Job Description P77337 Confidence 99.31% Date Thu Jan 5 12:27:58 GMT 2012 Rank 91 Aligned Residues 330 % Identity 14% Template c1f8sA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:l-amino acid oxidase; PDBTitle: crystal structure of l-amino acid oxidase from calloselasma2 rhodostoma, complexed with three molecules of o-aminobenzoate. Resolution 2.00 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.																.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	D	K	F	D	A	I	V	V	G	A	G	V	A	G	S	V	A	A	L	V	M	A	R	A	G	L	D	V	L	V	I	E	R	G	D	S	A	G	C	K	N	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	R	L	Y	A	H	T	L	E	A	I	I	P	G	F	A	V	S	A
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	S	N	P	K	H	V	V	I	V	G	A	G	M	A	G	L	S	A	A	Y	V	L	A	G	A	G	H	Q	V	T	V	L	E	A	S	E	R	P	G	G	R	V	R	T	Y	R	N	E	E	A	G	W	Y	A	N	L	G	P	M	R	L	P	E	K	H	R	I	V	R	E	Y	I	R	K	F	D	L	R	L
Template Known Secondary structure			S	S										B													T	T								S	S	S	S	S	B	T	T							T	T	T	T					S	S						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		67	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	E	R	K	V	T	R	E	K	I	S	F	L	T	E	E	S	A	V	T	L	D	F	H	R	E	Q	P	D	V	P	Q	H	A	S	Y	T	V	L	R	N	R	L	D	P	W	L	M	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	F	S	Q	E	N	D	N	A	W	Y	F	I	K	N	I	R	K	K	V	G	E	V	K	K	D	P	G	L	L	K	Y	P	V	K	P	S	E	A	G	K	S	A	G	Q	L	Y	E	E	S	L	G	K	V	V	E	E	L	K	R	T	N	C	S	Y	I	L	N	K	Y	D	T	Y	S	T	K	E	Y	L
Template Known Secondary structure						S			T	T	S					T	T												G	G	G	G						T	T	T	T	T											T										S									G	G	G	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																												118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	Q	A	G	A	Q	F	I	P	G	V	R	V	D	A	L	V	R	E	G	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	K	E	G	D	L	S	P	G	A	V	D	M	I	G	D	L	L	N	E	D	S	G	Y	Y	V	S	F	I	E	S	L	K	H	D	D	I	F	A	Y	E	K	R	F	D	E	I	V	D	G	M	D	K	L	P	T	A	M	Y	R	D	I	Q	D	K	V	H	F	N	A	Q	V	I	K	I	Q	Q	N	D	Q
Template Known Secondary structure				T	T														T	T		G	G	G	T	T	S	B												T	T								T	T		T	T										T	G	G	G			S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		140	.	.	.	.	.	.					.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.
Query Sequence		K	V	T	G	V	Q	A	.	.	.	.	G	D	D	I	L	E	A	N	V	V	I	L	A	D	G	V	N	S	M	L	G	R	S	L	G	M	V	P	A	S	D	P	H	H	Y	A	V	G	V	K	E	V	I	G	L	T	P	E	Q	I	N	D	R	F	N	I	T	G	E	E	G	A	A	W	L	F	A	G	S
Query Conservation									.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	T	V	V	Y	E	T	L	S	K	E	T	P	S	V	T	A	D	Y	V	I	V	C	T	T	S	R	A	V	R	L	I	K	F	N	P	P	L	L	P	K	K	A	H	A	L	R	S	V	H	Y	R	S	G	T	K	I	F	L	T	C	T	T	K	F	W	E	D	D	G	I	H	G	G	K	S	T	T	D
Template Known Secondary structure										S	S	S								S						S						T	T	S				S																										S	S		G	G	G	G	G	T			S	S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		P	S	D	G	L	M	G	G	G	F	L	Y	T	N	K	D	S	I	S	L	G	L	V	C	G	L	G	D	I	A	H	A	Q	K	S	V	P	Q	M	L	E	D	F	K	Q	H	P	A	I	R	P	L	I	S	G	G	K	L	L	E	Y	S	A	H	M	V	P	E	G	G	L	A	M	V	P	Q	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence																																																																														.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	S	R	F	I	Y	Y	P	N	H	N	F	T	N	G	V	G	V	I	I	A	Y	G	I	G	D	D	A	N	F	F	Q	A	L	D	F	K	D	C	A	D	I	V	F	N	D	L	S	L	I	H	Q	L	P	K	K	D	I	Q	S	F	C	Y	P	S	V	I	Q	K	W	S	L	D	K	Y	A	M	G	G
Template Known Secondary structure		S	T	T							S	S			T	T											T								T	S																	T	T																		G	G	G		T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																			292	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	N	E	G	V	M	I	V	G	D	A	A	G	F	C	L	N	L	G	F	T	V	R	G	M	D	L	A	I	A	S	A	Q	A	A	A	T	T	V	I	A	A	K	E	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	T	T	F	T	P	Y	Q	F	Q	H	F	S	D	P	L	T	A	S	Q	G	R	I	Y	F	A	G	E	Y	T	A	Q	A	.	.	.	.	.	.	H	G	W	I	D	S	T	I	K	S	G	L	R	A	A	R	D	V	N	L	A	S	E	N
Template Known Secondary structure							T	T													B	T	T					S	G	G	G	S	S	S	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.							.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.