Job Description P37747 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:57:23 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 357 % Identity 18% Template c2jb1B_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: B: PDB Molecule:l-amino acid oxidase; PDBTitle: the l-amino acid oxidase from rhodococcus opacus in complex2 with l-alanine Resolution 1.55 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.																	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	Y	I	I	V	G	S	G	L	F	G	A	V	C	A	N	E	L	K	K	L	N	K	K	V	L	V	I	E	K	R	N	H	I	G	G	N	A	Y	T	E	D	C	E	G	I	Q	I	H	K	Y	G	A	H	I	F	H	T	N	D	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																				.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																				.
Template Sequence		H	S	V	V	V	L	G	G	G	P	A	G	L	C	S	A	F	E	L	Q	K	A	G	Y	K	V	T	V	L	E	A	R	T	R	P	G	G	R	V	W	T	A	R	G	G	S	E	E	T	D	.	L	S	G	E	T	Q	K	C	T	F	S	E	G	H	F	Y	N	V	G	A	T	R	I	P	Q	S	H	I	T
Template Known Secondary structure										S													T	T								S	S	S	S	S		T	T						T	T						.	T	T	S									T	T					S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																																																				.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.		.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
		66	.	.	.	70	.	.	.	.					.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.					.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.																							.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.																							.	.	.	.
Query Sequence		W	D	Y	V	N	D	L	V	E	.	.	.	.	F	N	R	F	T	N	S	P	L	A	I	Y	K	D	K	L	F	N	L	P	F	N	.	.	.	.	M	N	T	F	H	Q	M	W	G	V	K	D	P	Q	E	A	Q	N	I	I	N	A	Q	K	K	K	Y	G	D	K	V	P	E	N	L	E	E	Q	A	I	S
Query Conservation											.	.	.	.																							.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	D	Y	C	R	E	L	G	V	E	I	Q	G	F	G	N	Q	N	A	N	T	F	V	N	Y	Q	S	D	T	S	L	S	G	Q	S	V	T	Y	R	A	A	K	A	D	T	F	G	Y	M	S	E	L	L	K	K	A	T	D	Q	G	A	L	D	Q	V	L	S	R	E	D	K	D	A	L	S	E	F	L	S	D
Template Known Secondary structure									T											T	T	S							S	S	T	T	T	T																										T	T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.												.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	V	G	E	D	L	Y	Q	A	L	I	K	G	Y	T	E	K	Q	W	G	R	S	A	K	E	L	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	I	K	R	I	P	V	R	F	T	F	D	N	N	Y	F	S	D	R	Y	Q	G	I	P	V	G	G	Y	T	K	L	I	E	K	M	L	E	G	V	D
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	G	D	L	S	D	D	G	R	Y	L	G	S	S	R	R	G	Y	D	S	E	P	G	A	G	L	N	F	G	T	E	K	K	P	F	A	M	Q	E	V	I	R	S	G	I	G	R	N	F	S	F	D	F	G	Y	D	Q	A	M	M	M	F	T	P	V	G	G	M	D	R	I	Y	Y	A	F	Q	D	R	I	G
Template Known Secondary structure				T			T	T	S						G	G	G								S	T	T																		T	T	T	T	T	G	G	G	G	G		T	T	T	S	S	S					T	T		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
					207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.															.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.											.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	V	K	L	G	I	D	F	L	K	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	L	A	S	K	A	H	R	I	I	Y	T	G	P	I	D	Q	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	Y	R	F	G	A	L	E	Y	R	S	L	K	F	E	T	E	R	H	E	F	P
Query Conservation		.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	D	N	I	V	F	G	A	E	V	T	S	M	K	N	V	S	E	G	V	T	V	E	Y	T	A	G	G	S	K	K	S	I	T	A	D	Y	A	I	C	T	I	P	P	H	L	V	G	R	L	Q	N	N	L	P	G	D	V	L	T	A	L	K	A	A	K	P	S	S	S	G	K	L	G	I	E	Y	S	R	R
Template Known Secondary structure		G	G	G			S	S										T	T									T	T								S						S						T	T	S													T	T														S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	F	Q	G	N	A	V	I	N	F	T	D	A	N	V	P	Y	T	R	I	I	E	H	K	H	F	D	Y	V	E	T	K	H	T	V	V	T	K	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	W	E	T	E	D	R	I	Y	G	G	A	S	N	T	D	K	D	I	S	Q	I	M	F	P	Y	D	H	Y	N	S	D	R	G	V	V	V	A	Y	Y	S	S	G	K	R	Q	E	A	F	E	S	L	T	H	R	Q	R	L	A	K	A	I	A	E	G	S	E	I	H	G	E	K	Y	T	R	D	I	S	S	S
Template Known Secondary structure						T	T				S						S	S	T	T							S	S	S	T	T	S	S											T								T	S																			G	G	G	G	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
							300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	P	L	E	W	K	V	G	D	E	P	Y	Y	P	V	N	D	N	K	N	M	E	L	F	K	K	Y	R	E	L	A	S	R	E	D	K	V	I	F	G	G	R	L	A	E	Y	K	Y	Y	D	M	H	Q	V	I	S	A	A	L	Y	Q	V	K	N	I	M	S
Query Conservation		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	S	G	S	W	R	R	T	K	Y	S	E	S	A	W	A	N	W	A	G	A	T	P	E	Y	E	.	.	.	.	.	.	K	L	L	E	P	V	D	K	I	Y	F	A	G	D	H	L	S	N	A	I	A	W	Q	H	G	A	L	T	S	A	R	D	V	V	T	H	I	H	E
Template Known Secondary structure						G	G	G	S	T	T	T	S	S	S	S												.	.	.	.	.	.			T	S		B	T	T					S	G	G	G	S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.							.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.