Job Description P77561 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:30:35 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 658 % Identity 17% Template c1g8jC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:arsenite oxidase; PDBTitle: crystal structure analysis of arsenite oxidase from2 alcaligenes faecalis Resolution 2.03 Å

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		49	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.						.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		C	P	G	C	A	W	P	D	P	K	H	S	A	S	F	D	I	C	E	N	G	A	K	A	I	A	W	E	V	T	D	K	Q	V	N	A	S	F	F	A	E	N	T	V	Q	S	L	L	T	W	G	D	H	E	L	E	A	A	.	.	.	.	.	G	R	L	T	Q	P	L	K	Y	D	A	V	S	D	C	Y	K
Query Conservation																																																												.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.																					.	.	.	.	.											.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.																																				.	.
Template Sequence		P	P	L	A	S	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V	P	D	K	A	C	V	.	.	.	.	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	.	.	A	D	E	W	V
Template Known Secondary structure			T	T	S					G	G	G							T	T	S											T	T		T	.	.	.	.	T	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.																																				.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.					.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.			.	.	130	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.				.	.	.	.	.	.	.	.	150	.					.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.		.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.											.	.	.	.																		.
Query SS confidence																				.	.	.											.	.	.	.																		.
Query Sequence		P	L	S	W	Q	Q	A	F	D	E	I	G	A	R	L	Q	S	Y	.	.	.	S	D	P	N	Q	V	E	F	Y	T	.	.	.	.	S	G	R	T	S	N	E	A	A	F	L	Y	Q	L	F	A	R	.	E	Y	G	S	N	N	F	P	D	C	S	N	M	C	H	E	P	T	S	V	G	L	A	A	S	I	G
Query Conservation																				.	.	.											.	.	.	.																		.
Alig confidence																				.	.	.											.	.	.	.																		.																								.
Template Conservation																																																																														.
Template Sequence		D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	S	D	G	P	Q	G	V	F	F	S	C	F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	.	E	M	G
Template Known Secondary structure																							T		G	G	G										S	T	T															T	T	S								S	S	S	S	S	S			T	T					.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																														.
Template SS confidence
		133	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.		.	210	.
		196	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	K	G	T	V	L	L	E	D	F	E	K	C	D	L	V	I	C	I	G	H	N	P	G	T	N	H	P	R	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	L	R	A	L	V	K	R	G	A	K	M	I	A	I	N	P	L	Q	E	R	G	L	E	R	F	T	A	P	Q
Query Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N	P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S			S		T	T						S						S							S							T						T	T	T	T								S	S	S													S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.									.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	P	F	E	M	L	T	N	S	E	T	Q	L	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	Y	N	V	R	I	G	G	D	M	A	L	L	K	G	M	M	R	L	L	I	E	R	D	D	A	A	S	A	A	G	R	P	S	L	L	D	D	E	F	I	Q	T	H	T	V	G	F	D	E	L	R	R	D	V	L
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	V	A	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L	F	T	Y	V	V	E	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	.	T	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.												G	G	G								T	T																	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																		.		T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
										282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.											.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340		.	.
		331	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.							.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	E	W	K	D	I	E	R	I	S	G	L	S	Q	T	Q	I	A	E	L	A	D	A	Y	A	A	.	.	.	.	.	.	A	E	R	T	I	I	C	Y	G	M	G	I	T	Q	H	E	H	G	T	Q	N	V	Q	Q	L	V	N	L	L	L	M	K	G	N	I	G	K	P	G	A	G	I	C	P	L	R	G
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q	A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G
Template Known Secondary structure																												S			T	T	S	S														T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.						.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.
Query Sequence		H	S	N	V	Q	G	D	R	T	V	G	I	T	E	K	P	S	A	E	F	L	A	.	.	.	.	.	R	L	G	E	R	Y	G	F	T	P	P	H	A	P	G	H	A	A	I	A	S	M	Q	A	I	C	T	G	Q	A	R	A	L	I	C	M	G	G	N	F	A	L	A	M	P	D	R	E	A	S	A	V	P
Query Conservation																								.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T	W	W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A
Template Known Secondary structure		B		B								S		S	S											T			S						S							S	T	T																						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
		480	.	.	.	.		.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.
Query SS confidence							.
Query Sequence		L	T	Q	L	D	.	L	A	V	H	V	A	T	K	L	N	R	S	H	L	L	T	A	R	H	S	Y	I	L	P	V	L	G	R	S	E	I	D	M	Q	K	N	G	A	Q	A	V	T	V	E	D	S	M	S	M	I	H	A	S	R	G	V	L	K	P	A	G	V	M	L	K	S	E	C	A	V	V	A	G	I
Query Conservation							.
Alig confidence							.																	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	.	.	.	H	L	M	L	P	A	A	H	P	G	E	M	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	M	N	G	E	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	.	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I
Template Known Secondary structure		T	T	T	T									S	S		T	G	G	G	G	T		.	.	.	S					B			B	T	T	B			.	.	.	.	.	.	.	.					T	T										S			S	.	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.				.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.									.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.		.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570
		559	560	.	.	.	.	.														.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.												.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		A	Q	A	A	L	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	V	A	W	E	Y	L	V	E	D	Y	D	R	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	D	I	E	A	V	L	P	E	F	A	D	Y	N	Q	R	I	R	.	H	P	G	G	F	H	L	I	N	A	A	A	E	R
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F	R	R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E
Template Known Secondary structure											T	T	T								T		S				S	S								T	T	T	T	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S			B			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		571	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650
																614	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.				.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	W	M	T	P	S	G	K	A	N	F	I	T	S	K	G	L	L	E	D	P	.	.	.	S	S	A	F	N	S	K	L	V	M	A	T	V	R	S	H	D	Q	Y	N	T	T	I	Y	G	M	D	D	R	Y	R	G	V	F	G	Q	R	D	V	V	F	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	P	A	P	W	N	G	L	P	A	T	V	Q	Q	Q	K	D	K	Y	R	F	W	L	N	N	G	R	N	N	E	V	W	Q	T	A	Y	H	D	Q	Y	N	S	L	M	Q	E	R	Y	P	M	A	Y	I	E	M
Template Known Secondary structure		T	T			B			S		S		T	T	S			S	S	T	T													S												S									S	S			T	T		T	T	G	G	G									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		651	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730
		677	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	K	Q	A	K	I	C	R	V	K	N	G	E	R	V	N	L	I	A	L	T	P	D	G	K	R	S	S	R	R	M	D	R	L	K	V	V	I	Y	P	M	A	D	R	S	L	V	T	Y	F	P	E	S	N	H	M	L	T	L	D	N	H	D	P	L	S	G	I	P	G	Y	K	S	I	P	V	E	L	E
Query Conservation
Alig confidence																																																			.	.	.							.									.
Template Conservation																																																			.	.	.							.									.
Template Sequence		N	P	D	D	C	K	Q	L	D	V	T	G	G	D	I	V	E	V	Y	N	D	F	G	S	T	F	A	M	V	Y	P	V	A	E	I	K	R	G	Q	T	F	M	L	F	G	Y	V	N	G	.	.	.	I	Q	G	D	V	T	.	T	D	W	T	D	R	D	I	.	I	P	Y	Y	K	G	T	W	G	D	I	R
Template Known Secondary structure										T			T	T								T	T											T	T	S		T	T							S		S	S	S	.	.	.		G	G	G	G		.		S		B		T	T		.		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.							.									.
Template SS confidence
		731	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.				780	.	.	.	.	.		.	.	.	.	790	.	.	.		.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.
		757	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	S	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	V	G
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		806	.	.