Job Description P77561 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 661 % Identity 25% Template c1kqgA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit; PDBTitle: formate dehydrogenase n from e. coli Resolution 2.80 Å

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		47	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	C	P	G	C	A	W	P	D	P	K	H	S	A	S	F	D	I	C	E	N	G	A	.	.	.	.	.	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	F	F	A	E	N	T	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	G	R	L	T	Q	P	L	K	Y	D	A	V	S	D	C
Query Conservation																										.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.										.	.	.	.	.													.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.																											.	.	.	.
Template Sequence		N	T	C	T	Y	C	S	V	G	C	G	L	.	.	.	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	P	D	H	P	.	.	.	.	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R	L	R	Y	P	E	Y	R	A	P	G	S	D	K
Template Known Secondary structure					S	S	B	T	T					.	.	.						S		S		T	T	S											T	T		T	.	.	.	.	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B			S						T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																											.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.				60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.					.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
		122	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.																.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	S	D	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	E	F	Y	T	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	Q	L	F	A	R	E	Y	G	S	N	N	F	P	D	C	S	N	M	C	H	E	P	T
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	C	A	S	G	A	S	N	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L	G	M	L	A	V	D	N	Q	A	R	.	V	H	G	P	T
Template Known Secondary structure																															T	T	S						B		S							T	T	S															T	T	B						G	G	G	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.		.	.	.	.	.
		187	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.		.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		S	V	G	L	A	A	S	I	G	V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	M	L	T	S	L	R	A	L	V	K	R	G	.	A	K	M	I	A	I	N	P	L	Q	E	R	G	L	E	R	F	T	A	P	Q	N	P	F	E	M	L	T
Query Conservation																																																					.
Alig confidence																																																					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	S	L	A	P	T	F	G	R	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	F	R	W	A	M	E	A	K	N	N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										S			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S														S									S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	E	T	Q	L	A	S	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A	A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H	T	V	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	R	T	A	S	V	A	D	I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E	D	G	L	F	S	G	Y	D	A	E	K	R	Q
Template Known Secondary structure		.					T		S							T	T																T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.											.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
																														322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.					.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	E	L	R	R	D	V	L	N	S	E	W	K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	A	A	.	.	.	.	E	R	T	I	I	C	Y	G	M	G	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	K	S	S	W	N	Y	Q	L	D	E	N	G	Y	A	K	R	D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	S	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A	P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W
Template Known Secondary structure					T	T	S	S	B		B		T	T	S	S	B		B		T	T	S		S	T	T	B										T	T																										G	G	G	S	T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M	K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G	H	S	N	V	Q	G	D	R	T	V	G	I	T	E	K	P	S	A	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M	A	M	I	Q	L	L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q	S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A
Template Known Secondary structure			S	S	T	T															T	T		T	T	S	T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S									S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
																											425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	P	P	H	A	P	G	H	A	A	I	A	S	M	Q	A	I	C	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F	A	L	A	M	P	D	R	E	A	S	A	V	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F	V	S	L	M	K	S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P	V	A	S	F	P	D	K	N	K	V	V	S	C
Template Known Secondary structure		S				G	G	G	G														G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	Q	L	D	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L	T	A	R	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	V	T	V	E	D	S	M	S	M	I	H	A	S	R	G	V	L	K
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	S	K	L	K	Y	M	V	V	I	D	P	L	V	T	E	T	S	T	F	W	.	.	.	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	A	N	S	G	R	W	L	Q	W	H	W	K	G	Q	D
Template Known Secondary structure			T	T		S							S	B			T	G	G	G	T	T	.	.	.	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S									S
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.				.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.									.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I	A	Q	A	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	S	V	V	A	W	E	Y	L	V	E	D	Y	D	R	I	R	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q	R	I	R	H	P	G	G	F	H	L
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.
Template Sequence		A	P	.	G	E	A	R	N	D	G	E	I	L	A	G	I	Y	H	H	L	R	E	L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	N	G	Y	A	L	E	D	L	Y	D	A	N	G	V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L
Template Known Secondary structure			S	.	T	T		B																							S	S							S					S	S	T	T	S															S	S					T	T	S						T	T		B
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		642	.		.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
		607	.	.	610	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	N	A	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	S	F	A	H	L	R	D	D	G	T	T	A	S	S	C	W	I	Y	T	G	S	W	T	E	Q	G	N	Q	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	W	A	W	A	W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	N	G	K	P	W	D	P	K	R	M	L	I	Q	W
Template Known Secondary structure		S		G	G	G			S	S	S	S				S		G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		721	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800
																612	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	630	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N	F	I	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	L	L	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	G	S	K	W	T	G	N	D	I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T	G	P	F	I	M	Q	P	E	G	M	G	R	L	F	A	I	N	K	M	A	E	G	P	F	P	E	H	Y	E	P	I	E	T	P	L	G	T	N	P	L	H	P	N	V	V	S	N	P	V	V	R	L	Y	E	Q	D	A	L
Template Known Secondary structure			S	S	S				S	S			S	S		S			T	T	S	S			S		T	T	S	T	T	S	S	B		S	S		T	T		S	T	T		S	S							S	S		T	T	S	S		T	T		T	T			S		T	T									T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		801	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880
			634	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	P	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M	A	T	V	R	S	H	D	Q	Y	N	T	T	I	Y	G	M	D	D	R	Y	R	G	V	F	G	Q	R	D	V	V	F	M	S	A	K	Q	A	K	I	C	R	V	K	N	G	E	R	V	N	L	I	A	L	T	P	D	G	K	R	S	S	R	R	M	D	R	L	K
Query Conservation		.
Alig confidence		.																									.	.
Template Conservation																											.	.
Template Sequence		R	M	G	K	K	E	Q	F	P	Y	V	G	T	T	Y	R	L	T	E	H	F	H	T	W	T	.	.	K	H	A	L	L	N	A	I	A	Q	P	E	Q	F	V	E	I	S	E	T	L	A	A	A	K	G	I	N	N	G	D	R	V	T	V	S	S	K	R	G	F	I	R	A	V	A	V	V	T	R	R	L	K
Template Known Secondary structure		T				T	T	T											T	T			T	T	T	G	.	.	G	G	S							S		S														T			T	T								T	T											T	T	S
Template Predicted Secondary structure																											.	.
Template SS confidence
		881	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.			.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.
		713									.	.	.	.	.	.	720	.	.	.					.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Query Sequence		V	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	Y	P	M	A	D	R	S	L	.	.	.	.	V	T	Y	F	P	E	S	N	H	M	L	T	L	D	N	H	D	P	L	S	G	I	P	G	Y	K	S	I	P	V	E	L	E	P	S
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.												.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		P	L	N	V	N	G	Q	Q	V	E	T	V	G	I	P	I	H	W	G	F	E	G	V	A	R	K	G	Y	I	A	N	T	L	T	.	P	N	V	G	D	A	N	S	Q	T	P	E	Y	K	A	F	L	V	N	I	E	K	A
Template Known Secondary structure						T	T														S	S	S	S	S						G	G	G	S		.		S		B		T	T	T			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		959	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.