Job Description P76115 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:19:07 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 645 % Identity 18% Template c2grxB_ PDB info PDB header:metal transport Chain: B: PDB Molecule:ferrichrome-iron receptor; PDBTitle: crystal structure of tonb in complex with fhua, e. coli2 outer membrane receptor for ferrichrome Resolution 3.30 Å

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		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	T	M	I	V	S	A	A	P	Q	V	V	S	E	L	D	T	P	A	A	V	S	V	V	D	G	E	E	M	R	L	A	T	P	R	I	N	L	S	E	S	L	T	G	V	P	G	L	Q	V	Q	N	R	Q	N	Y	A	Q	D	L	Q	L	S	I	R	G	F	G	S	R	S	T	Y	G	I	R	G	I	R
Query Conservation
Alig confidence																																			.																																							.	.	.	.
Template Conservation																																			.																																							.	.	.	.
Template Sequence		A	A	R	Q	S	A	T	G	T	K	T	D	T	P	I	Q	K	V	P	Q	S	I	S	V	V	T	A	E	E	M	A	L	H	.	Q	P	K	S	V	K	E	A	L	S	Y	T	P	G	V	S	V	G	T	R	G	A	S	N	T	Y	D	H	L	I	I	R	G	F	A	A	E	G	.	.	.	.	Q	S	Q	N
Template Known Secondary structure		S						T	T	T	S	S				G	G	G		S	S											T	T	T	.			S	S	S	S	T	T	S	T	T		T	T			S		T	T	T	T			S	S						T	T	B			S	S	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																																			.																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.		.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.					100	.	.	.
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.
Query SS confidence																																										.
Query Sequence		L	Y	V	D	G	I	P	A	T	M	P	D	G	Q	G	Q	T	S	N	I	D	L	S	S	V	Q	N	V	E	V	L	R	G	P	F	S	A	L	Y	G	.	N	A	S	G	G	V	M	N	V	T	T	Q	T	G	Q	Q	P	P	T	I	E	A	S	S	Y	Y	G	S	F	G	S	W	R	Y	G	L	K	A	T
Query Conservation																																										.
Alig confidence																.	.																									.
Template Conservation																.	.
Template Sequence		N	Y	L	N	G	L	K	L	Q	G	N	F	Y	N	.	.	D	A	V	I	D	P	Y	M	L	E	R	A	E	I	M	R	G	P	V	S	V	L	Y	G	K	S	S	P	G	G	L	L	N	M	V	S	K	R	P	T	T	E	P	L	K	E	V	Q	F	K	A	G	T	D	S	L	F	Q	T	G	F	D	F	S
Template Known Secondary structure					T	T						B	T	T	B	.	.						G	G	G									S								S			S	S												S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.
Template SS confidence
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		185	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.								.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	T	G	D	G	T	Q	P	G	D	V	D	Y	T	V	S	T	T	R	F	T	T	H	G	Y	R	D	H	S	G	A	Q	K	N	L	A	N	A	K	L	G	V	R	I	D	E	A	S	K	L	S	L	I	F	N	S	V	D	I	K	.	.	.	.	.	.	.	A	D	D	P	G	G	L	T	K	A	E	W
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		D	S	L	D	D	D	G	.	.	.	V	Y	S	Y	R	L	T	G	L	A	R	S	A	N	A	Q	Q	K	G	S	E	E	Q	R	Y	A	I	A	P	A	F	T	W	R	P	D	D	K	T	N	F	T	F	L	S	Y	F	Q	N	E	P	E	T	G	Y	Y	G	W	L	P	K	E	G	T	V	E	P	L	P	N
Template Known Secondary structure				S	S	T	T	S	.	.	.		S														S	S	S	S																S	S	S	S																					B		S	B	T	T	T	B			T	T
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		182	.	.	.	.	.	.				.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	A	N	P	Q	Q	A	P	R	A	E	Q	Y	D	T	R	K	T	I	K	Q	T	Q	A	G	L	R	Y	E	R	S	L	S	S	R	D	D	M	S	V	M	M	Y	A	G	E	R	E	T	T	Q	Y	Q	S	I	P	M	A	P	Q	L	N	P	S	H	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	K	R	L	P	T	D	F	N	E	G	A	K	N	N	T	Y	S	R	N	E	K	M	V	G	Y	S	F	D	H	E	F	N	D	T	F	T	V	R	Q	N	L	R	F	A	E	N	K	T	S	Q	N	S	V	Y	G	Y	G	V	C	S	D	P	A	N	A	Y	S	K	Q	C	A	A	L	A	P	A	D	K	G
Template Known Secondary structure		S					T	T				S		T	T																			S	S	S																								B	T	T	S	G	G	G	T	T		T	T	T	T	T	S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
											324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	V	I	T	L	Q	R	H	Y	Q	G	I	D	S	R	W	T	H	R	G	E	L	G	V	P	V	T	F	T	T	G	L	N	Y	E	N	M	S	E	N	R	K	G	Y	N	N	F	R	L	N	S	G	M	P	E	Y	G	Q	K	G	E	L	R	R	D	E	R	N	L	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	Y	L	A	R	K	Y	V	V	D	D	E	K	L	Q	N	F	S	V	D	T	Q	L	Q	S	K	F	A	T	G	D	I	D	H	T	L	L	T	G	V	D	F	M	R	M	R	N	D	I	N	A	W	F	G	Y	D	D	S	V	P	L	L	N	L	T	D	F	D	F	N	A	K	D	P	A	N	S	G	P	Y
Template Known Secondary structure		T		B																										S	S	S																									S	S	S	S										T	T				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	N	I	D	P	Y	L	Q	T	Q	W	Q	L	S	E	K	L	S	L	D	A	G	V	R	Y	S	S	V	W	F	D	S	N	D	H	Y	V	T	P	G	N	G	D	D	S	G	D	A	S	Y	H	K	W	L	P	A	G	S	L	K	Y	A	M	T	D	A	W	N	I	Y	L	A	A	G	R	G	F	E	T	P
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	I	L	N	K	Q	K	Q	T	G	V	Y	V	Q	D	Q	A	Q	W	D	K	V	L	V	T	L	G	G	R	Y	D	W	A	D	Q	E	S	L	N	R	V	A	G	T	T	D	K	R	D	D	K	Q	F	T	W	R	G	G	V	N	Y	L	F	D	N	G	V	T	P	Y	F	S	Y	S	E	S	F	E	P	S
Template Known Secondary structure																					T	T																			T	T	T	T																					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	I	N	E	L	S	Y	R	A	D	G	Q	S	G	M	N	L	G	L	K	P	S	T	N	D	T	I	E	I	G	S	K	T	R	I	G	D	G	L	L	S	L	A	L	F	Q	T	D	T	D	D	E	I	V	V	D	S	S	S	G	G	R	T	T	Y	K	N	A	G	K	T	R	R	Q	G	A	E	L	A	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	V	G	K	D	G	N	I	F	A	P	S	K	G	K	Q	Y	E	V	G	V	K	Y	V	P	E	D	R	P	I	V	V	T	G	A	V	Y	N	L	T	K	T	N	N	L	M	A	D	P	E	G	S	F	F	S	V	E	G	G	E	I	R	A	R	G	V	E	I	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.			B		T	T	S	S	B																		S	S	S																					T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.					.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.
Query Sequence		D	Q	R	F	A	G	D	F	R	V	N	A	S	W	T	W	L	D	A	T	Y	R	S	N	V	C	N	E	Q	D	C	N	G	N	R	M	P	G	I	A	R	N	M	G	F	A	S	I	G	Y	V	P	E	.	.	.	.	D	G	W	Y	A	G	T	E	A	R	Y	M	G	D	I	M	A	D	D	E	N	T	A
Query Conservation																																																							.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.
Template Sequence		K	A	A	L	S	A	S	V	N	V	V	G	S	Y	T	Y	T	D	A	E	Y	T	T	D	T	T	Y	.	.	.	.	K	G	N	T	P	A	Q	V	P	K	H	M	A	S	L	W	A	D	Y	T	F	F	D	G	P	L	S	G	L	T	L	G	T	G	G	R	Y	T	G	S	S	Y	G	D	P	A	N	S	F
Template Known Secondary structure						S	S	S																		T	T	T	.	.	.	.	T	T				T	T			S													S	S	T	T	T	T															S	S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Template SS confidence
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.					.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.
Query SS confidence																				.
Query Sequence		K	A	P	S	Y	T	L	V	G	L	F	T	G	Y	K	Y	N	Y	.	H	N	L	T	V	D	L	F	G	R	V	D	N	L	F	D	K	E	Y	V	G	S	V	I	V	N	E	S	N	G	R	Y	Y	E	P	S	P	G	R	N	Y	G	V	G	M	N	I	A	W
Query Conservation																				.
Alig confidence																				.																													.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	G	S	Y	T	V	V	D	A	L	V	R	Y	D	L	A	R	V	G	M	A	G	S	N	V	A	L	H	V	N	N	L	F	D	R	E	Y	V	A	S	C	F	N	T	Y	G	.	.	.	.	C	F	W	G	A	E	R	Q	V	V	A	T	A	T	F	R	F
Template Known Secondary structure																	G	G	G	G	T		S	S									S	T	T									S	S	T	T		.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.
Template SS confidence
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.					.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.