L	G	S	M	L	R	D	K	Q	H	P
Template Known Secondary structure						T	T							T	T					S	S							T	T	T			T	T														T	T	S	.	.														.	T	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.														.
Template SS confidence
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.			.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440		.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.				.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.									.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	Y	V	I	N	A	A	K	I	A	R	E	.	.	.	C	G	L	A	A	R	I	N	T	V	M	Q	M	A	F	F	H	L	T	Q	I	L	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	A	L	A	E	L	Q	G	A	I	A	K	S	Y	S	S	K	G	Q	D	L	V	E
Query Conservation															.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	L	V	L	N	N	E	G	Y	T	V	E	R	A	I	H	G	A	E	Q	R	Y	N	D	I	A	L	W	N	W	T	H	I	P	Q	A	L	S	L	D	P	Q	S	E	C	W	R	V	S	E	A	E	Q	L	A	D	V	L	E	K	V	A	H	H	E	R	L	S	L	I	E
Template Known Secondary structure								S	S	S								S		T	T		G	G	G							G	G	G	S	T	T	T	S		S	S										B												T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.