Job Description P0A825 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:06:42 GMT 2012 Rank 50 Aligned Residues 367 % Identity 17% Template d1c7ga_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Beta-eliminating lyases Resolution 2.10

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.												.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	K	R	E	M	N	I	A	D	Y	D	A	E	L	W	Q	A	M	E	Q	E	K	V	R	Q	E	E	H	I	E	L	I	A	S	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	P	R	V	M	Q	A	Q	G	S	Q	L	T	N	K	Y	A	E	G	Y	P	G	K	R	Y	Y	G	G	C	E	Y
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	S	V	E	T	V	S	M	I	S	R	D	.	.	E	R	V	K	K	M	Q	E	A	G	Y	N	T	F	L	L	N	S	K	D	I	Y	I	D	L	L	T	D	S	G	T	N	A	M	S	D	K	Q	W	A	G	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	I	G	D	E	A	Y	A	G	S	E	N
Template Known Secondary structure			S												.	.									T	T	T		G	G	G	S		G	G	G		S				S		S	S	S												T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S					S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.			.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.												.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Query SS confidence																																																																														.	.	.	.
Query Sequence		V	D	I	V	E	Q	L	A	I	D	R	A	K	E	L	F	G	A	D	Y	A	N	V	Q	P	H	S	G	S	Q	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	L	E	P	G	D	T	V	L	G	M	N	L	A	H	G	G	H	L	T	H	G	S	P	V	N	F	S	G	K	L	Y	N	I	V	P	Y	G	.	.	.	.
Query Conservation																																																																														.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.															.																																.	.	.	.																				.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.															.																																.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	H	.	.	.	.	L	E	K	T	V	K	E	L	F	G	F	K	H	I	.	V	P	T	H	Q	G	R	G	A	E	N	L	L	S	Q	L	A	I	K	P	G	Q	Y	V	A	G	N	M	Y	F	T	.	.	.	.	T	T	R	F	H	Q	E	K	N	G	A	T	F	V	D	I	V	R	D	E	A	H	D
Template Known Secondary structure					.	.	.	.												S			.				S	S															T	T						S	S				.	.	.	.									T	T							B		G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.															.																																.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.					80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.					.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
						147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.						.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.					.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																						.	.	.	.	.												.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																						.	.	.	.	.												.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	I	D	A	T	G	H	I	D	Y	A	D	L	E	K	Q	A	K	E	H	K	P	.	.	.	.	.	K	M	I	I	G	G	F	S	A	Y	S	.	.	.	.	G	V	V	D	W	A	K	M	R	E	I	A	D	S	I	G	A	Y	L	F	V	D	M	A	H	V	A	G	L	V	A	A	G	V	Y
Query Conservation		.	.	.	.																						.	.	.	.	.												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																						.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	L	N	L	P	F	K	G	D	I	D	L	N	K	L	A	T	L	I	K	E	K	G	A	E	N	I	A	Y	I	C	L	A	V	T	V	N	L	A	G	G	Q	P	V	S	M	A	N	M	R	A	V	H	E	M	A	S	T	Y	G	I	K	I	F	Y	D	A	T	R	C	V	E	N	A	Y	F	I	K	E
Template Known Secondary structure		T	T				S		T	T		B														G	G	G								S	S	B	T	T	T	T	S	B																		T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		214	.	.	.	.	.															220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	N	P	V	P	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	A	G	P	R	G	G	L	I	L	A	K	G	G	S	E	E	L	Y	K	K	L	N	S	A	V	F	P	G	G	Q	G	G	P	L	M	H	V	I	A	G	K	A	V	A	L	K	E	A
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	A	G	Y	E	N	V	S	I	K	D	I	V	H	E	M	F	S	Y	A	D	G	C	T	M	S	G	K	K	D	C	L	V	N	I	G	G	F	L	C	M	N	D	E	E	M	F	S	A	A	K	E	L	V	V	V	Y	E	G	M	P	S	Y	G	G	L	A	G	R	D	M	E	A	M	A	I	G	L	R
Template Known Secondary structure			S	T	T		T	T	S											T	T		S						T	T	T	T	T			S	S							S																T			T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.									.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	P	E	F	K	T	Y	Q	Q	Q	V	A	K	N	A	K	A	M	V	E	V	F	L	E	R	G	Y	K	V	V	S	G	G	T	D	N	H	L	F	L	V	D	L	V	D	K	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	K	E	A	D	A	A	L	G	R	A	N	I	T	V	N	K	N	S	V	P	N
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																															.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																															.
Template Sequence		E	A	M	Q	.	Y	E	Y	I	E	H	R	V	K	Q	V	R	Y	L	G	D	K	L	R	E	A	G	V	P	I	V	E	P	T	G	.	G	H	A	V	F	L	D	A	R	R	F	C	P	H	L	T	Q	D	Q	F	P	A	Q	S	L	A	A	S	I	Y	M	E	T	G	V	R	S	M	E	R	G	I	V	S
Template Known Secondary structure				T		.																					T	T			B		S	S			.	S	S											T	T	S		G	G	G															S							S
Template Predicted Secondary structure						.																															.
Template SS confidence
		308	.	310	.		.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.		.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
									352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	D	P	K	S	P	F	V	T	S	G	I	R	V	G	T	P	A	I	T	R	R	G	F	K	E	A	E	A	K	E	L	A	G	W	M	C	D	V	L	D	S	I	N	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation																									.	.	.
Template Sequence		A	G	R	S	K	E	T	G	E	N	H	R	P	K	L	E	T	V	R	L	T	I	P	.	.	.	R	R	V	Y	T	Y	A	H	M	D	V	V	A	D	G	I	I	K	L	Y	Q	H	K	E	D
Template Known Secondary structure				B		S	S	S			B				S										.	.	.	T	T	S																		T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.				.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.