Job Description P77561 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 608 % Identity 22% Template d1kqfa2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.60

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.											.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	M	N	K	P	E	G	F	D	C	P	G	C	A	W	P	D	P	K	H	S	A	S	F	D	I	C	E	N	G	A	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	F	A	E	N	T	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	G	R
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	R	A	K	E	I	R	N	T	C	T	Y	C	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	C	G	L	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	P	D	H	P	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R
Template Known Secondary structure		T	T	T	S								S	S	B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T										S		S		T	T	S											T	T		T	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.													.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.																.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	Q	P	L	K	Y	D	A	V	S	D	C	Y	K	P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	N	Q	V	E	F	Y	T	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	Q	L	F	A	R	E	Y	G	S	N
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	R	Y	P	E	Y	R	A	P	G	S	D	K	W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	C	A	S	G	A	S	N	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L	G	M	L
Template Known Secondary structure				S						T	T		S	S																														T	T	S						B		S							T	T	S															T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.		.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.
Query SS confidence																																																																	.
Query Sequence		N	F	P	D	C	S	N	M	C	H	E	P	T	S	V	G	L	A	A	S	I	G	V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	M	L	T	S	L	R	A	L	V	K	R	.	G	A	K	M	I	A	I	N	P	L	Q	E	R	G	L	E
Query Conservation																																																																	.
Alig confidence									.																																																								.													.	.	.	.
Template Conservation									.																																																																					.	.	.	.
Template Sequence		A	V	D	N	Q	A	R	.	V	H	G	P	T	V	A	S	L	A	P	T	F	G	R	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	F	R	W	A	M	E	A	K	N	N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R	F	T	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G	.														S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T	T	T										S									S	S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.																																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		188	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	F	T	A	P	Q	N	P	F	E	M	L	T	N	S	E	T	Q	L	A	S	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A	A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H	T	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	A	S	V	A	D	I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T		S							T	T																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.											.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																											322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	E	L	R	R	D	V	L	N	S	E	W	K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	A	A	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	L	F	S	G	Y	D	A	E	K	R	Q	Y	D	K	S	S	W	N	Y	Q	L	D	E	N	G	Y	A	K	R	D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	S	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A
Template Known Secondary structure		T	T			T	T			T	T	T	T					T	T	S	S	B		B		T	T	S	S	B		B		T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
				359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	E	R	T	I	I	C	Y	G	M	G	I	T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M	K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G	H	S	N	V	Q	G	D	R	T	V	G	I	T	E	K	P	S	A	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W	T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M	A	M	I	Q	L	L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q
Template Known Secondary structure		T	T								S					S	S	T	T																T		T	T		T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																								425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	P	P	H	A	P	G	H	A	A	I	A	S	M	Q	A	I	C	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A	D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F	V	S	L	M	K	S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P
Template Known Secondary structure								S				S	S	S	S				G	G	G	G														G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		467	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500															.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	A	M	P	D	R	E	A	S	A	V	P	L	T	Q	L	D	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	H	S	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	V	T	V	E	D	S	M	S
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	S	F	P	D	K	N	K	V	V	S	C	L	S	K	L	K	Y	M	V	V	I	D	P	L	V	T	E	T	S	T	F	W	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	N	S	G	R
Template Known Secondary structure					S	S	S									T	T		S							S	B			T	T	T	T	T	T	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.					T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.									.	.	.	.	.	630	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	I	H	A	S	R	G	V	L	K	P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I	A	Q	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	S	V	V	A	W	E	Y	L	V	E	D	Y	D	R	I	R	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.
Template Sequence		W	L	Q	W	H	W	K	G	Q	D	A	P	.	G	E	A	R	N	D	G	E	I	L	A	G	I	Y	H	H	L	R	E	L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	N	G	Y	A	L	E	D	L	Y	D	A	N	G
Template Known Secondary structure										S			S	.	T	T		B																							S	S							S					S	S	T	T	S															S	S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.		.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.		.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.													.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	I	R	H	P	G	G	F	H	L	I	N	A	A	A	.	E	R	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N	F	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	G	L	L	E	D	P	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M	A	T	V	R	S	H	D	Q	Y	N	T	T	I	Y	G	M	D	D	R
Query Conservation																	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L	S	S	F	A	H	L	R	D	D	G	T	T	A	S	S	C	W	I	Y	T	G	S	W	T	E	Q	G	N	Q	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	W	A	W	A	W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	N	G	K	P
Template Known Secondary structure							T	T		B		S		G	G	G			S	S	S	S				S		G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		711	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	R	G	V	F	G	Q	R	D	V	V	F	M	S	A	K	Q	A	K	I	C	R	V	K	N	G	E	R	V	N	L	I	A	L	T	P
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.
Template Conservation			.	.	.
Template Sequence		W	.	.	.	D	P	K	R	M	L	I	Q	W	N	G	S	K	W	T	G	N	D	I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T	G
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	S	T	T	S							S	S	S				S	S			S	S		S			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.
Template SS confidence
		791				.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.