Job Description P77561 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Rank 13 Aligned Residues 671 % Identity 22% Template c1y5iA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:respiratory nitrate reductase 1 alpha chain; PDBTitle: the crystal structure of the narghi mutant nari-k86a Resolution 1.90 Å

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		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.			.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	A	W	P	D	P	K	H	S	A	S	F	D	I	C	E	N	G	A	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	F	F	A	E	N	T	.	.	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	G	R	L	T	Q	P	L	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K	M	W	R	E	A	K	A	L	H
Template Known Secondary structure				S	S	S	S											T	T											S					T	T	S				T	T								T	G	G	G	G	G	T	S	T	T	B			S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
																								116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.				.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.																							.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.																							.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	V	S	D	C	Y	K	P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	.	.	.	S	D	P	N	Q	V	E	F	Y	T	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	.	Q	L	F	A	R	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.																							.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.																							.
Template Conservation
Template Sequence		S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	Q	A	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S	M	V	S	Y	A	S	G	A	R	Y	L	S	L
Template Known Secondary structure		S	S										T										T	T	T	T	S	S																									T		G	G	G								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	S	N	N	F	P	D	C	S	N	M	C	H	E	P	T	S	V	G	L	A	A	S	I	G	V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	M	L	T	S	L	R	A	L	V	K	R	G	A	K	M	I	A	I	N	P	L	Q	E	R
Query Conservation
Alig confidence																		.	.																																																														.
Template Conservation																		.	.																																																														.
Template Sequence		I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	W	Y	C	D	L	P	.	.	P	A	S	P	Q	T	W	G	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	H	F	F	T	E	V	R	Y	K	G	T	K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	.
Template Known Secondary structure			T							T	T	T	T	T		S		.	.	T							S		S										T	T		S						S							S	G	G	G								G	G	G	T								S	S			.
Template Predicted Secondary structure																		.	.																																																														.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.			.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	L	E	R	F	T	A	P	Q	N	P	F	E	M	L	T	N	S	E	T	Q	L	A	S	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A	A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H	T	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	A	K	L	C	D	L	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	.	.	.	.	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M	P	M	L	V	M	L	E	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	S	S							T	T																		T	T	T	S			.	.	.	.											B	S	T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.
Template SS confidence
																			286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.					.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	D	G	Y	Y	A	A	G	R	M	L	R	A	A	D	L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q	L	S	L	L	G	S	Q	D
Template Known Secondary structure			S	S	S								B	G	G	G	B	T	T	G	G	G			S	S	G	G	G		B				B	T	T	S					B	T	T	S	G	G	G	T	S	S	S		S			S		S	S	B	B	T	T	T			B			B					T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
																																																			322	.	.	.	.	.	.																			.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	E	L	R	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	N	S	E	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	A	E	V	G	F	P	Y	F	G	G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A	N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y	D	D	V	K	A	Y	T	P
Template Known Secondary structure												T	T				T	T	S							S													B	T	T	S																T	T	B			S	S			T	T	S	B	S	S	T	T	S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.						.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.																																																					.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.																																																					.
Query Sequence		K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	.	.	.	.	.	A	A	E	R	T	I	I	C	Y	G	M	G	I	T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M	K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G	H	S	N	V	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.																																																					.
Alig confidence																								.	.	.	.	.																																																					.
Template Conservation
Template Sequence		A	W	A	E	Q	I	T	G	V	S	R	S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I	V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H	Y	V	G	Q	E	K	L	R
Template Known Secondary structure																														T	S												T	S	T	T															T	T		T	T	S	T	T							S	S					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
																																																409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	D	R	T	V	G	I	T	E	K	P	S	A	E	F	L	A	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	P	P	H	A	P	G	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	Q	T	G	W	Q	P	L	A	F	A	L	D	W	Q	R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P	S	A	P	Q	L	G	T	N
Template Known Secondary structure		S										T	T	T	T		S															T	T	G	G	G	G					S	G	G	G	S		T	T	S		G	G	G	S		S												T	T	S	S			S	S		B	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
		443	.	.	.	.	.	.	450																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	I	A	S	M	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	C	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F	A	L	A	M	P	D	R	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	L	T	I	A	G	E	A	E	K	A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H	G	I	Q	G	K	D	L	G
Template Known Secondary structure		T	T	S								T	T	S													T	S	S		B	G	G	G		T	T	S	S	S	S	S								S			T	T	T	T	T		S	S								T	T		S						S			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
														475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	A	V	P	L	T	Q	L	D	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L	T	A	R	H	S	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	V	T	V	E	D	S	M	S	M	I	H	A	S	R	G	V	L	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	Q	G	G	V	K	P	E	E	V	D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C	L	Y	S	.	.	.	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	.	.	.	.	.	.	.	M	N	T	S	D	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D
Template Known Secondary structure		T	T	T					S	S	S				S	S							S							S	B							T		.	.	.	S					B			T	T	S	S			.	.	.	.	.	.	.					S	S	S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		745	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.				.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.								.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I	A	Q	A	A	L	P	Q	S	V	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		P	A	.	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y	K	A	I	A	K	K	F	S	E	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P
Template Known Secondary structure			S	.	T	T		B																	T	T	T	T													B	T	T	S	G	G	G				S	S	S				G	G	G	T	S	S				B	T	T	T	B										G	G
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		815	.		.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.
																									569	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	E	Y	L	V	E	D	Y	D	R	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	T	Y	E	R	F	T	S	I	G	P	L	M	E	K	I	G	N	G	G	K	G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A	P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A
Template Known Secondary structure		G						T	B			T					T					T	T																		B			S	S	T	T	T	T	S	B	B			S													T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		894	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.
												582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q	R	I	R	H	P	G	G	F	H	L	I	N	A	A	A	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N	F	I	T	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A	L	N	K	E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D
Template Known Secondary structure							S	S			G	G	G	T	G	G	G	T	T		B									S								T	T	S	S	S				S	S	S				T	T											S	S	T	T	S	S	B						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		974	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.
																			627	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	G	L	L	E	D	P	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M	A	T	V	R	S	H	D	Q	Y	N	T	T	I	Y	G	M	D	D	R	Y	R	G	V	F	G	Q	R	D	V	V	F	M	S	A	K	Q	A	K	I	C	R	V	K	N	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		F	G	E	S	L	L	V	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	K	E	V	I	G	Q	K	S	N	G	N	Q	E	K	A	L	N	F	L	T	P	H	Q	K	W	G	I	H	S	T	.	Y	S	D	N	L	L	M	L	T	L	G	R	G	G	P	V	V	W	L	S	E	A	D	A	K	D	L	G	I	A	D	N
Template Known Secondary structure		T	T		S	S												S	T	T	T	T	T	T	T			S	S											B		S	S	S	B	T	T	B	.	T	T	T								T	T	S	S														T			T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		1054	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.
		690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.												.	730	.	.	.	.	.	.	.	.																.	740	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	R	V	N	L	I	A	L	T	P	D	G	K	R	S	S	R	R	M	D	R	L	K	V	V	I	Y	P	M	A	D	R	S	L	V	T	Y	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	N	H	M	L	T	L	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	P	L	S
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	W	I	E	V	F	N	S	N	G	A	L	T	A	R	A	V	V	S	Q	R	V	P	A	G	M	T	M	M	Y	H	A	Q	E	R	I	V	N	L	P	G	S	E	I	T	Q	Q	R	G	G	I	H	N	S	V	T	R	I	T	P	K	P	T	H	M	I	G	G	Y	A	H	L	A	Y	G	F	N	Y	Y	G
Template Known Secondary structure									T	T											T	T	S		T	T						B				S	S	S	S			B		T	T	T	S	S	B		B		G	G	G	S							G	G	G	S			S	B	T	T	B	S	B		T	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1133	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.
		744	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	P	G	Y	K	S	I	P	V	E	L	E	P	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	V	G	S	N	R	D	E	F	V	V	V	R	K	M
Template Known Secondary structure							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1213	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.