Job Description P18775 Confidence 100.00% Date Wed Jan 25 15:20:41 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 686 % Identity 18% Template c1g8jC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:arsenite oxidase; PDBTitle: crystal structure analysis of arsenite oxidase from2 alcaligenes faecalis Resolution 2.03 Å

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		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	80	.			.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Query Sequence		T	K	S	D	E	K	V	I	W	S	A	C	T	V	N	C	G	S	R	C	P	L	R	M	H	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	G	E	.	.	I	K	Y	V	E	T	D
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Alig confidence																.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.
Template Conservation																.
Template Sequence		P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	.	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	S	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V	P	D
Template Known Secondary structure				T	T									S	S	.	B	T	T											T	T					S	S	G	G	G	S	T	T					S	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S
Template Predicted Secondary structure																.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.		.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.						.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.
Query Sequence		N	T	G	D	D	N	Y	D	G	L	H	Q	V	R	A	C	L	R	G	R	S	M	R	R	R	V	Y	N	P	.	.	.	.	.	D	R	L	K	Y	P	M	K	R	V	G	A	R	G	E	G	K	F	E	R	I	S	W	E	E	A	Y	D	I	I	A	T	N	M	Q	R	L	I	K	E	Y	G	N	E	S	I
Query Conservation																															.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Template Sequence		K	A	C	V	.	.	.	.	.	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	.	.	.	.	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	S	D	G	P	Q	G	V
Template Known Secondary structure		T	T		T	.	.	.	.	.	T	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						T	.	.	.	.	T																									T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		89	90	.	.						.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.					.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.			200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																						.	.
Query SS confidence																																						.	.
Query Sequence		Y	L	N	Y	G	T	G	T	L	G	G	T	M	T	R	S	W	P	P	G	N	T	L	V	A	R	L	M	N	C	C	G	G	Y	L	N	.	.	H	Y	G	D	Y	S	S	A	Q	I	A	E	G	L	N	Y	T	Y	G	G	W	A	D	G	N	S	P	S	D	I	E	N	S	K	L	V	V	L	F	G	N	N
Query Conservation																																						.	.
Alig confidence							.	.	.	.																												.	.																.
Template Conservation							.	.	.	.																																													.
Template Sequence		F	F	S	C	F	.	.	.	.	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	.	E	M	G	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N
Template Known Secondary structure							.	.	.	.				S	T	T															T	T	S								S	S	S	S	S	S			T	T					.		T	T			S			S		T	T						S						S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.																																													.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.					.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.														.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.									.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	E	T	R	M	S	G	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	Y	Y	L	E	Q	A	R	Q	K	S	N	A	R	M	I	I	I	D	P	R	Y	T	D	T	G	A	G	R	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	I	P	I	R	P	G	T	D	A	A	L	V	N	G	L
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.
Template Sequence		P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	.	V	A	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L
Template Known Secondary structure						S							T						T	T	T	T								S	S	S													S	S					.										G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.		.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	V	M	I	T	E	N	L	V	D	Q	A	F	L	D	K	Y	C	V	G	Y	D	E	K	T	L	P	A	S	A	P	K	N	G	H	Y	K	A	Y	I	L	G	E	G	P	D	G	V	A	K	T	P	E	W	A	S	Q	I	T	G	V	P	A	D	K	I	I	K	L	A	R	E	I	G	S	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	T	Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	T	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S
Template Known Secondary structure									T		S																			T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										S			T	T
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
				377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.
Query SS confidence		.	.
Query Sequence		.	.	T	K	P	A	F	I	S	Q	G	W	G	P	Q	R	H	A	N	G	E	I	A	T	R	A	I	S	M	L	A	I	L	T	G	N	V	G	I	N	G	G	N	S	G	A	R	E	G	S	Y	S	L	P	F	V	R	M	P	T	L	E	N	P	I	Q	T	S	I	S	M	F	M	W	T	D	A	I	E	R
Query Conservation		.	.
Alig confidence		.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Q	A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T
Template Known Secondary structure		S	S														T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S	B		B								S		S	S											T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.	.						.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.																																													.
Query SS confidence											.	.	.	.	.																																													.
Query Sequence		G	P	E	M	T	A	L	R	D	.	.	.	.	.	G	V	R	G	K	D	K	L	D	V	P	I	K	M	I	W	N	Y	A	G	N	C	L	I	N	Q	H	S	E	I	N	R	T	H	E	I	L	Q	D	D	K	K	C	E	.	L	I	V	V	I	D	C	H	M	T	S	S	A	K	Y	A	D	I	L	L	P
Query Conservation											.	.	.	.	.																																													.
Alig confidence											.	.	.	.	.																										.	.	.	.																.
Template Conservation																																									.	.	.	.
Template Sequence		W	W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	.	.	.	.	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P
Template Known Secondary structure				S							S	T	T																						T	T	T				.	.	.	.											T	T	T	T									S	S		T	G	G	G	G	T		S
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.					.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	C	T	A	S	E	Q	M	D	F	A	L	D	A	S	C	G	N	M	S	Y	V	I	F	N	D	Q	V	I	K	P	R	F	E	C	K	T	I	Y	E	M	T	S	E	L	A	K	R	L	G	V	E	Q	Q	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	G	R	T	Q	E	E	W	M	R	H	L
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	H	P	G	E	M	N	L	T	S	M	N	G	E	.	.	.	.	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G
Template Known Secondary structure		B			B	T	T	B							T	T	.	.	.	.										S			S	T	T		B																			T	T	T								T		S				S	S								T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.					.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.												.	.	.	610	.	.	.	.	.				.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Query Sequence		Y	A	Q	S	R	E	A	I	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	T	F	E	E	F	R	K	.	.	.	Q	G	I	F	K	K	R	D	P	Q	G	H	H	V	A	Y	K	A	F	R	E	D	P	Q	A	N	P	L	T	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	Q	A	L	A	D	I	A	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S			B			T	T	T			B			S		S		T	T	S			S	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710			.	.	.	.	.	.	.	.	.		720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.										.
Query SS confidence																																																		.	.										.
Query Sequence		T	W	E	L	P	E	G	D	V	I	D	P	L	P	I	Y	T	P	G	F	E	S	Y	Q	D	P	L	N	K	Q	Y	P	L	Q	L	T	G	F	H	Y	K	S	R	V	H	S	T	Y	.	.	G	N	V	D	V	L	K	A	A	.	C	R	Q	E	M	W	I	N	P	L	D	A	Q	K	R	G	I	H	N	G
Query Conservation																																																		.	.										.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	P	W	N	G	L	P	A	T	V	Q	Q	Q	K	D	K	Y	R	F	W	L	N	N	G	R	N	N	E	V	W	Q	T	A	Y	H	D	Q	Y	N	S	L	M	Q	E	R	Y	P	M	A	Y	I	E	M	N	P	D	D	C	K	Q	L	D	V	T	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S												S									S	S			T	T		T	T	G	G	G									S	S														T			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.
		740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	V	R	I	F	N	D	R	G	E	V	H	I	E	A	K	V	T	P	R	M	M	P	G	V	V	A	L	G	E	G	A	W	Y	D	P	D	A	K	R	V	D	K	G	G	C	I	N	V	L	T	T	Q	R	P	S	P	L	A	K	G	N	P	S	H	T	N	L	V	Q	V	E	K	V
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template Sequence		D	I	V	E	V	Y	N	D	F	G	S	T	F	A	M	V	Y	P	V	A	E	I	K	R	G	Q	T	F	M	L	F	G	Y	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	I	Q	G	D	V	T	T	D	W	T	D	R	D	I	.	I	P	Y	Y	K	G	T	W	G	D	I	R	K	V
Template Known Secondary structure									T	T											T	T	S		T	T							S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S		G	G	G	G			S		B		T	T		.		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.
Template SS confidence
		744	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.											.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.		.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.