Job Description P67826 Confidence 86.15% Date Thu Jan 5 12:10:53 GMT 2012
Rank 181 Aligned Residues 109
% Identity 22% Template c1kbiB_
PDB info
PDB header: oxidoreductaseChain: B: PDB Molecule: cytochrome b2;
PDBTitle: crystallographic study of the recombinant flavin-binding domain of2 baker's yeast flavocytochrome b2: comparison with the intact wild-3 type enzyme
Resolution 2.30 Å
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66 . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . .
. . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Query SS confidence  
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Query Sequence  
C Y S D G E F A A I L E D V R T V R E L G F P G L V T G .
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V L D V D G N V D M P R M E K I M A
Query Conservation  
                              . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                      
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                                                                                                         
Template Sequence  
L Y V N S D R K I T D D L V K N V E K L G V K A L F V T V D A P S L G Q R E K D M K L K F S N T K T N V E E S Q G A S R A L S K F I D P S L T W K D I E E L K K
Template Known Secondary structure  
S S T S S S T T S S S S G G G G G S S S T T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
253 . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 . . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . .
 
   
112 . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . .
150 . . . . . . . . . 160 . . . . . .
. . . 170 . . . . . . . . . 180
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . .
Query SS confidence  
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Query Sequence  
A A G P L A V T F H R A F D M C A N P L Y T L N N L A E L G I A R V L T S G .
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Q K S D A L Q G L S K I M E L I A .
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H R D A P I I M A G A G V R
Query Conservation  
                                . . . . . . .                           . . .              
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
    .     . . . .       .                                                      
Template Sequence  
K T .
K L P I V I K .
.
.
.
G V Q R T E D V .
I K A A E I G V S G V V L S N H G G R Q L D F S R A P I E V L A E T M P I L E Q R N L K D K L E V F V D G G V R
Template Known Secondary structure  
T . S . . . . S . T T S T T T T S S T T T T T G G G T S S S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . .
Template SS confidence  
   
341 .
. . . . . . .
350 . . . . . . .
. . 360 . . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]