Job Description P76115 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:19:07 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 653 % Identity 17% Template c3qlbA_ PDB info PDB header:metal transport Chain: A: PDB Molecule:enantio-pyochelin receptor; PDBTitle: enantiopyochelin outer membrane tonb-dependent transporter from2 pseudomonas fluorescens bound to the ferri-enantiopyochelin Resolution 3.26 Å

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		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	V	V	F	A	A	D	E	Q	T	M	I	V	S	A	A	P	Q	V	V	S	E	L	D	T	P	A	A	V	S	V	V	D	G	E	E	M	R	L	A	T	P	R	I	N	L	S	E	S	L	T	G	V	P	G	L	Q	V	Q	N	R	Q	N	Y	A	Q	D	L	Q	L	S	I	R	G	F	G	S	R	S
Query Conservation
Alig confidence																																											.																																					.	.
Template Conservation																																											.																																					.	.
Template Sequence		A	T	G	P	Q	A	G	Y	V	A	K	R	S	L	S	G	T	K	T	D	A	S	L	S	E	I	P	Q	S	I	S	V	I	T	R	D	Q	M	D	A	Q	.	Q	V	Q	S	V	N	E	A	L	R	Y	T	A	G	V	Q	A	N	T	T	A	A	S	Q	R	F	D	T	L	S	I	R	G	F	D	V	.	.
Template Known Secondary structure		S	S	S			S	S	S						S	T	T	T	S	S				T	T	T		S	S													T	.	T			S					G	G	G	S	T	T							S	S			S	S						T	T				.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.																																					.	.
Template SS confidence
		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		T	Y	G	I	R	G	I	R	L	Y	V	D	G	I	P	A	T	M	P	D	G	Q	G	Q	T	S	N	I	D	L	S	S	V	Q	N	V	E	V	L	R	G	P	F	S	A	L	Y	G	.	N	A	S	G	G	V	M	N	V	T	T	Q	T	G	Q	Q	P	P	T	I	E	A	S	S	Y	Y	G	S	F	G	S
Query Conservation																																																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.																	.	.	.																									.
Template Conservation		.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	T	T	G	M	L	R	D	G	L	K	G	N	T	A	Q	A	.	.	.	W	P	K	V	E	A	Y	G	L	E	R	I	D	V	L	K	G	P	A	S	V	L	F	G	Q	N	S	P	G	G	V	V	N	Q	I	S	K	R	P	L	D	K	P	F	H	E	V	Q	I	Q	G	G	S	F	D	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	G	G	G				T	T	B					S	S		.	.	.						G	G	G									S							S	S			T	T												S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
							103	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.				.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.				.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.
Query SS confidence													.	.	.
Query Sequence		W	R	Y	G	L	K	A	T	G	A	T	.	.	.	G	D	G	T	Q	P	G	D	V	D	Y	T	V	S	T	T	R	F	T	T	H	G	Y	R	D	H	S	G	A	Q	K	N	L	A	N	A	K	L	G	V	R	I	D	E	A	S	K	L	S	L	I	F	N	S	V	D	I	K	A	D	D	P	G	G	L	T
Query Conservation													.	.	.
Alig confidence													.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	Q	G	Q	F	D	F	S	G	P	L	D	D	E	G	Q	F	L	Y	R	L	V	G	L	E	R	D	S	G	T	Q	F	D	H	I	K	D	D	K	Q	Y	F	A	P	S	F	T	W	K	P	N	D	D	T	S	L	T	L	L	A	D	Y	T	Q	D	T	F	G	A	P	R	V	F	L	P	A	Q	G	T	L
Template Known Secondary structure												S	S	S	S	S	S													B		S	S	T	T		B														S	S	S	S																	S	S				B	S	B	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	E	W	K	A	N	P	Q	Q	A	P	R	A	E	Q	Y	D	T	R	K	T	I	K	Q	T	Q	A	G	L	R	Y	E	R	S	L	S	S	R	D	D	M	S	V	M	M	Y	A	G	E	R	E	T	T	Q	Y	Q	S	I	P	M	A	P	Q	L	N	P	S	H	A	G	G	V	I	T	L	Q	R	H	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	G	N	P	N	G	K	V	R	H	N	V	F	L	D	E	P	G	L	D	N	D	R	T	Q	Y	S	L	G	Y	L	L	E	H	R	L	N	D	V	W	S	L	N	S	S	A	R	Y	G	H	V	N	L	L	T	N	T	A	S	G	M	S	L	A	P	D	L	R	T	L	N	R	A	A	Y	R	F	R	I	V
Template Known Secondary structure		B			T	T					T	T				S		S	S																			S	S	S																										T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		334	.	.	.	.	.	340	.							.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	G	I	D	S	R	W	T	.	.	.	.	.	.	H	R	G	E	L	G	V	P	V	T	F	T	T	G	L	N	Y	E	N	M	S	E	N	R	K	G	Y	N	N	F	R	L	N	S	G	M	P	E	Y	G	Q	K	G	E	L	R	R	D	E	R	N	L	M	W	N	I	D	P	Y	L	Q	T	Q	W	Q	L
Query Conservation										.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	T	Y	S	L	D	N	N	A	Q	A	R	W	N	L	G	S	T	Q	M	V	S	L	L	G	I	D	Y	R	R	T	R	E	D	Y	Y	L	R	G	G	S	A	S	P	I	D	I	Y	N	P	V	H	H	H	H	G	V	F	D	P	S	T	P	F	T	N	T	V	Q	R	A	D	Q	V	G	V	Y	A	Q
Template Known Secondary structure																B	S	S	S																														S	S	S									B				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	K	L	S	L	D	A	G	V	R	Y	S	S	V	W	F	D	S	N	D	H	Y	V	T	P	G	N	G	D	D	S	G	D	A	S	Y	H	K	W	L	P	A	G	S	L	K	Y	A	M	T	D	A	W	N	I	Y	L	A	A	G	R	G	F	E	T	P	T	I	N	E	L	S	Y	R	A	D	G	Q	S
Query Conservation
Alig confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	F	T	F	D	E	H	W	V	L	T	V	G	G	R	Q	D	R	S	S	A	R	T	D	N	R	M	N	D	S	G	S	K	Q	D	D	E	K	F	T	Y	R	T	G	L	V	Y	L	A	D	N	G	L	A	P	Y	I	S	Y	S	T	S	F	D	P	V	L	G	T	N	F	Y	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T																			T	T	T	T																					T	T	S																S	B		S	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	M	N	L	G	L	K	P	S	T	N	D	T	I	E	I	G	S	K	T	R	I	G	D	G	L	L	S	L	A	L	F	Q	T	D	T	D	D	E	I	V	V	D	S	S	S	G	G	R	T	T	Y	K	N	A	G	K	T	R	R	Q	G	A	E	L	A	W	D	Q	R	F	A	G	D	F	R	V	N	A	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	G	T	P	Y	K	P	T	S	A	K	Q	S	E	V	G	V	K	Y	Q	P	P	G	I	D	S	Y	I	T	L	S	L	F	D	L	T	Q	E	N	V	L	T	T	D	P	A	Q	R	L	N	K	I	Q	T	G	E	I	N	V	R	G	I	E	L	E	G	K	A	S	L	A	R	G	L	D	L	L	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	S		B																		T	T	S	S																				S	S	S	T	T																						T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
		568	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.					.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.
Query Sequence		W	T	W	L	D	A	T	Y	R	S	N	V	C	N	E	Q	D	C	N	G	N	R	M	P	G	I	A	R	N	M	G	F	A	S	I	G	Y	V	P	E	.	.	.	.	D	G	W	Y	A	G	T	E	A	R	Y	M	G	D	I	M	A	D	D	E	N	T	A	K	A	P	S	Y	T	L	V	G	L	F	T	G
Query Conservation																																										.	.	.	.
Alig confidence												.	.																													.	.	.	.
Template Conservation												.	.
Template Sequence		L	T	Y	N	D	A	E	V	S	K	.	.	S	N	N	P	L	E	K	G	K	R	P	T	D	T	P	E	K	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	L	P	E	G	P	L	S	G	L	G	F	G	A	G	V	R	Y	I	G	S	T	E	A	D	A	A	N	T	Q	R	V	P	S	Y	T	L	L	D	A	A	V	H
Template Known Secondary structure											S	.	.	S			T	T							T	T			S													S	S	T	T	T	T																S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure												.	.
Template SS confidence
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.			.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
		644	.	.	.	.	.				650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.
Query SS confidence								.	.	.
Query Sequence		Y	K	Y	N	Y	H	.	.	.	N	L	T	V	D	L	F	G	R	V	D	N	L	F	D	K	E	Y	V	G	S	V	I	V	N	E	S	N	G	R	Y	Y	E	P	S	P	G	R	N	Y	G	V	G	M	N	I	A	W
Query Conservation								.	.	.
Alig confidence								.	.	.																											.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	D	F	D	K	L	I	P	A	A	K	G	L	R	L	A	V	N	A	T	N	L	T	D	K	H	Y	Y	E	G	C	S	L	T	N	.	.	.	.	.	C	S	A	G	Y	D	R	S	V	I	A	S	L	R	Y	R	W
Template Known Secondary structure				G	G	G	S	S	G	G	G	T	T									S	T	T										S	S	B	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		647	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.						.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.