Job Description P0A825 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:06:42 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 363 % Identity 15% Template d1c4ka2 SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Ornithine decarboxylase major domain Resolution 2.70

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		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.				.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.						.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.		.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.														.	.	.	.	.															.
Query SS confidence																								.	.	.														.	.	.	.	.															.
Query Sequence		A	E	L	W	Q	A	M	E	Q	E	K	V	R	Q	E	E	H	I	E	L	I	A	.	.	.	S	E	N	Y	T	S	P	R	V	M	Q	A	Q	.	.	.	.	.	G	S	Q	L	T	N	K	Y	A	E	G	Y	P	G	.	K	R	Y	Y	G	G	C	E	Y	V	D	I	V	E	Q	L	A	I	D	R	A	K
Query Conservation																								.	.	.														.	.	.	.	.															.
Alig confidence																								.	.	.														.	.	.	.	.															.													.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.
Template Sequence		P	P	F	F	K	S	L	K	E	Y	V	S	R	Y	L	I	Q	F	D	C	P	G	H	Q	G	G	Q	Y	Y	R	K	H	P	A	G	R	E	F	Y	D	F	F	G	E	T	V	F	R	A	D	L	C	N	A	D	V	A	L	G	D	L	L	I	H	E	G	P	A	V	A	.	.	.	.	A	E	K	H	A	A
Template Known Secondary structure													T	S						S	S	S	T	T	T	T	T	T	T	G	G	G	S												S					S				T	T	S	G	G	G		B	T	T	T	T	B	T					.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.					.	.	180	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.		.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	L	F	G	A	D	Y	A	N	V	Q	P	H	S	G	S	Q	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	L	E	P	G	D	T	V	L	G	M	N	L	A	H	G	G	H	L	T	H	G	S	.	P	V	N	F	S	G	K	L	Y	N	I	V	P	Y	G	I	D	A	T	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																		.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.						.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.
Template Sequence		R	V	Y	N	A	D	K	T	Y	F	V	L	G	G	S	S	N	A	N	N	T	V	T	S	A	L	V	S	N	G	D	L	V	L	F	D	R	N	N	H	.	.	.	K	S	V	Y	N	S	A	L	A	M	A	G	G	R	P	V	Y	L	Q	T	N	R	N	P	Y	G	F	I	G	G	I	Y	D	S	D	F	D
Template Known Secondary structure				T	T		S						S	S																T	T							T	T			.	.	.								T	T	T	T													T	T								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.
Template SS confidence
		184	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.				.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
										153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	Y	A	D	L	E	K	Q	A	K	E	H	K	P	K	M	I	I	G	G	F	S	A	Y	S	G	V	V	D	W	A	K	M	R	E	I	A	D	S	I	G	A	Y	L	F	V	D	M	A	H	V	A	G	L	V	A	A	G	V	Y	P	N	P	V	P	H	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	K	K	I	R	E	L	A	A	K	V	D	P	E	R	A	K	W	K	R	P	F	R	L	A	V	I	Q	L	G	T	Y	D	G	T	I	Y	N	A	H	E	V	V	K	R	I	G	H	L	C	D	Y	I	E	F	D	S	A	W	V	G	Y	E	Q	F	I	P	M	M	R	N	S	S	P	L	L	I	D	D	L
Template Known Secondary structure									T	T	T	S	S					T		S			B	S						S	B		T	T	S													G	G	G	B	S							T	T			G	G	G	S	S	G	G	G	G	G	G		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340
							220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.								.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	A	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	A	G	P	R	G	G	L	I	L	A	K	G	G	S	E	E	.	.	.	.	.	.	.	L	Y	K	K	L	N	S	A	V	F	P	G	G	Q	G	G	P	L	M	H	V	I	A	G	K	A	V	A	L	K	E	A	M	E	P	E	F	K	T	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	P	E	D	P	G	I	I	V	V	Q	S	V	H	K	Q	Q	A	G	F	S	Q	T	S	Q	I	H	K	K	D	S	H	I	K	G	Q	L	R	Y	C	D	H	K	H	F	N	N	S	F	N	L	F	M	S	T	S	P	F	Y	P	M	Y	A	A	L	D	V	N	A	A	M	Q	E	G	E	A	G	R	K	L
Template Known Secondary structure			T	T	S													S	S			T	T									G	G	G	T	T	S	T	T															S		S	S																	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		341	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Q	Q	V	A	K	N	A	K	A	M	V	E	V	F	L	E	R	G	Y	K	V	V	S	G	G	T	D	N	H	L	F	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	H	D	L	L	I	T	T	I	E	A	R	K	K	L	I	K	A	G	S	M	F	R	P	F	V	P	P	V	V	N	G	K	K	W	E	D	G	D	T	E	D	M	A	N	N	I	D	Y	W	R	F	E	K	G	A	K	W	H	A	Y	E	G	Y	G	D	N	Q	Y	Y	V	D	P	N	K	F	M	L	T	T
Template Known Secondary structure																			T	T		S	S			S	S		S			T	T			G	G	G	S						T	T		G	G	G	G	B			T	T		T	T	T			T	T			T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
										322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	V	D	K	N	L	T	G	K	E	A	D	A	A	L	G	R	A	N	I	T	V	N	K	N	S	V	P	N	D	P	K	S	P	F	V	T	S	G	I	R	V	G	T	P	A	I	T	R	R	G	F	K	E	A	E	A	K	E	L	A	G	W	M	C	D	V	L	D	S	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Sequence		P	G	I	N	P	E	T	G	D	Y	E	D	F	G	V	P	A	T	I	V	A	N	Y	L	R	D	H	G	I	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	S	D	L	N	S	I	L	F	L	M	.	.	.	.	T	P	A	E	T	P	A	K	M	N	N	L	I	T	Q	L	L	Q	L	Q	R	L	I
Template Known Secondary structure		S	S			T	T	T	T				S	S														T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S							.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.											.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.					.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
		394	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	D	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	E	D
Template Known Secondary structure			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		567	.	.