Job Description P77337 Confidence 99.38% Date Thu Jan 5 12:27:58 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 239 % Identity 19% Template d1reoa1 SCOP info FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain FAD-linked reductases, N-terminal domain Resolution 2.31

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.																.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	D	D	K	F	D	A	I	V	V	G	A	G	V	A	G	S	V	A	A	L	V	M	A	R	A	G	L	D	V	L	V	I	E	R	G	D	S	A	G	C	K	N	M	T	G	G	R	L	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	L	E	A	I	I	P	G	F	A	V	S
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	S	N	P	K	H	V	V	V	V	G	A	G	M	S	G	L	S	A	A	Y	V	L	S	G	A	G	H	Q	V	T	V	L	E	A	S	E	R	A	G	G	R	V	R	T	Y	R	N	D	K	E	D	W	Y	A	N	L	G	P	M	R	L	P	E	K	H	R	I	V	R	E	Y	I	R	K	F	G	L	Q
Template Known Secondary structure				S	S										S													T	T								S	S	S	S	S		T	T							T	T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	V	E	R	K	V	T	R	E	K	I	S	F	L	T	E	E	S	A	V	T	L	D	F	H	R	E	Q	P	D	V	P	Q	H	A	S	Y	T	V	L	R	N	R	L	D	P	W	L	M	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	E	F	S	Q	E	N	D	N	A	W	Y	F	I	K	N	I	R	K	R	V	G	E	V	K	K	D	P	G	V	L	K	Y	P	V	K	P	S	E	E	G	K	S	A	G	Q	L	Y	E	E	S	L	G	K	V	V	E	E	L	K	R	T	N	C	S	Y	I	L	N	K	Y	D	T	Y	S	T	K	E	Y
Template Known Secondary structure							S			T	T	S					T	T												G	G	G	G						G	G	G	T	T											T										S									G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																													118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	Q	A	G	A	Q	F	I	P	G	V	R	V	D	A	L	V	R	E	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	K	E	G	N	L	S	P	G	A	V	D	M	I	G	D	L	M	N	E	D	S	G	Y	Y	V	S	F	P	E	S	L	R	H	D	D	I	F	A	Y	E	K	R	F	D	E	I	V	G	G	M	D	K	L	P	T	S	M	Y	R	A	I	E	E	K	V	H	L	N	A	Q	V	I	K	I	Q	K	N	A
Template Known Secondary structure					T	S															T		G	G	G	T	T	S	B												T	T								T	T		T	T										T	G	G	G			S	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.
		139	140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.
Query Sequence		N	K	V	T	G	V	Q	A	.	.	.	.	G	D	D	I	L	E	A	N	V	V	I	L	A	D	G	V	N	S	M	L	G	R	S	L	G	M	V	P	A	S	D	P	H	H	Y	A	V	G	V	K	E	V	I	G	L	T	P	E	Q	I	N	D	R	F	N	I	T	G	E	E	G	A	A	W	L	F	A	G
Query Conservation										.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	V	T	V	V	Y	Q	T	P	A	K	E	M	A	S	V	T	A	D	Y	V	I	V	C	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T									S	S	S								S						S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		269	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	S	D	G	L	M	G	G	G	F	L	Y	T	N	K	D	S	I	S	L	G	L	V	C	G	L	G	D	I	A	H	A	Q	K	S	V	P	Q	M	L	E	D	F	K	Q	H	P	A	I	R	P	L	I	S	G	G	K	L	L	E	Y	S	A	H	M	V	P	E	G	G	L	A	M	V	P	Q	L	V	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	R	A	T	R	R	I	K	F	E	P	P	L	P	P	K	K	A	H	A	L	R	S	V	F	T	P	Y	Q	F	Q	.	.	H	F	S	E	S	L	T	A	S	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	S				S																T	T				.	.										B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.
Template SS confidence
																																							296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.			.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	V	M	I	V	G	D	A	A	G	F	C	L	N	L	G	F	T	V	R	G	M	D	L	A	I	A	S	A	Q	A	A	A	T	T	V	I	A	A	K	E	R
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	I	Y	F	A	G	E	H	T	A	E	A	H	G	W	.	.	.	.	.	.	I	D	S	T	I	K	S	G	L	R	A	A	R	D	V	N	R	A	S	E	Q
Template Known Secondary structure		T	T					S	G	G	G	S	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.							.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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