Job Description P69908 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 12:12:17 GMT 2012 Rank 89 Aligned Residues 355 % Identity 14% Template d1ax4a_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

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		74	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	M	D	L	S	I	N	K	N	W	I	D	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H	A	P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template Sequence		D	H	Q	W	A	A	M	I	T	G	D	E	A	Y	A	G	S	R	N	Y	Y	D	L	K	.	.	.	.	D	K	A	K	E	L	F	N	Y	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	I	I	P	A	H	Q	G	R	G	A	E	N	I	L	F	P	V	L	L	K	Y	K	Q	K	E	.	.	.	.	.	G	K	A	K
Template Known Secondary structure										T					S	S	S									.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.					S	S																			T	.	.	.	.	.	T			S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.					.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.								.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.						.	120	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.										.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200					.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.					.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																.	.	.	.
Query Sequence		K	P	N	L	V	C	G	P	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	D	V	E	L	R	E	I	P	M	R	P	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	F	M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	D	E	.	.	.	.	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	.	.	.	.	N
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	P	V	F	I	S	N	F	H	F	D	T	T	A	A	H	V	E	L	N	G	C	K	A	I	N	I	V	T	E	K	A	F	D	S	E	T	Y	D	D	W	K	G	D	F	D	I	K	K	L	K	E	N	I	A	Q	H	G	A	D	N	I	V	A	I	V	S	T	V	T	C	N	S	A	G	G	Q	P	V	S
Template Known Secondary structure		S						S	S												T	T							B		G	G	G	G		T	T	S			T	T	T	T		B														G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.											.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	E	F	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D	F	R	L	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	K	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	A	P	L	G	C	G	W
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.				.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.																																																					.				.
Template Sequence		M	S	N	L	K	E	V	Y	E	I	A	K	Q	H	G	.	.	.	.	.	.	I	F	V	V	M	D	S	A	R	F	C	E	N	A	Y	F	I	K	A	R	D	P	K	Y	K	N	A	T	I	K	E	V	I	F	D	M	Y	K	Y	A	D	A	L	T	M	S	A	K	D	P	L	L	.	N	I	G	.	G	L
Template Known Secondary structure																T	.	.	.	.	.	.								T	T													G	G	G	T	T											G	G	G		S												.	S	S		.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																																																					.				.
Template SS confidence
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.							.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.		270	.	.		.	.
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	W	R	D	E	E	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q	Y	Y	E	F	L	R	L	G	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	P	Y	E	F	I
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.																											.	.	.																			.
Template Conservation																									.	.	.	.																											.	.	.																			.
Template Sequence		V	A	I	R	D	N	E	E	I	F	T	L	A	R	Q	R	C	V	P	M	E	G	F	.	.	.	.	V	T	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	A	A	M	V	Q	G	L	E	E	G	T	E	E	E	Y	.	.	.	L	H	Y	R	I	G	Q	V	K	Y	L	G	D	R	L	R	E	A	.	G	I	P	I	Q
Template Known Secondary structure					S	S																T		S	.	.	.	.	T	T	T	T	T																T	T					.	.	.																		T	.	T			B
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.																											.	.	.																			.
Template SS confidence
		276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.					.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.				.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.							.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.											.	420	.	.	.	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Query Sequence		C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	.	.	.	.	.	.	L	S	E	R	L	R	L	R	G	W	Q	V	P	A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	M	R	I	M	C	.	R	R	G	F
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Alig confidence							.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.
Template Conservation							.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	P	T	G	G	.	.	.	.	.	H	A	V	F	V	D	C	K	K	L	V	P	Q	I	P	G	D	Q	F	P	A	Q	A	V	I	N	A	L	Y	L	E	S	G	V	R	A	V	E	I	G	S	F	L	L	G	R	D	P	A	T	G	E	Q	K	H	A	D	M	E	F	M	R	L	T	I	A	R	R	V	Y
Template Known Secondary structure		S	S			S	.	.	.	.	.	S						S	T	T	T		T	T	S		G	G	G																						S						B		T	T	T		S	B				S										T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.						.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L	K	Y	L	S	D	H	P	K	L	Q	G	I	A	Q	Q	N	S	F	K	H
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	N	D	H	M	D	Y	I	A	D	A	L	I	G	L	K	E	K	F	A	T	L	K	G	L	E	F	E	Y	E	P	P	V	L	R	H
Template Known Secondary structure															T	T					T	T											S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.