Job Description P76115 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:19:07 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 638 % Identity 17% Template c1xkwA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:fe(iii)-pyochelin receptor; PDBTitle: pyochelin outer membrane receptor fpta from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	A	A	D	E	Q	T	M	I	V	S	A	A	P	Q	V	V	S	E	L	D	T	P	A	A	V	S	V	V	D	G	E	E	M	R	L	A	T	P	R	I	N	L	S	E	S	L	T	G	V	P	G	L	Q	V	Q	N	R	Q	N	Y	A	Q	D	L	Q	L	S	I	R	G	F	G	S	R	S	T	Y	G
Query Conservation
Alig confidence																																								.																									.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																								.																									.	.												.	.	.	.
Template Sequence		S	T	S	A	T	Q	P	P	G	V	T	T	L	G	K	V	P	L	K	P	R	E	L	P	Q	S	A	S	V	I	D	H	E	R	L	E	Q	Q	.	N	L	F	S	L	D	E	A	M	Q	Q	A	T	G	V	T	V	Q	P	F	Q	L	L	T	.	.	T	A	Y	Y	V	R	G	F	K	V	D	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T				T	T		B		T	T	S	S		B		G	G	G		S	S													T	.	T			B							T	S	T	T								T	T		.	.						T	T					.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.																									.	.												.	.	.	.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.		.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.			.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		101	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.
Query SS confidence																																															.
Query Sequence		I	R	G	I	R	L	Y	V	D	G	I	P	A	T	M	P	D	G	Q	G	Q	T	S	N	I	D	L	S	S	V	Q	N	V	E	V	L	R	G	P	F	S	A	L	Y	G	.	N	A	S	G	G	V	M	N	V	T	T	Q	T	G	Q	Q	P	P	T	I	E	A	S	S	Y	Y	G	S	F	G	S	W	R	Y
Query Conservation																																															.
Alig confidence		.	.	.	.																.	.																									.
Template Conservation		.	.	.	.																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	S	F	E	L	D	G	V	P	A	L	L	G	N	T	A	.	.	S	S	P	Q	D	M	A	I	Y	E	R	V	E	I	L	R	G	S	N	G	L	L	H	G	T	G	N	P	A	A	T	V	N	L	V	R	K	R	P	Q	R	E	F	A	A	S	T	T	L	S	A	G	R	W	D	R	Y	R	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.					T	T						S	S	T	T	.	.					B		T	T									S			T	T	T	T		S			S	S												S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																.	.
Template SS confidence
						130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.
		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	K	A	T	G	A	T	G	D	G	T	Q	P	G	D	V	D	Y	T	V	S	T	T	R	F	T	T	H	G	Y	R	D	H	S	G	A	Q	K	N	L	A	N	A	K	L	G	V	R	I	D	E	A	S	K	L	S	L	I	F	N	S	V	D	I	K	A	D	D	P	G	G	L	T	K	A	E	W	K	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	V	D	V	G	G	P	L	S	A	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	E	D	R	D	Y	F	Y	D	V	A	D	Q	G	T	R	L	L	Y	G	V	T	E	F	D	L	S	P	D	T	L	L	T	V	G	A	Q	Y	Q	H	I	D	S	I	T	N	M	A	G	V	P	M	A	K	D	G	S	N	L
Template Known Secondary structure									S	S	S	S	S	S															S	S	S	S																		T	T																		S	S		B			B	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	Q	Q	A	P	R	A	E	Q	Y	D	T	R	K	T	I	K	Q	T	Q	A	G	L	R	Y	E	R	S	L	S	S	R	D	D	M	S	V	M	M	Y	A	G	E	R	E	T	T	Q	Y	Q	S	I	P	M	A	P	Q	L	N	P	S	H	A	G	G	V	I	T	L	Q	R	H	Y	Q	G	I	D	S	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	L	S	R	D	T	Y	L	D	V	D	W	D	R	F	K	W	D	T	Y	R	A	F	G	S	L	E	Q	Q	L	G	G	G	W	K	G	K	V	S	A	E	Y	Q	E	A	D	S	R	L	R	Y	A	G	S	F	G	A	I	D	P	Q	T	G	D	G	G	Q	L	M	G	A	A	Y	K	F	K	S	I	Q	R
Template Known Secondary structure					T	T				B		T	T																				T	T																							S		B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
		340	.	.	.	.	.	.	.	.							.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	T	H	R	G	E	L	G	V	.	.	.	.	.	.	P	V	T	F	T	T	G	L	N	Y	E	N	M	S	E	N	R	K	G	Y	N	N	F	R	L	N	S	G	M	P	E	Y	G	Q	K	G	E	L	R	R	D	E	R	N	L	M	W	N	I	D	P	Y	L	Q	T	Q	W	Q	L	S	E	K	L	S	L
Query Conservation											.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	L	D	A	N	L	N	G	P	V	R	L	F	G	L	T	H	E	L	L	G	G	V	T	Y	A	Q	G	E	T	R	Q	D	T	A	R	F	L	N	L	P	N	T	P	V	N	V	Y	R	W	D	P	H	G	V	P	R	P	Q	I	G	Q	Y	T	S	P	G	T	T	T	T	T	Q	K	G	L	Y	A	L	G
Template Known Secondary structure														T	T																							B	S	S								T	T	T			S	S	S						B				B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	G	V	R	Y	S	S	V	W	F	D	S	N	D	H	Y	V	T	P	G	N	G	D	D	S	G	D	A	S	Y	H	K	W	L	P	A	G	S	L	K	Y	A	M	T	D	A	W	N	I	Y	L	A	A	G	R	G	F	E	T	P	T	I	N	E	L	S	Y	R	A	D	G	Q	S	G	M	N	L	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	K	L	A	E	P	L	T	L	V	V	G	G	R	E	S	W	W	D	Q	D	T	P	A	T	R	F	K	P	G	R	Q	F	T	P	Y	G	G	L	I	W	D	F	A	R	D	W	S	W	Y	V	S	Y	A	E	V	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	P	L
Template Known Secondary structure							T	T																	S	S																					T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.																			.	.	.	.
		494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.			.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.				.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																								.	.	.
Query SS confidence																				.	.																								.	.	.
Query Sequence		K	P	S	T	N	D	T	I	E	I	G	S	K	T	R	I	G	D	.	.	G	L	L	S	L	A	L	F	Q	T	D	T	D	D	E	I	V	V	D	S	S	S	G	.	.	.	G	R	T	T	Y	K	N	A	G	K	T	R	R	Q	G	A	E	L	A	W	D	Q	R	F	A	G	D	F	R	V	N	A	S	W
Query Conservation																				.	.																								.	.	.
Alig confidence																				.	.																								.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	P	V	E	G	K	T	Y	E	T	G	I	K	G	E	L	A	D	G	R	L	N	L	S	L	A	A	F	R	I	D	L	E	N	N	P	Q	E	D	P	D	H	P	G	P	P	N	N	P	F	Y	I	S	G	G	K	V	R	S	Q	G	F	E	L	E	G	T	G	Y	L	T	P	Y	W	S	L	S	A	G	Y
Template Known Secondary structure																		G	G	G	T																				S	S	S			S	T	T																									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
		569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.				.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.		.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.																						.
Query SS confidence																																									.	.	.																						.
Query Sequence		T	W	L	D	A	T	Y	R	S	N	V	C	N	E	Q	D	C	N	G	N	R	M	P	G	I	A	R	N	M	G	F	A	S	I	G	Y	V	P	E	.	.	.	D	G	W	Y	A	G	T	E	A	R	Y	M	G	D	I	M	A	D	D	E	N	.	T	A	K	A	P	S	Y	T	L	V	G	L	F	T	G	Y
Query Conservation																																									.	.	.																						.
Alig confidence											.	.																													.	.	.																						.
Template Conservation											.	.
Template Sequence		T	Y	T	S	T	E	Y	L	K	.	.	D	S	Q	N	D	S	G	T	R	Y	S	T	F	T	P	R	H	L	L	R	L	W	S	N	Y	D	L	P	W	Q	D	R	R	W	S	V	G	G	G	L	Q	A	Q	S	D	Y	S	V	D	Y	R	G	V	S	M	R	Q	G	G	Y	A	L	V	N	M	R	L	G	Y
Template Known Secondary structure											.	.		T	T	S		T	T		B	S		T	T	S		S												S																							T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.
Template SS confidence
		596	.	.	.	600	.	.	.	.			.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.
		645	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Y	N	Y	H	N	L	T	V	D	L	F	G	R	V	D	N	L	F	D	K	E	Y	V	G	S	V	I	V	N	E	S	N	G	R	Y	Y	E	P	S	P	G	R	N	Y	G	V	G	M	N	I	A	W
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.																										.	.	.
Template Conservation							.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		K	I	D	E	H	.	.	.	W	T	A	A	V	N	V	N	N	L	F	D	R	T	Y	Y	Q	S	L	S	N	P	N	W	N	.	.	.	N	R	Y	G	E	P	R	S	F	N	V	S	L	R	G	A	F
Template Known Secondary structure			S	S	S	S	.	.	.									S	T	T											T	T	S		.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure							.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		674	.	.	.	.				.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.				.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720