Job Description P76115 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:19:07 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 636 % Identity 17% Template c1xkhC_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: C: PDB Molecule:ferripyoverdine receptor; PDBTitle: pyoverdine outer membrane receptor fpva from pseudomonas aeruginosa2 pao1 bound to pyoverdine Resolution 3.60 Å

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		26	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	T	M	I	V	S	A	A	P	Q	V	V	S	E	L	D	T	P	A	A	V	S	V	V	D	G	E	E	M	R	L	A	T	P	R	I	N	L	S	E	S	L	T	G	V	P	G	L	Q	V	Q	N	R	Q	N	Y	A	Q	D	L	Q	L	S	I	R	G	F	G	S	R	S	T	Y	G	I	R	G	I	R
Query Conservation
Alig confidence																																			.																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	P	G	T	I	A	T	A	T	R	L	V	L	T	P	R	E	T	P	Q	S	I	T	V	V	T	R	Q	N	X	D	D	F	.	G	L	N	N	I	D	D	V	X	R	H	T	P	G	I	T	V	S	A	Y	D	.	.	T	D	R	N	N	Y	Y	A	R	G	F	S	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	N
Template Known Secondary structure		S						T	T	T	S	S				S	T	T			S													T	.	T			B	S					T	T	S	T	T								.	.	T	T							T	T					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.																						.	.															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.			.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.									.
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.		.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.
Predicted Secondary structure													.	.																														.
Query SS confidence													.	.																														.
Query Sequence		L	Y	V	D	G	I	P	A	T	M	P	.	.	D	G	Q	G	Q	T	S	N	I	D	L	S	S	V	Q	N	V	E	V	L	R	G	P	F	S	A	L	Y	G	.	N	A	S	G	G	V	M	N	V	T	T	Q	T	G	Q	Q	P	P	T	I	E	A	S	S	Y	Y	G	S	F	G	S	W	R	Y	G	L	K
Query Conservation													.	.																														.
Alig confidence													.	.																														.
Template Conservation
Template Sequence		F	Q	Y	D	G	I	P	S	T	A	R	N	V	G	Y	S	A	G	N	T	L	S	D	X	A	I	Y	D	R	V	E	V	L	K	G	A	T	G	L	L	T	G	A	G	S	L	G	A	T	I	N	L	I	R	K	K	P	T	H	E	F	K	G	H	V	E	L	G	A	G	S	W	D	N	Y	R	S	E	L	D
Template Known Secondary structure		B		B	T	T	B							S	T	T			S	T	T			B	S	T	T											G	G	G	T	S		S			S				B									S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		183	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250							.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	T	G	A	T	G	D	G	T	Q	P	G	D	V	D	Y	T	V	S	T	T	R	F	T	T	H	G	Y	R	D	H	S	G	A	Q	K	N	L	A	N	A	K	L	G	V	R	I	D	E	A	S	K	L	S	L	I	F	N	S	V	D	I	K	A	D	D	P	G	.	.	.	.	.	.	G	L	T	K	A	E
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.																																																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		V	S	G	P	L	T	E	.	.	.	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	Q	D	K	H	S	F	X	D	H	Y	E	R	K	T	S	V	Y	Y	G	I	L	E	F	D	L	N	P	D	T	X	L	T	V	G	A	D	Y	Q	D	N	D	P	K	G	S	G	W	S	G	S	F	P	L	F	D	S	Q	G
Template Known Secondary structure						S	S	T	.	.	.	T		S															S	S	T	T																	T	T	S																S				S	S	S	S		S	B		S	S	S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.				.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	K	A	N	P	Q	Q	A	P	R	A	E	Q	Y	D	T	R	K	T	I	K	Q	T	Q	A	G	L	R	Y	E	R	S	L	S	S	R	D	D	M	S	V	M	M	Y	A	G	E	R	E	T	T	Q	Y	Q	S	I	P	M	A	P	Q	L	N	P	S	H	A	G	G	V	I	T	L	Q	R	H	Y	Q	G	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	R	N	D	V	S	R	S	F	N	N	G	A	K	W	S	S	W	E	Q	Y	T	R	T	V	F	A	N	L	E	H	N	F	A	N	G	W	V	G	K	V	Q	L	D	H	K	I	N	G	Y	H	A	P	L	G	A	I	X	G	D	W	P	A	P	D	N	S	A	K	I	V	A	Q	K	Y	T	G	E	T	K
Template Known Secondary structure		S	B					T	T				B		T	T																			T	T	S																							S	S				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.						.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.
Query Sequence		D	S	R	W	T	H	R	G	E	.	.	.	.	.	L	G	V	P	V	T	F	T	T	G	L	N	Y	E	N	M	S	E	N	R	K	G	Y	N	N	F	R	L	N	S	G	M	P	E	Y	G	Q	K	G	E	L	R	R	D	E	R	N	L	M	W	N	I	D	P	Y	L	Q	T	Q	W	Q	L	S	E	K	L
Query Conservation											.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	S	L	D	I	Y	L	T	G	P	F	Q	F	L	G	R	E	H	E	L	V	V	G	T	S	A	S	F	S	H	W	E	G	K	S	Y	W	N	L	R	N	Y	D	N	T	T	D	D	F	I	N	W	D	G	D	I	G	K	P	D	W	G	T	P	S	Q	Y	I	D	D	K	T	R	Q	L	G	S	Y	X
Template Known Secondary structure															S	S	S	S																									S						S		S	S	S												S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	D	A	G	V	R	Y	S	S	V	W	F	D	S	N	D	H	Y	V	T	P	G	N	G	D	D	S	G	D	A	S	Y	H	K	W	L	P	A	G	S	L	K	Y	A	M	T	D	A	W	N	I	Y	L	A	A	G	R	G	F	E	T	P	T	I	N	E	L	S	Y	R	A	D	G	Q	S	G	M	N	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	A	R	F	N	V	T	D	D	L	N	L	F	L	G	G	R	V	V	D	Y	R	V	T	G	L	N	P	T	I	R	E	S	G	R	F	I	P	Y	V	G	A	V	Y	D	L	N	D	T	Y	S	V	Y	A	S	Y	T	D	I	F	X	P	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	S	W	Y	R	D	S	S	N	K
Template Known Secondary structure							S	S	S	S																S	S	S	S																			S	S	S																.	.	.	.	.	.	.	T	T				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.								.	.	600	.	.	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.			510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.							.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	K	P	S	T	N	D	T	I	E	I	G	S	K	T	R	I	.	.	G	D	G	L	L	S	L	A	L	F	Q	T	D	T	D	D	E	I	V	V	D	S	S	S	G	G	R	T	T	.	.	.	.	.	.	Y	K	N	A	G	K	T	R	R	Q	G	A	E	L	A	W	D	Q	R	F	A	G	D	F	R
Query Conservation																				.	.																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	E	P	D	E	G	Q	N	Y	E	I	G	I	K	G	E	Y	L	D	G	R	L	N	T	S	L	A	Y	F	E	I	H	E	E	N	R	A	E	E	D	A	L	Y	N	S	K	P	T	N	P	A	I	T	Y	A	Y	K	G	I	K	A	K	T	K	G	Y	E	A	E	I	S	G	E	L	A	P	G	W	Q
Template Known Secondary structure																				T	T	T	T																				S	S	T	T	S					T	T		S																					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.				.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.								630	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	N	A	S	W	T	W	L	D	A	T	Y	R	S	N	V	C	N	E	Q	D	C	N	G	N	R	M	P	G	I	A	R	N	M	G	F	A	S	I	G	Y	V	P	E	.	.	.	D	G	W	Y	A	G	T	E	A	R	Y	M	G	D	I	M	A	D	D	E	N	T	.	.	.	.	.	.	.	A	K	A	P
Query Conservation																																														.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	Q	A	G	Y	T	H	K	I	I	R	D	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	K	V	S	T	W	E	P	Q	D	Q	L	S	L	Y	T	S	Y	K	F	K	G	A	L	D	K	L	T	V	G	G	G	A	R	W	Q	G	K	S	W	Q	X	V	Y	N	N	P	R	S	R	W	E	K	F	S	Q	E
Template Known Secondary structure														T	T	.	.	.	.	.	.	.	.			B			T	T	S		S													G	G	G	T	T																				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		687	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700									.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
		634	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	T	L	V	G	L	F	T	G	Y	K	Y	N	Y	H	N	L	T	V	D	L	F	G	R	V	D	N	L	F	D	K	E	Y	V	G	S	V	I	V	N	E	S	N	G	R	Y	Y	E	P	S	P	G	R	N	Y	G	V	G	M	N	I	A	W
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.																									.	.	.	.
Template Sequence		D	Y	W	L	V	D	L	X	A	R	Y	Q	I	T	D	K	.	.	.	L	S	A	S	V	N	V	N	N	V	F	D	K	T	Y	Y	T	N	I	G	F	Y	T	S	.	.	.	.	A	S	Y	G	D	P	R	N	L	X	F	S	T	R	W	D	F
Template Known Secondary structure															S	S	S	.	.	.								T	T	T	T								S		S	S	S		.	.	.	.							S								S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.																									.	.	.	.
Template SS confidence
		759	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.				.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.					.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.