Job Description P0A825 Confidence 99.93% Date Thu Jan 5 11:06:42 GMT 2012 Rank 194 Aligned Residues 358 % Identity 16% Template c3k7yA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:aspartate aminotransferase; PDBTitle: aspartate aminotransferase of plasmodium falciparum Resolution 2.80 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.		.	.	.	.	.	.	20	.		.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.								.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.
Predicted Secondary structure															.									.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence															.									.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	L	K	R	E	M	N	I	A	D	Y	D	A	.	E	L	W	Q	A	M	E	Q	.	E	K	V	R	Q	E	E	H	I	E	L	I	A	S	.	.	.	.	.	.	.	E	N	Y	T	S	P	R	V	M	Q	A	Q	G	S	Q	L	T	N	K	Y	A	E	G	Y	P	G	K	R	Y	Y	G	G	C	E	Y	V
Query Conservation															.									.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.									.															.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	D	K	L	L	S	S	L	E	N	I	E	V	D	N	I	L	K	T	A	R	E	F	K	E	D	T	C	E	E	K	I	N	L	S	I	G	V	C	C	N	D	D	G	D	L	H	I	F	D	S	V	L	N	A	D	K	L	V	T	E	N	.	.	.	.	.	.	Y	K	E	K	P	Y	L	L	G	N	G	T
Template Known Secondary structure					G	G	G	G																	T	T	S	S		S	S					S		S	S		B		T	T	S	S	B																	.	.	.	.	.	.								T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.							.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90						.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.		.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		D	I	V	E	Q	L	A	I	D	R	A	K	E	L	F	G	A	D	Y	.	.	.	.	.	A	N	V	Q	P	H	S	G	S	Q	A	N	F	A	V	Y	T	A	L	L	E	P	G	.	D	T	V	L	G	M	N	L	A	H	G	G	H	L	T	H	G	S	P	V	N	F	S	G	K	L	Y	N	I	V	P	Y
Query Conservation																					.	.	.	.	.																								.
Alig confidence																					.	.	.	.	.																								.												.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.
Template Sequence		E	D	F	S	T	L	T	Q	N	L	I	F	G	N	N	S	K	Y	I	E	D	K	K	I	C	T	I	Q	C	I	G	G	T	G	A	I	F	V	L	L	E	F	L	K	M	L	N	V	E	T	L	Y	V	T	N	P	P	Y	I	.	.	.	N	H	V	N	M	I	E	S	R	G	F	N	L	K	Y	I	N	F
Template Known Secondary structure															S	S		T	T	T	T	T	T																							T	T	T								S	S				.	.	.								T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.				.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.			.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.						180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.																		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.																		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Query Sequence		G	I	D	A	T	G	H	I	D	Y	A	D	L	E	K	Q	A	.	.	K	E	H	K	P	K	M	I	I	G	G	F	S	A	Y	S	G	.	.	.	.	.	V	V	D	W	A	K	M	R	E	I	A	D	S	I	G	A	Y	L	F	V	D	M	A	H	V	A	G	L	V	A	A	G	V	Y	P	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.																		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Alig confidence																			.	.																		.	.	.	.	.																																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	Y	N	L	I	D	I	N	Y	D	L	F	L	N	D	L	R	N	I	P	N	G	S	S	V	I	L	Q	I	S	C	Y	N	P	C	S	V	N	I	E	E	K	Y	F	D	E	I	I	E	I	V	L	H	K	K	H	V	I	I	F	D	I	A	Y	Q	G	F	G	H	T	N	L	E	E	D	V	L	L	I
Template Known Secondary structure				T	T	T	T														S		S	S								S	S		T	T	T																												S		T	T	T	S	S	S	S	T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
					215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.			.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.				.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280						.
Predicted Secondary structure		.	.	.																		.	.																							.	.	.																												.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																		.	.																							.	.	.																												.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	N	P	V	P	H	A	H	V	V	T	T	T	T	H	K	T	L	.	.	A	G	P	R	G	G	L	I	L	A	K	G	G	S	E	E	L	Y	K	K	L	N	.	.	.	S	A	V	F	P	G	G	Q	G	G	P	L	M	H	V	I	A	G	K	A	V	A	L	K	E	A	M	.	.	.	.	.	E
Query Conservation		.	.	.																		.	.																							.	.	.																												.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																		.	.																							.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	K	F	E	E	K	N	I	A	F	S	V	C	Q	S	F	S	K	N	M	S	L	Y	G	E	R	A	G	A	L	H	I	V	C	K	N	Q	E	E	K	K	I	V	F	N	N	L	C	F	I	V	R	K	F	Y	S	S	P	V	I	H	T	N	R	I	L	C	Q	L	L	N	N	Q	N	L	K	L	N	W	I
Template Known Secondary structure						T	T	T										T	T	T	S			T	T	T	T									S	S																	T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.									.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	E	F	K	T	Y	Q	Q	Q	V	A	K	N	A	K	A	M	V	E	V	F	L	E	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	V	V	S	G	G	T	D	N	H	L	F	L	V	D	L	V	D	K	N	L	T	G	K	E	A	D	A	A	L	G	R	A	N	I	T	V	N	K	N	S	V	P	N	D	P
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.									.											.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.											.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		K	E	L	S	Q	L	S	Q	R	I	T	N	N	R	I	L	F	F	N	K	L	E	T	Y	Q	K	K	Y	N	L	N	Y	D	W	N	V	Y	K	K	Q	R	.	G	L	F	S	F	V	P	L	L	A	.	.	.	.	.	.	K	I	A	E	H	L	K	T	H	H	I	Y	I	I	N	N	G	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																										G	G	G	G	T					G	G	G	G	S	S			.	S	S					G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	G	G	T	T	T	T	T	T	T	T					T	T	S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.											.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.		.	.	.	.	.	.	.	360	.	.							.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	S	P	F	V	T	S	G	I	R	V	G	T	P	A	I	T	R	R	G	F	K	E	A	E	A	K	E	L	A	G	W	M	C	D	V	L	D	S	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	N	V	S	.	.	.	.	.	G	I	T	K	N	N	V	D	Y	I	A	D	K	I	C	L	S	L	S	Q	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.				G	G	.	.	.	.	.	G			T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.
Template SS confidence
											380	.	.	.	.						.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.