Job Description P77561 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 557 % Identity 19% Template d1vlfm2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.00

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.											.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Query Sequence		D	C	P	G	C	A	W	P	D	P	K	H	S	A	S	F	D	I	C	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	A	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	F	F	A	E	N	T	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	G	R	L	T	Q	P	L	K	Y	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		S	S	T	G	G	P	V	F	V	Y	V	K	D	G	K	I	I	R	M	T	P	M	D	F	D	D	A	V	D	A	P	S	W	K	I	E	A	R	G	K	T	F	T	P	P	.	.	.	.	.	R	K	T	S	I	A	P	Y	T	A	G	F	K	S	M	I	Y	S	D	L	R	I	P	Y	P	M	K	R	K	S
Template Known Secondary structure				T	T									T	T									B			T	T	T	S									T	T							.	.	.	.	.	S	B									T	T					T		T	T	B			S					T	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.						.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		116	.	.	.	120	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.				.	.	.	.	.	.	.	.		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.									.																				.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.									.																				.	.	.	.	.
Query Sequence		D	A	V	S	D	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	.	.	.	S	D	P	N	Q	V	E	F	.	Y	T	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	Q	L	F	A	R	.	.	.	.	.
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.									.																				.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.									.																				.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	P	N	G	E	R	N	P	Q	L	R	G	A	G	L	S	K	Q	D	P	W	S	D	Y	E	R	I	S	W	D	E	A	T	D	I	V	V	A	E	I	N	R	I	K	H	A	Y	G	P	S	A	I	L	S	T	P	S	S	H	H	M	W	G	N	V	G	Y	R	H	S	T	Y	F	R	F	M	N	M	M
Template Known Secondary structure				T	T	S				G	G	G	T	T					T	T		G	G	G	G																								T		G	G	G							S				S		T	T	T	S	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
				169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.		.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.		.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.						.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																					.																		.																					.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																					.																		.																					.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	E	Y	G	S	N	N	F	P	D	C	S	N	M	C	H	E	P	T	S	V	.	G	L	A	A	S	I	G	V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	.	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	.	.	.	.	.	M	L	T	S	L	R	A	L	V	K	R	G	A	K
Query Conservation		.	.																					.																		.																					.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																					.																		.																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	T	Y	A	D	H	N	P	D	S	W	E	G	W	H	W	G	G	M	H	M	W	G	F	S	W	R	L	G	N	P	E	Q	Y	D	L	L	E	D	G	L	K	H	A	E	M	I	V	F	W	S	S	D	P	E	T	N	S	G	I	Y	A	G	F	E	S	N	I	R	R	Q	W	L	K	D	L	G	V	D
Template Known Secondary structure											T	T	T						T								G	G	G	T	T					T	T										S						S								S	S	S		T	T	T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.
Query SS confidence																																		.
Query Sequence		M	I	A	I	N	P	L	Q	E	R	G	L	E	R	F	T	A	P	Q	N	P	F	E	M	L	T	N	S	E	T	Q	L	.	A	S	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A	A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H
Query Conservation																																		.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	F	I	D	P	H	M	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	A	R	L	V	A	D	K	W	F	S	P	K	I	G	T	D	H	A	L	S	F	A	I	A	Y	T	W	L	K	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Y	D	K	E	Y	V	A	A	N
Template Known Secondary structure							S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S							T	T																	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.											.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.							330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.					.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Query Sequence		T	V	G	F	D	E	L	R	R	D	V	.	.	.	.	.	.	L	N	S	E	W	K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	A	A	E	R	T	I	I	C	Y	G	M	.	.	.	.	G	I	T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M
Query Conservation													.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	H	G	F	E	E	W	A	D	Y	V	L	G	K	T	D	G	T	P	K	T	C	E	W	A	E	E	E	S	G	V	P	A	C	E	I	R	A	L	A	R	Q	W	A	K	K	N	T	Y	L	A	A	G	G	L	G	G	W	G	G	A	C	R	A	S	H	G	I	E	W	A	R	G	M	I	A	L	A	T	M
Template Known Secondary structure				S									T	T	T	T	T	S																													S							T	T	T	T	S			G	G	G	S	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.										.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.													.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G	H	S	N	V	Q	G	D	R	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	T	E	K	P	S	A	E	F	L	A	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	H	A	P	G	H	A	A	I	A	S
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		Q	G	.	M	G	K	P	G	S	N	M	W	S	T	T	Q	G	V	P	L	D	Y	E	F	Y	F	P	G	Y	A	E	G	G	I	S	G	D	C	E	N	S	A	A	G	F	K	F	A	W	R	M	F	D	G	K	T	T	F	P	S	P	S	N	L	N	T	S	A	G	Q	H	I	P	R	L	K	I	P	E	C
Template Known Secondary structure		T	T	.	T	T	S	T	T						S	S	S						T	T	S					G	G	G		T	T	S			T	T	T	S	G	G	G	T	T								S	S	S							S	S	S	S	T	T	S					G	G	G
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		377	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
		448	.	450	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480			.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		M	Q	A	I	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F	A	L	A	M	P	D	R	E	A	S	A	V	P	L	.	.	T	Q	L	D	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	M	G	G	K	F	Q	W	S	G	K	G	F	A	G	G	D	I	S	H	Q	L	H	Q	Y	E	Y	P	A	P	G	Y	S	K	I	K	M	F	W	K	Y	G	G	P	H	L	G	T	M	T	A	T	N	R	Y	A	K	M	Y	T	H	D	S	L	E	F	V	V	S	Q	S	I	W	F	E	G	E	V	P	F
Template Known Secondary structure					S								S	S			S	S	T	T	G	G	G						S		T	T											S							S	S	S	T							T	T		T	T									S	B	S		T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.							.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	A	R	H	S	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	.	.	.	.	.	.	V	T	V	E	D	S	M	S	M	I	H	A	S	R	G	V	L	K	P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I	A	Q	A	A	L	P	Q	S	V	V	A	W	E	Y	L
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.																						.	.	.	.	.	.																					.																												.
Template Conservation			.	.	.																																																.																												.
Template Sequence		A	.	.	.	D	I	I	L	P	A	C	T	N	F	E	R	W	D	I	S	E	F	A	N	C	S	G	Y	I	P	D	N	Y	Q	L	C	N	H	R	V	I	S	L	Q	A	K	C	I	E	P	V	.	G	E	S	M	S	D	Y	E	I	Y	R	L	F	A	K	K	L	N	I	E	E	M	F	S	E	G	K	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	S					B			G	G	G	S						T	T			B	T	T	B	T	T	G	G	G	G	S	S	S										S			S	.	T	T		B													T	T							T	T		.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.																																																.																												.
Template SS confidence
		536				.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.		.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
		574	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	D	Y	D	R	I	R	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q	R	I	R	H	P	G	G	F	H	L	I	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	A	E	R	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	D	E	L	A	W	C	E	Q	Y	F	N	A	T	D	M	P	K	Y	M	T	W	D	E	F	F	K	K	G	Y	F	V	V	P	D	N	P	N	R	K	K	T	V	A	L	R	W	F	A	E	G	R	E	K	D	T	P	D	W	G	P	R	L	N	N	Q	V	C	R	K	G	L	Q	T	T	T	G	K	V	E
Template Known Secondary structure		.												T	S	S	G	G	G	T																		T	T	S					T	T					T	T	S				S	S		S		S		G	G	G	S	B	T	T	B	S		S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		624	.																			.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	K	G	L	L	E	D	P	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	I	A	T	S	L	K	N	F	E	E	Q	G	Y	I	D	E	H	R	P	S	M	H	T	Y	V	P	A	W	E	S	Q	K	H	S	P	L	A	V
Template Known Secondary structure		S	B										T	T				T	T	S		S	B							T	T	S	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.