Job Description P27306 Confidence 99.94% Date Thu Jan 5 11:43:55 GMT 2012 Rank 95 Aligned Residues 307 % Identity 17% Template c1lqtB_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:fpra; PDBTitle: a covalent modification of nadp+ revealed by the atomic resolution2 structure of fpra, a mycobacterium tuberculosis oxidoreductase Resolution 1.05 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.								.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.					.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	A	I	V	I	G	S	G	P	G	G	E	G	A	A	M	G	L	V	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	G	A	R	V	A	V	I	E	R	Y	Q	N	V	G	G	G	C	T	H	W	G	T	I	P	S	K	A	L	R	H	A	V	S	R	I	.	.	.	.	I	E	F	N	Q	N	P	L	Y	S	D	H
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.																.																				.	.	.	.
Template Conservation																																														.
Template Sequence		Y	Y	I	A	I	V	G	S	G	P	S	A	F	F	A	A	A	S	L	L	K	A	A	D	T	T	E	D	L	D	M	A	V	D	M	L	E	M	L	P	T	P	W	G	.	L	V	R	S	G	V	A	P	D	H	P	K	I	K	S	I	S	K	Q	F	E	K	T	A	E	D	P	R	F	R	F	F	G	N	V
Template Known Secondary structure										S																	S	T	T										S	S	S	S		S	T	.					T	S		T	T		T	T	G	G	G	G									T	S	T	T						S
Template Predicted Secondary structure																																														.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.		.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		S	R	L	L	R	S	S	F	A	D	I	L	N	H	A	D	N	V	I	N	Q	Q	T	R	M	R	Q	G	F	Y	E	R	N	H	C	E	I	L	Q	G	N	A	R	F	V	D	E	H	T	L	A	L	D	C	P	D	G	S	V	E	T	L	T	A	E	K	F	V	I	A	C	G	S	.	R	P	Y	H	P	T
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	V	G	E	H	V	Q	P	G	E	L	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	D	A	V	I	Y	A	V	G	A	Q	S	D	R	M	L	N
Template Known Secondary structure			B	T	T	T	B								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.													.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	D	F	T	H	P	R	I	Y	D	S	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	S	M	H	H	E	P	R	H	V	L	I	Y	G	A	G	V	I	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	G	E	D	L	P	G	S	I	A	A	V	D	F	V	G	W	Y	N	A	H	P	H	F	E	Q	V	S	P	D	L	S	G	A	R	A	V	V	I	G	N	G	N	V	A	L	D	V	A	R	I	L	L	T	D	P	D	V	L	A	R	T	D	I	A	D	H	A	L	E	S	L	R	P	R	G	I	Q	E
Template Known Secondary structure			T	T	T	T	S	T	T												T	T		G	G	G	T	T							S	S							S	S												S						T	T	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
																			190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230															.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	Y	A	S	I	F	R	G	M	D	V	K	V	D	L	I	N	T	R	D	R	L	L	A	F	L	D	Q	E	M	S	D	S	L	S	Y	H	F	W	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	V	I	R	H	N	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	I	V	G	R	R	G	P	L	Q	A	A	F	T	T	L	E	L	R	E	L	A	D	L	D	G	V	D	V	V	I	D	P	A	E	L	D	G	I	T	D	E	D	A	A	A	V	G	K	V	C	K	Q	N	I	K	V	L	R	G	Y	A	D	R	E	P	R	P	G	H	R	R	M	V	F	R	F	L	T
Template Known Secondary structure							S	S		G	G	G										G	G	G	G		T	T							G	G	G	G	T	T																									T	S				T	T	S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	Y	E	K	I	E	G	C	D	D	G	V	I	M	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	S	G	K	K	L	K	A	D	C	L	L	Y	A	N	G	R	T	G	N	T	D	S	L	A	L	Q	N	I	G	L	E	T	D	S	R	G	Q	L	K	V	N	S	M	Y	Q
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	P	I	E	I	K	G	K	R	K	V	E	R	I	V	L	G	R	N	E	L	V	S	D	G	S	G	R	V	A	A	K	D	T	G	E	R	E	E	L	P	A	Q	L	V	V	R	S	V	G	Y	R	G	V	.	.	.	.	.	.	P	T	P	G	L	P	F	D	D	Q	S	G	T	I	P	N	V	G	G	R
Template Known Secondary structure									S	S	S															S	S	S	S															S						S						.	.	.	.	.	.			T	T	S			B	T	T	T	T	B					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		274	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.							.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
			301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.		.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																		.
Query SS confidence		.																		.
Query Sequence		.	T	A	Q	P	H	V	Y	A	V	G	D	V	I	G	Y	P	S	.	L	A	S	A	A	Y	D	Q	G	R	I	A	A	Q	A	L	V	K	G	E	A	T	A	H	L	I	E	D	I	P	T	G	I	Y	T	I	P	E	I	S	S	V	G	K	T	E	Q	Q	L	T	A	M	K	V	P	Y	E	V
Query Conservation		.																		.
Alig confidence		.																		.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	G	S	P	N	E	Y	V	V	G	W	I	K	R	G	P	T	G	V	I	G	T	N	K	K	D	A	Q	D	T	V	D	T	L	I	K	.	.	.	.	.	.	N	L	G	N	A	K	E	G	A	E	C	K	S	F	P	D	H	A	D	Q	V	A	D	W	L	A	A	R	Q	P	K	L	V	T
Template Known Secondary structure			T	T		S	S					T						S		S		T	T																.	.	.	.	.	.								T	T		S																			T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.							.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.