Job Description P37747 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:23 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 362 % Identity 13% Template c2yr6A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:pro-enzyme of l-phenylalanine oxidase; PDBTitle: crystal structure of l-phenylalanine oxidase from psuedomonas sp.p501 Resolution 1.35 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.									.	.	.	.	.	30	.	.	.														.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.							.	.	.	50	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	Y	I	I	V	G	S	G	L	F	G	A	V	C	A	N	E	L	K	K	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	V	L	V	I	E	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	I	G	G	N	A	Y	T	E	D	C	E	.	.	.	.	.	.	G	I	Q	I	H	K	Y	G
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	R	I	A	I	V	G	G	G	A	G	G	I	A	A	L	Y	E	L	G	R	L	A	A	T	L	P	A	G	S	G	I	D	V	Q	I	Y	E	A	D	P	D	S	F	L	H	D	R	A	I	K	V	R	G	L	K	A	G	R	V	S	A	A	L	V	H	N	G	D	P	A	S	G	D	T	I	Y	E	V	G
Template Known Secondary structure										S															T	T	S		T	T												T	T	B	G	G	G							T	T				T	T								S	S		G	G	G		S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.
		55	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.									.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	H	I	F	H	T	N	D	K	Y	I	W	D	Y	V	N	D	L	V	E	F	N	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	S	P	L	A	I	Y	K	D	K	L	F	N	L	P	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	M	R	F	P	E	I	A	G	L	T	W	H	Y	A	S	A	A	F	G	D	A	A	P	I	K	V	F	P	N	P	G	K	V	P	T	E	F	V	F	G	N	R	V	D	R	Y	V	G	S	D	P	K	D	W	E	D	P	D	S	P	T	L	K	V	L	G	V	V	A	G	G	L	V	G	N	P	Q	G	E
Template Known Secondary structure							T	T														T	T		B			B				B	T	T	B							T	T						S	S	S		G	G	G	B	S	S	T	T															T			S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
															96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.																	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	M	N	T	F	H	Q	M	W	G	V	K	D	P	Q	E	A	Q	N	I	I	N	A	Q	K	K	K	Y	G	D	K	V	P	E	N	L	E	E	Q	A	I	S	L	V	G	E	D	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	V	A	M	Y	P	I	A	N	V	D	P	A	K	I	A	A	I	L	N	A	A	T	P	P	A	D	A	L	E	R	I	Q	T	K	Y	W	P	E	F	I	A	Q	Y	D	G	L	T	L	G	A	A	V	R	E	I	V	T	V	A	F	E	K	G	T	L	P	P	V	D	G	V	L	D	V	D	E	S	I	S
Template Known Secondary structure					S	S		B	T	T	B										T		S	S												T										T	T	S	B																T	S	S			G	G	G	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		147	.	.	150	.	.	.	.	.							.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.			.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.																																																			.	.													.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.																																																			.	.													.
Query Sequence		L	I	K	G	Y	T	E	K	Q	.	.	.	.	.	.	W	G	R	S	A	K	E	L	P	A	F	I	I	K	R	I	P	V	R	F	T	F	D	N	N	Y	F	S	D	R	Y	Q	G	I	P	V	G	G	Y	T	K	L	I	E	K	M	L	E	G	V	.	.	D	V	K	L	G	I	D	F	L	K	D	K	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.																																																			.	.													.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.																																																			.	.													.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Y	V	E	L	F	G	R	F	G	F	G	T	G	G	F	K	P	L	Y	N	I	S	L	V	E	M	M	R	L	I	L	W	D	Y	S	N	E	Y	T	L	P	V	T	E	N	V	E	F	I	R	N	L	F	L	K	A	Q	N	V	G	A	G	K	L	V	V	Q	V	R	Q	E	R	V	A	N	A	C	H	S
Template Known Secondary structure												S	S	S	S			G	G	G	T	T	B	B										T	T	T	T						S	S	S	S	T															T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
																		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	L	A	S	K	A	H	R	I	I	Y	T	G	P	I	D	Q	Y	F	D	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	A	S	A	R	A	Q	L	L	S	Y	D	S	H	N	A	V	H	S	E	A	Y	D	F	V	I	L	A	V	P	H	D	Q	L	T	P	I	V	S	R	S	G	F	E	H	A	A	S	Q	N	L	G	D	A	G	L	G	L	E	T	H	T	Y	N	Q	V	Y	P	P	L	L	L	S	D	S	S	P	A	A
Template Known Secondary structure		S	S	S	S										T	T									S						S										S	S	S		S	S								S		G	G	G	T										B		S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
								240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.								.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	R	F	G	A	L	E	Y	R	S	L	K	F	E	T	E	R	H	E	F	P	N	F	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	N	A	V	I	N	F	T	D	A	N	V	P	Y	T	R	I	I	E	H	K	H	F	D	Y	V	E	T	K	H	T	V	V	T	K	E	Y	P	L	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																						.																	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.
Template Sequence		N	A	R	I	V	T	A	I	G	Q	L	H	M	A	R	S	S	K	V	F	A	T	V	K	T	A	A	L	D	Q	P	W	V	P	Q	W	R	G	E	P	I	K	A	V	V	S	D	S	G	L	A	A	S	Y	V	V	P	S	.	P	I	V	A	P	E	Y	S	S	L	L	A	S	Y	T	W	E	D	D	S	T
Template Known Secondary structure											T															G	G	G	G	G	S	T	T	S				T	T									T	T	T	T									.	S					S
Template Predicted Secondary structure																																																												.
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.		.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																															302	.	.	.	.	.	.	.	310								.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	K	V	G	D	E	P	Y	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	R	H	D	F	G	L	Y	P	Q	N	P	A	T	E	T	G	T	A	D	G	M	Y	R	T	M	V	N	R	A	Y	R	Y	V	K	Y	A	G	A	S	N	A	Q	P	W	W	F	Y	Q	L	L	A	E	A	R	T	A	D	R	F	V	F	D	W	T	T	N	K	T	A	G	G	F	K	L	D	M	T	G
Template Known Secondary structure					T	T			S	S	S			S	S	S	S	S																					T	T		S	S													S		S	T	T						T	T	T	S	T	T	S	S	S					B	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		544	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.
Query SS confidence																					.	.
Query Sequence		N	D	N	K	N	M	E	L	F	K	K	Y	R	E	L	A	S	R	E	.	.	D	K	V	I	F	G	G	R	L	A	E	Y	K	Y	Y	D	M	H	Q	V	I	S	A	A	L	Y	Q	V	K	N	I	M
Query Conservation																					.	.
Alig confidence																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	H	Q	S	N	L	C	F	R	Y	H	T	H	A	L	A	A	S	L	D	N	R	F	F	I	A	S	D	S	Y	S	H	L	G	G	W	L	E	G	A	F	M	S	A	L	N	A	V	A	G	L	I
Template Known Secondary structure		T										G	G	G	G	G	G		T	T	T								S	G	G	G	S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		624	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.